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在18个群体中分析猪拷贝数变异及其与基因表达量和复杂性状的相关性

摘要第1-6页
ABSTRACT第6-7页
第一章 文献综述第7-15页
 1 基因多态性和分子遗传标记的发展第7-9页
   ·基因多态性第7页
   ·分子遗传标记的发展第7-9页
     ·传统分子标记的发展第7-9页
     ·拷贝数变异作为新型分子标记第9页
 2 拷贝数变异的发现与研究进展第9-13页
   ·拷贝数变异的形成机制与分类第9-10页
   ·拷贝数变异的检测方法第10-11页
   ·拷贝数变异最新研究进展第11-12页
   ·CNV对基因表达的影响第12-13页
   ·CNV对复杂性状的影响第13页
 3 本研究的目的和意义第13-15页
第二章 研究正文第15-33页
 1 前言第15页
 2 实验材料与方法第15-20页
   ·实验动物第15-16页
   ·实验群体的60K SNP芯片分型第16页
   ·拷贝数变异的检测第16-17页
   ·CNV的real time qPCR验证第17-19页
   ·CNV区域基因的注释和功能分类第19页
   ·统计分析第19-20页
     ·60K SNP芯片判型结果的质量控制和SNP定位第19页
     ·基因组重组率的计算第19页
     ·CNV与基因表达量的关联性分析第19-20页
 3 结果第20-30页
   ·全基因组范围内CNV的鉴别与验证第20-27页
     ·全基因组CNV的鉴别第20-21页
     ·CNVR的分布特点第21-25页
     ·CNVR的qPCR验证结果第25-27页
   ·CNVR的基因注释与功能分析第27-28页
   ·CNV对基因表达的影响第28-29页
   ·CNV对复杂性状遗传变异的影响第29-30页
 4 讨论第30-33页
小结第33-34页
参考文献第34-39页
附表第39-70页
致谢第70页

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