摘要 | 第1-5页 |
Abstract | 第5-7页 |
目录 | 第7-11页 |
缩略词表 | 第11-13页 |
前言 | 第13-18页 |
第一章 A-to-I RNA编辑对抑癌基因ARHGAP26的调控研究 | 第18-39页 |
1 实验主要材料 | 第18-22页 |
·细胞和组织来源 | 第18页 |
·主要试剂 | 第18-19页 |
·主要试剂的配制 | 第19-20页 |
·主要仪器 | 第20-21页 |
·PCR引物及siRNA序列 | 第21-22页 |
2 实验方法 | 第22-30页 |
·细胞培养 | 第22-23页 |
·细胞或组织DNA提取步骤 | 第23-24页 |
·RNA的提取步骤 | 第24页 |
·RNA质量鉴定 | 第24-25页 |
·除去RNA中的基因组DNA | 第25页 |
·反转录步骤 | 第25-26页 |
·PCR扩增含编辑位点的片段 | 第26页 |
·RNA编辑的检测 | 第26页 |
·实时定量PCR | 第26-27页 |
·siRNA转染步骤 | 第27-28页 |
·Western免疫印迹分析 | 第28-30页 |
3 结果 | 第30-38页 |
·多种组织来源的细胞系中普遍存在ARHGAP26 3’UTR的A-to-I RNA编辑现象 | 第30-32页 |
·肿瘤中ARHGAP26 3’UTR编辑水平降低 | 第32-33页 |
·ARHGAP26 3’UTR的A-to-I RNA编辑现象由ADAR1介导 | 第33-35页 |
·A-to-I RNA编辑调控ARHGAP26的表达 | 第35-38页 |
4 小结与讨论 | 第38-39页 |
第二章 A-to-I RNA编辑调控ARHGAP26的机制研究 | 第39-52页 |
1 主要试剂及材料 | 第39-41页 |
·质粒、菌株及细胞来源 | 第39页 |
·主要试剂 | 第39-40页 |
·培养基和主要试剂配制 | 第40页 |
·主要仪器 | 第40-41页 |
2 实验方法 | 第41-45页 |
·质粒构建引物设计 | 第41页 |
·PCR扩增目的片段 | 第41-42页 |
·PCR产物的回收 | 第42页 |
·质粒及片段的双酶切 | 第42页 |
·DNA纯化回收 | 第42-43页 |
·目的基因与载体的连接 | 第43页 |
·转化 | 第43页 |
·克隆的鉴定与保存 | 第43-44页 |
·高纯度质粒的提取 | 第44页 |
·细胞培养 | 第44页 |
·转染 | 第44-45页 |
·荧光活性的检测 | 第45页 |
3 结果 | 第45-50页 |
·ARHGAP26 3’UTR野生型及突变型荧光报告质粒的构建 | 第45-49页 |
·野生型荧光报告质粒的构建 | 第46页 |
·突变型荧光报告质粒的构建 | 第46-48页 |
·荧光报告质粒的鉴定 | 第48-49页 |
·细胞转染与荧光活性的检测 | 第49-50页 |
4 小结与讨论 | 第50-52页 |
第三章 A-to-I RNA编辑对癌基因GLI1的调控机制研究 | 第52-61页 |
1 实验主要材料 | 第52-54页 |
·细胞和组织来源 | 第52页 |
·主要试剂 | 第52-53页 |
·主要试剂的配制 | 第53页 |
·主要仪器 | 第53-54页 |
2 实验方法 | 第54-55页 |
·细胞培养 | 第54页 |
·DNA、RNA的提取 | 第54页 |
·PCR扩增目的基因 | 第54-55页 |
·A-to-I RNA编辑的检测 | 第55页 |
·生物信息学工具 | 第55页 |
3 结果 | 第55-59页 |
·多种组织和细胞系中GLI1编码区R/G位点普遍发生A-to-I RNA编辑 | 第55-57页 |
·肝癌及乳腺癌细胞系中GLI1编码区RNA编辑明显下调或消失 | 第57-58页 |
·GLI1编码区RNA编辑潜在功能影响的生物信息学分析 | 第58-59页 |
4 讨论 | 第59-61页 |
第四章 总结 | 第61-63页 |
·本研究取得的主要成果 | 第61页 |
·本研究的创新之处 | 第61-62页 |
·需要进一步解决的问题 | 第62-63页 |
参考文献 | 第63-70页 |
附录 | 第70-75页 |
致谢 | 第75-76页 |
攻读学位期间发表论文目录 | 第76页 |