| 中文摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-21页 |
| ·WRKY基因家族 | 第12-14页 |
| ·基因组层面上的家族基因的进化 | 第14-16页 |
| ·黄瓜基因组 | 第16页 |
| ·小分子家族 | 第16-20页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第20-21页 |
| 第二章 基因组水平上黄瓜WRKY基因家族的分析 | 第21-48页 |
| ·实验材料及方法 | 第21-24页 |
| ·WRKY序列数据的搜索 | 第21-22页 |
| ·多序列连配,基因结构及系统树的构建 | 第22页 |
| ·芯片数据的分析及相关性的计算 | 第22-23页 |
| ·正选择的检测 | 第23页 |
| ·植物材料,生长环境,处理 | 第23页 |
| ·RNA分离,cDNA全长的克隆,RT-PCR和实时荧光定量PCR | 第23-24页 |
| ·实验结果 | 第24-37页 |
| ·黄瓜基因组WRKY家族基因的鉴定 | 第24-26页 |
| ·多序列连配,基因结构及系统演化分析 | 第26-30页 |
| ·CsWRKY基因在正常生长发育及非生物逆境下的表达模式 | 第30-32页 |
| ·黄瓜、拟南芥间的非生物逆境诱导的直系同源基因对之间的比较分析 | 第32-34页 |
| ·黄瓜、拟南芥group 3 WRKY基因的进化分析 | 第34-37页 |
| ·讨论 | 第37-48页 |
| ·本研究中的CsWRKY的数目是否被低估? | 第37-38页 |
| ·group 3 WRKY基因的扩增与现代复制事件紧密联系 | 第38-39页 |
| ·CsWRKY基因在各种生理过程中扮演着重要的角色 | 第39-41页 |
| ·黄瓜与拟南芥之间直系同源基因功能的保守与分化 | 第41-48页 |
| 第三章 黄瓜MIRNA的鉴定及进化分析 | 第48-61页 |
| ·材料与方法 | 第49页 |
| ·植物材料 | 第49页 |
| ·实验方法 | 第49页 |
| ·结果 | 第49-58页 |
| ·基因组水平上鉴定DCLs,AGOs和RDRs基因家族 | 第49-51页 |
| ·黄瓜的sRNAs库 | 第51-53页 |
| ·黄瓜保守与已知的miRNA | 第53-54页 |
| ·黄瓜特有的miRNA | 第54-55页 |
| ·黄瓜保守miRNA的靶标 | 第55-56页 |
| ·黄瓜新miRNA的靶标 | 第56-57页 |
| ·基于SNP的黄瓜小分子遗传多样性分析 | 第57-58页 |
| ·讨论 | 第58-61页 |
| 结论 | 第61-62页 |
| 参考文献 | 第62-68页 |
| 致谢 | 第68-70页 |
| 附录 | 第70-75页 |
| 博士后工作发表的论文 | 第75页 |
