| 摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-17页 |
| 第一部分 牛5个基因的分离、克隆、SNP检测及其与生产性状的关联分析 | 第17-63页 |
| 第一章 引言 | 第19-26页 |
| ·牛的分子育种 | 第19-20页 |
| ·肉牛QTL定位研究现状 | 第20-21页 |
| ·生长性状的QTL | 第20页 |
| ·肉质性状的QTL | 第20-21页 |
| ·繁殖性状的QTL | 第21页 |
| ·抗病性状的QTL | 第21页 |
| ·等位基因特异性聚合酶链式反应(AS-PCR)研究进展 | 第21-23页 |
| ·牛脂肪代谢中的候选基因概况 | 第23-26页 |
| 第二章 材料与方法 | 第26-37页 |
| ·材料 | 第26-29页 |
| ·DNA样品 | 第26页 |
| ·试验牛群的饲养管理 | 第26-27页 |
| ·RNA样品 | 第27页 |
| ·培养基、酶、试剂盒及菌株 | 第27-28页 |
| ·主要试剂及配制 | 第28-29页 |
| ·主要仪器设备 | 第29页 |
| ·主要分子生物学数据库以及软件 | 第29页 |
| ·方法 | 第29-37页 |
| ·用于候选基因cDNA全长序列的克隆方法 | 第29-33页 |
| ·RACE、RT-PCR产物的纯化、克隆，鉴定和测序 | 第33-34页 |
| ·基因的多态性检测方法 | 第34-36页 |
| ·统计分析 | 第36-37页 |
| 第三章 结果与分析 | 第37-58页 |
| ·总RNA的提取与检测结果 | 第37页 |
| ·基因的克隆和系统发生树分析 | 第37-47页 |
| ·AMAC1 基因的RACE结果，cDNA序列分析和蛋白质的系统发生树 | 第37-39页 |
| ·ACAA1 基因的RACE结果，cDNA序列分析和蛋白质的系统发生树 | 第39-41页 |
| ·ACAA2 基因的RACE结果，cDNA序列分析和蛋白质的系统发生树 | 第41-43页 |
| ·ACAD8 基因的RACE结果，cDNA序列分析和蛋白质的系统发生树 | 第43-45页 |
| ·ACADM基因的RACE结果，cDNA序列分析和蛋白质的系统发生树 | 第45-47页 |
| ·基因多态性检测 | 第47-53页 |
| ·AMAC1 基因的多态性检测 | 第47-49页 |
| ·ACAA1 基因的多态性检测 | 第49-50页 |
| ·ACAA2 基因的多态性检测 | 第50-51页 |
| ·ACAD8 基因的多态性检测 | 第51-52页 |
| ·ACADM基因的多态性检测 | 第52-53页 |
| ·不同基因的单核苷酸多态与性状的关联分析 | 第53-58页 |
| ·AMAC1 基因SNP与生产性状的关联分析 | 第53-54页 |
| ·ACAA1 基因SNP与生产性状的关联分析 | 第54-55页 |
| ·ACAA2 基因SNP与生产性状的关联分析 | 第55-56页 |
| ·ACAD8 基因SNP与生产性状的关联分析 | 第56页 |
| ·ACADM基因SNP与生产性状的关联分析 | 第56-58页 |
| 第四章 讨论 | 第58-62页 |
| ·基因的分离 | 第58页 |
| ·单核苷酸多态检测 | 第58-59页 |
| ·利用生物信息学方法来进行SNP位点的预测 | 第59页 |
| ·测序峰图的应用 | 第59页 |
| ·等位基因特异性PCR | 第59页 |
| ·关于总RNA质量和RACE方法 | 第59-60页 |
| ·关于cDNA的分离和系统发生分析 | 第60页 |
| ·关于基因多态性与生产性状的关联分析 | 第60-62页 |
| 第五章 结论 | 第62-63页 |
| ·主要研究结果 | 第62页 |
| ·本研究的创新点 | 第62-63页 |
| 第二部分 猪肉质性状QTL检测 | 第63-81页 |
| 第六章 引言 | 第65-70页 |
| ·用方差组分分析方法进行QTL定位 | 第65-66页 |
| ·IBD矩阵的构建与求逆 | 第66页 |
| ·群体设计及QTL分析的模型 | 第66-67页 |
| ·QTL阈值的确定 | 第67页 |
| ·QTL的置信区间 | 第67-68页 |
| ·猪肉质性状QTL定位的进展 | 第68-70页 |
| 第七章 材料与方法 | 第70-75页 |
| ·资源群体 | 第70页 |
| ·表型数据 | 第70-71页 |
| ·基因型数据 | 第71页 |
| ·统计分析 | 第71-75页 |
| ·数据转换 | 第71-72页 |
| ·连锁分析 | 第72-74页 |
| ·家系QTL分离的确定 | 第74-75页 |
| 第八章 结果与分析 | 第75-78页 |
| ·关键性阈值 | 第75页 |
| ·QTL检测结果 | 第75页 |
| ·QTL置信区间 | 第75页 |
| ·QTL家系分离 | 第75-78页 |
| 第九章 讨论与结论 | 第78-81页 |
| ·QTL位置 | 第78-79页 |
| ·DRIP | 第78页 |
| ·L~*、a~*和b~* | 第78页 |
| ·PHK和PHI | 第78-79页 |
| ·置信区间和家系分离 | 第79页 |
| ·性状之间的相关对QTL曲线图的影响 | 第79页 |
| ·进一步精细定位的策略 | 第79-81页 |
| 参考文献 | 第81-94页 |
| 附录 | 第94-130页 |
| 致谢 | 第130-131页 |
| 作者简历 | 第131页 |
