| 摘要 | 第1-9页 |
| ABSTRACT | 第9-21页 |
| 前言 | 第21-29页 |
| 第一章 脓毒症单核巨噬细胞特异性结合肽的筛选 | 第29-55页 |
| ·材料 | 第29-33页 |
| ·主要试剂和试剂盒 | 第29-30页 |
| ·试剂配制 | 第30-32页 |
| ·菌株和细胞株 | 第32页 |
| ·主要仪器 | 第32-33页 |
| ·方法 | 第33-38页 |
| ·受限于二硫键环内的噬菌体展示七肽库的滴度测定 | 第33-34页 |
| ·人外周血单核巨噬细胞THP-1的培养 | 第34页 |
| ·人外周血单核巨噬细胞THP-1的诱导分化与处理 | 第34页 |
| ·噬菌体展示环七肽库的筛选(BRASIL法) | 第34-35页 |
| ·噬菌体原种的扩增制备 | 第35-36页 |
| ·细胞ELISA鉴定噬菌体阳性克隆 | 第36-37页 |
| ·测序模板的快速纯化 | 第37页 |
| ·阳性噬菌体克隆的DNA序列测定及氨基酸序列推导 | 第37-38页 |
| ·结果 | 第38-45页 |
| ·噬菌体展示环七肽库的库容鉴定 | 第38页 |
| ·噬菌体肽库的筛选及富集效果分析 | 第38-39页 |
| ·噬菌体阳性克隆的细胞ELISA鉴定 | 第39-42页 |
| ·噬菌体单链DNA电泳鉴定 | 第42页 |
| ·噬菌体单链DNA的序列测定及其氨基酸序列推导 | 第42-45页 |
| ·讨论 | 第45-53页 |
| ·噬菌体展示技术及其在筛选完整细胞中的应用 | 第45-47页 |
| ·完整细胞筛选方法的探讨和选择 | 第47-51页 |
| ·细胞ELISA在阳性噬菌体克隆鉴定中的应用 | 第51-53页 |
| ·小结 | 第53-55页 |
| 第二章 阳性噬菌体展示肽的生物信息学分析 | 第55-93页 |
| ·材料 | 第57-62页 |
| ·计算机信息处理软件和硬件 | 第57页 |
| ·序列数据和数据库 | 第57-58页 |
| ·蛋白质序列分析软件 | 第58-62页 |
| ·方法 | 第62-65页 |
| ·阳性噬菌体展示肽序列的去冗余分析 | 第62页 |
| ·三肽残基的计算及丰度统计 | 第62-63页 |
| ·三肽丰度的显著性分析 | 第63-64页 |
| ·特征性短肽残基的分析 | 第64页 |
| ·包含特征性短肽残基的人类蛋白的筛选 | 第64页 |
| ·分泌蛋白的预测分析 | 第64-65页 |
| ·跨膜蛋白的预测分析 | 第65页 |
| ·结果 | 第65-78页 |
| ·三肽计算及丰度统计 | 第65-66页 |
| ·三肽丰度的显著性分析 | 第66页 |
| ·特征性短肽基序的获得 | 第66-67页 |
| ·包含特征性短肽的人类蛋白的筛选 | 第67-68页 |
| ·分泌蛋白的预测分析 | 第68-74页 |
| ·跨膜蛋白的预测分析 | 第74-77页 |
| ·功能蛋白及相应短肽基序的分析 | 第77-78页 |
| ·讨论 | 第78-92页 |
| ·生物信息学的发展及其重要性 | 第78-80页 |
| ·排列检验(Permutation test)在本研究中的应用 | 第80-82页 |
| ·短肽序列的同源性分析 | 第82-84页 |
| ·序列相似性比较分析 | 第84-88页 |
| ·目的蛋白的分析筛选 | 第88-91页 |
| ·功能蛋白及其表位模拟肽的分析 | 第91-92页 |
| ·小结 | 第92-93页 |
| 第三章 特征性短肽的特异性及生物学活性鉴定 | 第93-109页 |
| ·材料 | 第93-95页 |
| ·主要试剂和试剂盒 | 第93-94页 |
| ·试剂配制 | 第94页 |
| ·菌株和细胞株 | 第94-95页 |
| ·主要仪器 | 第95页 |
| ·方法 | 第95-98页 |
| ·KSFISPL噬菌体与细胞结合的特异性分析 | 第95-97页 |
| ·KSFISPL噬菌体对hTNF-α诱导THP-1细胞释放IL-8的影响 | 第97-98页 |
| ·统计学处理 | 第98页 |
| ·结果 | 第98-103页 |
| ·KSFISPL噬菌体与细胞结合的特异性分析 | 第98-101页 |
| ·KSFISPL噬菌体对hTNF-α诱导THP-1细胞释放IL-8的影响 | 第101-103页 |
| ·讨论 | 第103-108页 |
| ·噬菌体展示肽与细胞的结合情况及特异性分析 | 第103-104页 |
| ·噬菌体展示肽的生物学活性 | 第104-108页 |
| ·小结 | 第108-109页 |
| 结论 | 第109-111页 |
| 参考文献 | 第111-119页 |
| 综述 | 第119-134页 |
| 参考文献 | 第130-134页 |
| 英文缩略词表 | 第134-137页 |
| 研究生毕业论文统计学审稿证明 | 第137-138页 |
| 攻读学位期间成果 | 第138-139页 |
| 致谢 | 第139-141页 |
