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松材线虫(Bursaphelenchus xylophilus)flp基因与香蕉穿孔线虫(Radopholus similes)Rs-eng-1基因的克隆和功能分析

摘要第1-6页
Abstract第6-17页
第一章 文献综述第17-42页
 1 松材线虫及其危害第17-19页
   ·分类地位第17页
   ·形态特征第17-18页
   ·起源与分布第18页
   ·寄主范围及为害症状第18页
   ·防治第18-19页
 2 香蕉穿孔线虫及其危害第19-22页
   ·分类地位第19-20页
   ·形态特征第20页
   ·分布第20页
   ·侵染及危害第20-21页
   ·入侵风险第21-22页
   ·控制与防治第22页
 3 植物寄生线虫FMRF酰胺类肽研究进展第22-33页
   ·FMRF酰胺类肽(FMRFamide-related peptides)第23-24页
   ·植物线虫中FLP肽的多样性第24-26页
   ·植物寄生线虫FLP功能及其研究方法第26-33页
     ·利用免疫化学方法分析FLP功能第26-28页
     ·利用原位杂交技术分析FLP功能第28-30页
     ·利用基因沉默技术分析FLP功能第30-32页
     ·利用RNAi防治植物线虫第32-33页
   ·展望第33页
 4 植物寄生线虫分泌物研究进展第33-40页
   ·植物寄生线虫的寄生方式第33-34页
   ·植物寄生线虫分泌器官及其产物第34-39页
     ·植物寄生线虫食道腺细胞第34-35页
     ·食道腺细胞产生的分泌物及其功能第35-38页
     ·侧器及其分泌物第38页
     ·表皮及其分泌物第38页
     ·直肠腺及其分泌物第38页
     ·非蛋白信号第38-39页
   ·展望第39-40页
 5 立题依据与技术路线第40-42页
   ·立题依据第40-41页
   ·技术路线第41-42页
第二章 松材线虫FLP基因的克隆第42-71页
 1 材料与方法第42-53页
   ·材料第42-43页
     ·供试线虫培养与分离第42页
     ·主要试剂和酶类第42-43页
     ·培养基第43页
     ·常用试剂配制第43页
   ·方法第43-53页
     ·总RNA提取第43-44页
     ·第一链cDNA的合成第44页
     ·FLP基因片段的克隆第44-45页
     ·扩增片段的回收,克隆、测序第45-47页
     ·RACE获得全长cDNA第47-50页
     ·3'RACE与5'RACE PCR产物的回收,克隆测序第50页
     ·DNA的提取第50-51页
     ·PCR扩增全长基因及内含子检测第51页
     ·TAIL-PCR扩增flp基因5'-侧翼序列第51-53页
 2 结果与分析第53-68页
   ·RNA的质量第53-54页
   ·目的基因片段的扩增第54页
   ·目的基因RACE结果与分析第54-58页
   ·目的基因cDNA全长序列及预测的氨基酸序列第58-62页
   ·目的基因内含子检测及5'侧翼序列的获得第62-68页
     ·松材线虫DNA的检测第62页
     ·目的基因内含子检测第62-64页
     ·5'侧翼序列的获得第64-68页
 3 讨论第68-71页
   ·利用RACE扩增全长cDNA序列第68页
   ·FMRF酰胺类肽的选择性剪辑第68-69页
   ·5'-侧翼序列的获得第69-71页
     ·TAIL-PCR第69页
     ·松材线虫flp基因5'-侧翼序列第69-71页
第三章 松材线虫FLP基因的表达分析第71-85页
 1 材料与方法第71-74页
   ·材料第71-72页
     ·供试材料第71页
     ·主要试剂和酶类第71页
     ·溶液配制第71-72页
   ·方法第72-74页
     ·探针合成第72-73页
     ·线虫处理第73页
     ·预杂交、杂交第73页
     ·洗虫与显色检测第73-74页
 2 结果与分析第74-81页
   ·探针检测第74页
   ·原位杂交结果检测第74-81页
     ·Bx-flp-1的原位杂交结果第75页
     ·Bx-flp-2的原位杂交结果第75-76页
     ·Bx-flp-3a的原位杂交结果第76-77页
     ·Bx-flp-3b原位杂交结果第77-78页
     ·Bx-flp-6的原位杂交结果第78-79页
     ·Bx-flp-12的原位杂交结果第79-80页
     ·Bx-flp-14的原位杂交结果第80-81页
 3 讨论第81-85页
第四章 松材线虫FLP基因的功能验证第85-98页
 1 材料与方法第85-91页
   ·材料第85-86页
   ·方法第86-91页
     ·FMRF酰胺类肽基因(Bx-flp)的部分片断PCR扩增第86-87页
     ·载体构建第87-88页
     ·质粒提取第88页
     ·T7引物PCR扩增及产物纯化第88-89页
     ·体外转录合成dsRNA第89页
     ·dsRNA处理线虫第89-90页
     ·QPCR分析第90-91页
     ·RNAi表型分析第91页
 2 结果与分析第91-96页
   ·dsRNA的合成第91-92页
     ·Bx-flp片段的PCR扩增第91页
     ·合成dsRNA第91-92页
   ·QPCR结果分析第92-96页
     ·熔点曲线的确定第92-93页
     ·标准曲线的建立第93-94页
     ·RNAi后转录水平分析第94-95页
     ·靶标基因的RNAi表型鉴定第95-96页
 3 讨论第96-98页
第五章 香蕉穿孔线虫纤维素酶基因RS-ENG-1克隆及特征分析第98-124页
 1 材料和方法第99-109页
   ·材料第99页
   ·方法第99-109页
     ·cDNA的合成第99页
     ·目的基因片段的克隆第99-100页
     ·RACE获得全长cDNA第100-103页
     ·Rs-eng-1基因内含子的扩增第103-104页
     ·Rs-eng-1基因的Southern杂交第104-108页
     ·Rs-eng-1基因表达的原位杂交第108-109页
 2 结果与分析第109-122页
   ·RNA的提取第109页
   ·cDNA全长的获得第109页
   ·目的基因的cDNA全长序列及预测的氨基酸序列第109-112页
   ·目的基因的命名和生物信息学分析第112-114页
   ·系统发育树的构建第114-115页
   ·Rs-eng-1基因内含子扩增结果与分析第115-120页
     ·DNA的提取第115页
     ·内含子的扩增第115-118页
     ·内含子的比对分析第118-120页
   ·Rs-eng-1基因的Southern结果与分析第120-122页
     ·DNA的质量及酶切效果检测第120-121页
     ·Southern结果与分析第121-122页
     ·原位杂交结果与分析第122页
 3 讨论第122-124页
第六章 香蕉穿孔线虫纤维素酶基因RS-ENG-1的原核表达和真核表达第124-140页
 1 材料和方法第124-130页
   ·材料第124-125页
   ·方法第125-130页
     ·Rs-eng-1基因的原核表达第125-128页
     ·Rs-eng-1基因的真核表达第128-130页
 2 结果与分析第130-138页
   ·基因原核表达结果与分析第130-135页
     ·目的片段的鉴定第130-132页
     ·Rs-eng-1基因的原核表达第132-135页
   ·Rs-eng-1真核表达第135-138页
     ·重组酵母表达载体pPIC9K-Rs-eng-1的构建及鉴定第135页
     ·酵母的转化及筛选第135-136页
     ·重组酵母的PCR鉴定第136-137页
     ·表达产物的SDS-PAGE分析第137-138页
     ·表达产物活性分析第138页
 3 讨论第138-140页
第七章 利用RNAI方法研究香蕉穿孔线虫RS-ENG-1基因功能第140-158页
 1 材料与方法第140-145页
   ·材料第140页
   ·方法第140-145页
     ·香蕉穿孔线虫离体RNAi第140-142页
     ·番茄介导的RNA干扰线虫作用第142-145页
 2 结果与分析第145-155页
   ·浸泡体系的建立第145-151页
     ·QPCR检测Rs-eng-1表达量的差异第146页
     ·Rs-eng-1 dsRNA对香蕉穿孔线虫体内纤维素酶活性的影响第146-147页
     ·沉默Rs-eng-1后表型鉴定第147-148页
     ·目的基因RNA干扰载体的构建第148-150页
     ·抗生素浓度的筛选第150页
     ·转基因番茄的获得第150-151页
   ·转基因番茄的鉴定第151-155页
     ·转基因植株的Southern检测第151-152页
     ·转基因植株的RT-PCR检测第152-153页
     ·T1代遗传稳定性检测第153页
     ·接种香蕉穿孔线虫的抗性检测第153-154页
     ·接种南方根结线虫的抗性检测第154-155页
 3 讨论第155-158页
第八章 全文总结第158-161页
参考文献第161-176页
英文缩略表第176-177页
致谢第177-178页
作者简历第178页

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