常用名词注释及缩写 | 第1-6页 |
摘要 | 第6-10页 |
Abstract | 第10-13页 |
引言 | 第13-14页 |
第一部分 cDNA 芯片脑胶质瘤数据分析 | 第14-47页 |
一、cDNA 芯片实验基本情况 | 第14-15页 |
二、实验材料及方法 | 第15-23页 |
三、38 张胶质质瘤芯片实验结果 | 第23-25页 |
四、38 张胶质瘤芯片结果生物信息学分析 | 第25-36页 |
五、讨论 | 第36-41页 |
参考文献 | 第41-47页 |
第二部分:Affymetrix Oligo 芯片脑胶质瘤数据分析 | 第47-87页 |
一、Affymetrix Oligo 芯片实验的基本情况 | 第47-49页 |
二、实验材料及方法 | 第49-57页 |
三、实验结果 | 第57-79页 |
(一) 26 张胶质瘤芯片结果 | 第57-58页 |
(二) 26 张胶质瘤Oligo 表达谱芯片数据分析结果 | 第58-73页 |
(三) cDNA 芯片与Oligo 芯片两次实验得到的12 条重点基因real time PCR 结果 | 第73-79页 |
四、讨论 | 第79-81页 |
参考文献 | 第81-87页 |
第三部分:cDNA 芯片和 Oligo 芯片脑胶质瘤表达谱数据Meta 分析 | 第87-92页 |
一、表达谱数据Meta 分析在医学研究中的意义 | 第87-88页 |
二、表达谱数据Meta 分析的步骤 | 第88页 |
三、表达谱数据Meta 分析在实验中的应用 | 第88-91页 |
(一) 对胶质瘤表达谱实验中的每套数据进行Meta 分析 | 第89-90页 |
(二) Meta 分析结果 | 第90-91页 |
参考文献 | 第91-92页 |
第四部分:应用基因芯片对胶质瘤进行研究的方法总结 | 第92-105页 |
一、方法流程 | 第92-93页 |
(一) 实验设计 | 第92页 |
(二) 芯片实验 | 第92页 |
(三) 获取数据 | 第92-93页 |
(四) 数据分析 | 第93页 |
(五) 数据存储 | 第93页 |
二、应用的软件和网络数据库介绍 | 第93-101页 |
(一) Ensembl 数据库 | 第93-95页 |
(二) LocusLink 数据库 | 第95-96页 |
(三) RefSeq 数据库 | 第96页 |
(四) Gene Ontology 数据库 | 第96-98页 |
(五) KEGG 数据库 | 第98-100页 |
(六) GenMAPP 数据库 | 第100-101页 |
三、总结和展望 | 第101-102页 |
参考文献 | 第102-105页 |
综述 基因芯片结合生物信息学的应用 | 第105-112页 |
参考文献 | 第110-112页 |
致谢 | 第112页 |