驱动蛋白颈链对接过程的模拟研究
| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-8页 |
| 第一章 分子马达以及驱动蛋白简介 | 第8-15页 |
| §1-1 课题背景 | 第8-9页 |
| §1-2 细胞骨架和分子马达 | 第9-12页 |
| §1-3 驱动蛋白简介 | 第12-15页 |
| 1-3-1 驱动蛋白的分子结构 | 第12-13页 |
| 1-3-2 驱动蛋白沿微管运动的方式 | 第13-15页 |
| 第二章 分子动力学原理 | 第15-24页 |
| §2-1 分子模拟概述 | 第15-16页 |
| §2-2 分子力场 | 第16-19页 |
| 2-2-1 分子力场的函数形式 | 第16-19页 |
| 2-2-2 力场参数的来源 | 第19页 |
| §2-3 分子力学能量最小化方法 | 第19-20页 |
| §2-4 分子动力学模拟 | 第20-24页 |
| 2-4-1 分子动力学基本原理 | 第20-22页 |
| 2-4-2 非键相互作用，截断值和步长 | 第22-24页 |
| 第三章 驱动蛋白颈链对接过程的研究 | 第24-42页 |
| §3-1 引言 | 第24-25页 |
| §3-2 颈链拉链区域氨基酸的保守性判断 | 第25-26页 |
| §3-3 颈链拉链区域弱相互作用研究 | 第26-36页 |
| 3-3-1 颈链拉链区的六个齿 | 第26-35页 |
| 3-3-2 拉链机制的动力学过程分析 | 第35-36页 |
| §3-4 驱动蛋白颈链对接的分子动力学模拟 | 第36-42页 |
| 3-4-1 计算模型的选择和建立 | 第36-38页 |
| 3-4-2 分子动力学模拟 | 第38-40页 |
| 3-4-3 模拟结果分析 | 第40-42页 |
| 第四章 结论 | 第42-43页 |
| 参考文献 | 第43-45页 |
| 致谢 | 第45页 |
