| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 第一章 绪论 | 第8-19页 |
| ·研究背景 | 第8-15页 |
| (a) 1.1.1 生物信息学概述 | 第8-9页 |
| (b) 1.1.2 生物信息学数据库介绍 | 第9-12页 |
| (c) 1.1.3 生物信息学工具介绍 | 第12-15页 |
| (d) 1.1.4 植物中的生物信息学研究 | 第15页 |
| ·BHLH 基因家族研究现状 | 第15-19页 |
| (e) 1.2.1 bHLH 结构域的组成 | 第15-16页 |
| (f) 1.2.2 动物中的bHLH 蛋白研究进展 | 第16页 |
| (g) 1.2.3 植物中的bHLH 蛋白研究现状 | 第16-19页 |
| 第二章 BHLH 家族生物信息学分析 | 第19-46页 |
| ·研究目的 | 第19页 |
| ·研究方法 | 第19-21页 |
| (h) 2.2.1 在数据库中搜索水稻bHLH 序列 | 第19-20页 |
| (i) 2.2.2 多序列联配(Multiple sequence alignments) | 第20页 |
| (j) 2.2.3 构建系统发生树 | 第20-21页 |
| (k) 2.2.4 水稻bHLH 基因在水稻染色体组上的定位 | 第21页 |
| (l) 2.2.5 预测miRNA 在水稻和拟南芥bHLH 基因中的靶基因 | 第21页 |
| ·实验结果 | 第21-44页 |
| (m) 2.3.1 确定水稻中bHLH 家族含有至少165 个成员 | 第21-27页 |
| (n) 2.3.2 水稻中bHLH 蛋白的序列联配、残基保守性分析及DNA 结合活性预测 | 第27-32页 |
| (o) 2.3.3 水稻bHLH 基因家族系统发生分析 | 第32-35页 |
| (p) 2.3.4 水稻和拟南芥bHLH 结构域中内含子/外显子结构分析 | 第35-37页 |
| (q) 2.3.5 水稻bHLH 基因家族成员在水稻各染色体上的分布情况 | 第37-39页 |
| (r) 2.3.6 水稻与拟南芥中bHLH 基因家族的比较 | 第39-43页 |
| (s) 2.3.7 在水稻与拟南芥bHLH 基因家族成员中进行miRNA 靶基因的预测 | 第43-44页 |
| ·分析讨论 | 第44-46页 |
| (t) 2.4.1 水稻与拟南芥bHLH 基因家族成员的基本信息 | 第44-45页 |
| (u) 2.4.2 水稻与拟南芥bHLH 基因家族进化分析 | 第45页 |
| (v) 2.4.3 水稻与拟南芥bHLH 基因家族序列保守性与功能分析 | 第45-46页 |
| 第三章 BHLH 家族成员表达活性分析 | 第46-61页 |
| ·研究目的 | 第46页 |
| ·材料方法 | 第46-53页 |
| (w) 3.2.1 植物材料来源 | 第46-47页 |
| (x) 3.2.2 试剂与仪器 | 第47页 |
| (y) 3.2.3 植物组织提取RNA | 第47页 |
| (z) 3.2.4 检测表达活性所用引物的设计 | 第47-52页 |
| (aa) 3.2.5 反转录和PCR | 第52页 |
| (bb) 3.2.6 水稻和拟南芥bHLH 基因其他表达数据的获取 | 第52-53页 |
| ·实验结果 | 第53-59页 |
| (cc) 3.3.1 水稻和拟南芥bHLH 基因的表达模式 | 第53-59页 |
| (dd) 3.3.2 已研究的水稻bHLH 基因的功能 | 第59页 |
| ·分析讨论 | 第59-61页 |
| (ee) 3.4.1 水稻bHLH 基因表达谱 | 第59页 |
| (ff) 3.4.2 水稻bHLH 基因与拟南芥bHLH 基因表达谱的比较 | 第59-60页 |
| (gg) 3.4.3 序列的信息学分析和表达谱研究的意义 | 第60-61页 |
| 第四章 结论与展望 | 第61-63页 |
| 参考文献 | 第63-71页 |
| 致谢 | 第71页 |
