| 第一章 绪论 | 第1-13页 |
| ·概述 | 第7-8页 |
| ·序列比对的生物学背景及研究现状 | 第8-10页 |
| ·序列比对的生物学背景 | 第8-9页 |
| ·序列比对算法的研究现状 | 第9-10页 |
| ·本文主要工作及安排 | 第10-13页 |
| 第二章 生物序列比对 | 第13-33页 |
| ·序列比对的基本问题 | 第13-21页 |
| ·基本概念 | 第13-14页 |
| ·相似性替换矩阵与空位罚分 | 第14-17页 |
| ·目标函数 | 第17-20页 |
| ·调和序列 | 第20-21页 |
| ·序列比对算法及其发展现状 | 第21-31页 |
| ·动态规划算法 | 第21-23页 |
| ·双序列比对 | 第23-25页 |
| ·多序列比对 | 第25-31页 |
| ·本章小结 | 第31-33页 |
| 第三章 基于模拟退火的多序列比对算法 | 第33-43页 |
| ·模拟退火的基本原理 | 第33-35页 |
| ·模拟退火算法的数学模型 | 第33-34页 |
| ·模拟退火算法新解的产生和接受 | 第34页 |
| ·模拟退火的基本思想 | 第34-35页 |
| ·SA-MSA算法设计过程 | 第35-39页 |
| ·新比对的产生 | 第36-37页 |
| ·SA-MSA算法 | 第37-39页 |
| ·算法分析 | 第39页 |
| ·结果分析 | 第39-42页 |
| ·本章小结 | 第42-43页 |
| 第四章 基于星比对和模拟退火的多序列比对算法 | 第43-57页 |
| ·星比对算法基本原理 | 第43-45页 |
| ·MSA-CONSENSUS-STAR算法设计过程 | 第45-51页 |
| ·利用模拟退火算法产生调和序列 | 第45-50页 |
| ·以调和序列为中心，利用星比对算法构造多序列比对 | 第50-51页 |
| ·实验结果分析 | 第51-55页 |
| ·实验结果 | 第51-53页 |
| ·结果分析 | 第53-55页 |
| ·本章小结 | 第55-57页 |
| 第五章 结束语 | 第57-59页 |
| 致谢 | 第59-61页 |
| 参考文献 | 第61-65页 |
| 在校期间科研成果 | 第65页 |