| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 目录 | 第9-11页 |
| 第1章 绪论 | 第11-14页 |
| ·分子动力学 | 第11-12页 |
| ·分子动力学问题的计算机简化 | 第12页 |
| ·论文的基本框架 | 第12-14页 |
| 第2章 程序设计基本框架与开发需求 | 第14-21页 |
| ·程序架构 | 第15-20页 |
| ·晶体建模 | 第15-17页 |
| ·计算模块 | 第17页 |
| ·图形显示模块(OpenGL显示) | 第17-19页 |
| ·动画模块 | 第19页 |
| ·后期处理模块 | 第19-20页 |
| ·开发需求 | 第20-21页 |
| 第3章 OpenGL显示特点与NanoMD显示效果的改进 | 第21-28页 |
| ·OpenGL的工作原理以及builder程序的开发步骤 | 第21-22页 |
| ·显示效果的改进 | 第22-28页 |
| ·增加显示方式 | 第22-23页 |
| ·灯光设置 | 第23-24页 |
| ·原子大小设置 | 第24-26页 |
| ·原子颜色设置 | 第26-27页 |
| ·鼠标放大缩小和平移操作 | 第27-28页 |
| 第4章 表面显示与点线显示 | 第28-38页 |
| ·程序设计的基本原理和实现方法 | 第28-29页 |
| ·已有算法介绍 | 第29-33页 |
| ·传统Verlet列表算法(Verlet table algorithm) | 第29-30页 |
| ·Cell连锁列表算法 | 第30页 |
| ·改进的Verlet-Cell连锁列表算法 | 第30-31页 |
| ·Verlet-Cell的链表数据结构 | 第31-33页 |
| ·程序流程图 | 第33页 |
| ·仿真结果 | 第33-35页 |
| ·结论 | 第35-38页 |
| 第5章 基于OpenGL的三维旋转算法及其在计算化学中的应用 | 第38-46页 |
| ·已有方案的特点分析 | 第38-42页 |
| ·利用虚拟球模仿3D跟踪球 | 第38-39页 |
| ·运用旋转变换的四元数法 | 第39-41页 |
| ·通过旋转视点来旋转物体 | 第41-42页 |
| ·基于视点的三维旋转算法在分子动力学模拟上的程序实现 | 第42-44页 |
| ·显示实例 | 第44-45页 |
| ·结论 | 第45-46页 |
| 第6章 MCBJ工程的实现 | 第46-55页 |
| ·模拟方法 | 第47-48页 |
| ·程序流程图 | 第48页 |
| ·结果与讨论 | 第48-55页 |
| 第7章 单晶铜纳米线的形变行为对温度和速率的依赖关系 | 第55-65页 |
| ·实验部分 | 第55-56页 |
| ·结果与讨论 | 第56-60页 |
| ·拉伸速率对纳米线形变行为的影响 | 第56-57页 |
| ·温度效应对纳米线形变行为的影响 | 第57-60页 |
| ·速率和温度对纳米线机械行为的影响 | 第60-64页 |
| ·应力应变曲线 | 第60-62页 |
| ·径向分布函数 | 第62-63页 |
| ·能量曲线 | 第63-64页 |
| ·结论 | 第64-65页 |
| 结论与展望 | 第65-67页 |
| 致谢 | 第67-68页 |
| 参考文献 | 第68-72页 |
| 攻读硕士学位期间发表的论文及科研成果 | 第72-73页 |
