| 中文摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第一章 论文综述 | 第7-24页 |
| 1. 前言 | 第7页 |
| 2.嗜盐古菌简介 | 第7-9页 |
| 3.嗜盐古菌的分子系统分类学 | 第9-14页 |
| ·嗜盐古菌分类中的分子特征 | 第9-10页 |
| ·蛋白质比较 | 第9页 |
| ·基因组 G+C含量 | 第9-10页 |
| ·嗜盐古菌的系统发育 | 第10-14页 |
| ·分子钟 | 第10-11页 |
| ·系统发育树的分子数据 | 第11-12页 |
| ·系统发育树的构建方法 | 第12页 |
| ·构建系统发育树的分子标准 | 第12-14页 |
| ·rRNA、DNA和蛋白质作为系统发育的指示物 | 第14页 |
| 4. 嗜盐古菌菌质膜上的视蛋白 | 第14-24页 |
| ·细菌视紫红质概述 | 第14-15页 |
| ·氯视紫红质 | 第15-21页 |
| ·氯视紫红质简介 | 第15-16页 |
| ·氯视紫红质的蛋白结构 | 第16-18页 |
| ·氯视紫红质的功能 | 第18页 |
| ·氯视紫红质的光循环 | 第18-20页 |
| ·氯视紫红质蛋白突变体的研究 | 第20-21页 |
| ·嗜盐古菌中的其它视蛋白 | 第21-24页 |
| 第二章 嗜盐古菌hop核心序列分析和系统发育研究 | 第24-52页 |
| 1. 实验材料 | 第24-27页 |
| ·菌株 | 第24页 |
| ·试剂及试剂盒 | 第24-25页 |
| ·酶 | 第25页 |
| ·DNA提取和转化所用溶液 | 第25-26页 |
| ·培养基 | 第26页 |
| ·仪器 | 第26-27页 |
| 2. 实验方法 | 第27-33页 |
| ·嗜盐古菌的培养及保存 | 第27页 |
| ·嗜盐古菌总基因组的获取 | 第27-28页 |
| ·DNA含量及浓度测定(分光光度计法) | 第28页 |
| ·bop核心序列的 PCR扩增 | 第28-29页 |
| ·hop核心序列的 PCR扩增 | 第29页 |
| ·16S rRNA基因序列的 PCR扩增 | 第29-30页 |
| ·目的基因序列的转化 | 第30-32页 |
| ·PCR产物的检测、回收及纯化 | 第30-31页 |
| ·割胶回收产物与T载体的连接 | 第31页 |
| ·感受态细胞的制备 | 第31页 |
| ·质粒重组子的转化 | 第31页 |
| ·兰白斑筛选 | 第31-32页 |
| ·质粒DNA的小量制备 | 第32页 |
| ·PCR法检测目标质粒 | 第32页 |
| ·测序 | 第32页 |
| ·序列分析 | 第32-33页 |
| 3. 实验结果 | 第33-48页 |
| ·bop、hop基因部分片断序列电泳图 | 第33-34页 |
| ·16S rDNA序列电泳图 | 第34页 |
| ·测序结果 | 第34-37页 |
| ·bop基因部分片断序列测序结果 | 第35页 |
| ·hop基因部分片断序列测序结果 | 第35-36页 |
| ·16S rDNA序列列测序结果 | 第36-37页 |
| ·数据库序列号 | 第37-38页 |
| ·嗜盐古菌16S rDNA序列同源性比较 | 第38-40页 |
| ·亲水指数与氨基酸序列间的关系 | 第40-43页 |
| ·嗜盐古菌HR蛋白螺旋C-G序列比较 | 第43-45页 |
| ·嗜盐古菌hop核心序列的碱基组成及嗜好密码子分析 | 第45-47页 |
| ·基于嗜盐古菌BR、HR蛋白核心序列(螺旋C-G)的系统发育分析 | 第47-48页 |
| 4. 讨论 | 第48-50页 |
| ·嗜盐古菌系统发育分析 | 第48页 |
| ·嗜盐古菌中HR蛋白螺旋C一G保守性分析 | 第48-49页 |
| ·hop核心序列的遗传分析 | 第49页 |
| ·hop、bop基因的演化 | 第49-50页 |
| 5. 结语 | 第50-52页 |
| 参考文献 | 第52-58页 |
| 致谢 | 第58页 |