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BoLA基因多态性及其与奶牛乳房炎的关联研究

1 引言第1-36页
   ·前言第15页
   ·MHC 概述第15-24页
     ·MHC 的发现第15-16页
     ·MHC 基因的分类及其编码产物第16-18页
     ·MHC 对抗原的加工和呈递第18-20页
     ·MHC 的其他生物学功能第20-21页
     ·MHC 基因的特点第21页
     ·MHC 的表达调节第21-22页
     ·MHC 的分型方法第22-24页
   ·牛MHC 基因的结构及其研究进展第24-31页
     ·BoLA 的遗传组成第24-25页
     ·BoLA 基因及其编码产物第25-26页
     ·BoLA 等位基因及其编码产物的命名第26-28页
     ·BoLA 与疾病的关系第28-31页
   ·奶牛乳房炎研究进展第31-34页
     ·奶牛乳房炎概述第31页
     ·奶牛乳房炎的发生第31-32页
     ·奶牛乳房炎的诊断第32-33页
     ·奶牛乳房炎的遗传学研究第33页
     ·奶牛乳房炎的防治现状与发展方向第33-34页
   ·本研究的目的意义第34-36页
2 试验材料与方法第36-52页
   ·试验材料第36-40页
     ·血样、奶样的采集第36页
     ·数据的收集第36页
     ·主要试剂及来源第36-37页
     ·菌株和克隆载体第37页
     ·主要试验设备及来源第37-38页
     ·常用溶液及试剂的配制第38-40页
   ·主要试验步骤第40-52页
     ·基因组 DNA 的提取及检测第40-42页
     ·PCR 扩增第42-44页
     ·BoLA-DRA、DQA、DQB 和 DR83-ex0112 基因的 SSCP 分析第44-45页
     ·BoLA-DRA、DQA、DQB 和 DR83-ex0112 基因的克隆测序第45-48页
     ·统计方法与分析软件第48-52页
3 结果与分析第52-90页
   ·BoLA-DRA、DQA、DQB 和 DR83* ex0112 基因位点序列的扩增结果第52-55页
     ·基因组 DNA 的提取与检测结果第52页
     ·PCR 扩增结果第52-53页
     ·BoLA DRA、DQA、DQB 和 DR83~* ex0112 基因序列的鉴定第53-55页
   ·BoLA-DRA、DQA、DQB 和 DR83* ex0112 的PCR-SSCP 分析第55-62页
     ·BoLA-DRA~* ex0112 的 PCR-SSCP 分析第55-56页
     ·BoLA-DQA~* ex0112 的 PCR-SSCP 分析第56-58页
     ·BoLA-DQB~* ex0112 的 PCR-SSCP 分析第58-61页
     ·BoLA-DR83~* ex0112 的 PCR-SSCP 分析第61-62页
   ·BoLA-DRA、DQA、DQB 和 DR83~* ex0112 的测序结果与分析第62-73页
     ·BoLA-DRA~* ex0112 的测序结果及分析第63页
     ·BoLA-DQA~* ex0112 的测序结果及分析第63-65页
     ·BoLA-DQB~* ex0112 的测序结果及分析第65-68页
     ·BoLA-DR83~* ex0112 的测序结果及分析第68-73页
   ·BoLA 基因多态性与奶牛乳房炎的关联分析第73-90页
     ·BoLA-DRA、DQA、DQB 和 DR83~* ex0112 的多态分布第74-81页
     ·BoLA-DRA、DQA、DQB 和 DR83~* ex0112 的Hardy-Weinberg 检验第81页
     ·BoLA-DRA、DQA、DQB 和 DR83 的单体型与乳房炎的关联分析第81-83页
     ·利用 GLM 对 SCS 进行方差分析第83-84页
     ·影响 SCSLAW 性状的各效应的最小二乘均值及差异显著性检验第84-87页
     ·BoLA 基因不同基因型的 SCSLAW 最小二乘效应值及差异显著性检验第87-90页
4 讨论第90-101页
   ·样品的采集、保存以及 DNA 的提取第90-91页
   ·PCR反应体系与反应条件的优化第91-92页
   ·PCR-SSCP 技术影响因素分析第92-93页
   ·克隆测序分析第93-94页
   ·中国荷斯坦牛、中国西门塔尔牛和三河牛 BoLA 基因的多态性分析第94-95页
   ·中国荷斯坦牛、中国西门塔尔牛和三河牛乳房炎发病情况第95页
   ·中国荷斯坦牛、中国西门塔尔牛和三河牛的遗传特征分析第95页
   ·BoLA-DRA、DQA、DQB 和 DR83 基因多态性与奶牛乳房炎关联分析第95-98页
     ·BoLA 四个位点中与奶牛乳房炎有关联的基因、基因型第96-97页
     ·BoLA 四个位点中与奶牛乳房炎有关联的单体型第97-98页
   ·利用 GLM 对奶牛乳房炎的影响因素进行分析第98-100页
     ·品种对奶牛乳房炎的影响第98-99页
     ·年龄对奶牛乳房炎的影响第99页
     ·季节对奶牛乳房炎的影响第99页
     ·泌乳月和胎次对奶牛乳房炎的影响第99页
     ·BoLA 基因型对奶牛乳房炎的影响第99-100页
   ·BoLA-DRA、DQA、DQB 和 DR83 不同基因型与奶牛乳房炎的关系第100-101页
5 结论第101-103页
   ·中国荷斯坦牛、中国西门塔尔牛和三河牛BoLA 基因的多态性第101页
   ·与奶牛乳房炎有关联的BoLA-DRA、DQA、DQB 和DR83 基因、基因型第101页
   ·与奶牛乳房炎有关联的 BoLA-DRA、DQA、DQB 和DR83 基因单体型第101-102页
   ·影响奶牛乳房炎的因素第102页
   ·影响奶牛乳房炎的标记基因型效应第102-103页
致谢第103-104页
参考文献第104-113页
附录第113-121页
作者简介第121页

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