中文摘要 | 第1-6页 |
英文摘要 | 第6-8页 |
第一章 实验设计与数据描述 | 第8-27页 |
摘要 | 第8页 |
1.前言 | 第8-14页 |
·人类基因组概况 | 第8页 |
·SNP介绍 | 第8-9页 |
·SNP的来源 | 第9-10页 |
·12号染色体研究回顾 | 第10-11页 |
·当前SNP分型主要技术 | 第11-13页 |
·影响基因组特征的主要因素和东亚人群语言学结构 | 第13-14页 |
2.材料与方法 | 第14-17页 |
·SNP选择: | 第14-16页 |
·样品选择 | 第16页 |
·实验平台 | 第16页 |
·平台QC | 第16页 |
·实验操作 | 第16-17页 |
·数据解读和质量控制 | 第17页 |
3.结果 | 第17-24页 |
·成功率 | 第17-18页 |
·多态性特征 | 第18-21页 |
·遗传异质性 | 第21-22页 |
·各群体间的遗传学距离与进化关系 | 第22-24页 |
参考文献 | 第24-27页 |
第二章 人类群体连锁不平衡的产生与衰退 | 第27-49页 |
摘要 | 第27页 |
1.前言 | 第27-31页 |
·LD的定义和意义 | 第27页 |
·LD的度量 | 第27-29页 |
·LD的产生和衰退 | 第29-30页 |
·混合群体的连锁不平衡 | 第30-31页 |
2.方法 | 第31-38页 |
·LD度量 | 第31页 |
·平均单倍域长度的计算 | 第31-32页 |
·LD涨落度量 | 第32页 |
·共享LD(LDSHARING)的度量 | 第32页 |
·瓶颈模型阐述LD的产生 | 第32-33页 |
·模型识别基因交流 | 第33-36页 |
·Malecot模型 | 第36-38页 |
3.结果 | 第38-47页 |
·LD延伸长度和物理距离的关系 | 第38-39页 |
·各群体间LD涨落特征显著相关 | 第39-40页 |
·LDSHAIRNG的度量 | 第40-42页 |
·通过模型讨论LD的形成 | 第42-43页 |
·世界人群的总LD的变化趋势 | 第43-44页 |
·维吾尔族遗传物质中的混合的痕迹 | 第44-45页 |
·从LD数据推测群体的历史 | 第45-47页 |
参考文献 | 第47-49页 |
第三章 从萨摩亚群体看隔离群体的连锁不平衡 | 第49-62页 |
摘要 | 第49页 |
1.前言 | 第49-52页 |
·隔离群体中的LD与基因定位 | 第49-51页 |
·萨摩亚简介 | 第51-52页 |
2.材料与方法 | 第52页 |
3.结果 | 第52-59页 |
·与其他群体的遗传距离和遗传联系 | 第52-54页 |
·平均LD延伸长度 | 第54-55页 |
·萨摩亚与其他群体的LDSharign | 第55-57页 |
·萨摩亚样本中缺乏与西方人混合的迹象 | 第57-58页 |
·从基于Malceto方程的模型看萨摩亚群体的历史与LD特征 | 第58-59页 |
参考文献 | 第59-62页 |
第四章 标签位点在不同群体间的可用性 | 第62-71页 |
摘要 | 第62页 |
1.前言 | 第62-64页 |
2.方法 | 第64页 |
·标签位点寻找 | 第64页 |
·标签位点效果评估 | 第64页 |
3.结果 | 第64-69页 |
·标签位点概况 | 第64-66页 |
·签位点的表现 | 第66-69页 |
参考文献 | 第69-71页 |
附录1 实验步骤 | 第71-77页 |
1.Make SUD: | 第71页 |
2.Precip SUD: | 第71-72页 |
3.Resuspend SUD | 第72页 |
4.Make SUD ASE | 第72-73页 |
5.Add MEL | 第73页 |
6.Make PCR | 第73页 |
7.Inoc OPCR | 第73-74页 |
8.Cycle PCR: | 第74页 |
9.Bind PCR: | 第74-75页 |
10.Make HYB | 第75页 |
11.HYB SAM: | 第75-76页 |
12.Image SAM: | 第76-77页 |
附录2 实验数据解读流程 | 第77-80页 |
致谢 | 第80-82页 |