| 中文摘要 | 第1-13页 |
| 英文摘要 | 第13-17页 |
| 1 前言 | 第17-40页 |
| ·植物病毒分子群体遗传学研究现状 | 第17-26页 |
| ·植物病毒种群遗传结构分析方法 | 第17-18页 |
| ·植物病毒种群遗传结构特征 | 第18-21页 |
| ·植物病毒准种的遗传结构 | 第21-23页 |
| ·植物寄主和昆虫介体对病毒种群遗传结构的影响 | 第23-25页 |
| ·研究植物病毒群体遗传学的意义及展望 | 第25-26页 |
| ·水稻条纹病毒分子生物学研究现状 | 第26-38页 |
| ·RSV基因组的结构与功能 | 第28-32页 |
| ·RdRp | 第29页 |
| ·CP、SP | 第29-30页 |
| ·可能编码运动蛋白的基因片段 | 第30-31页 |
| ·RSV编码的其它蛋白 | 第31-32页 |
| ·病毒基因组的复制、转录与表达调控 | 第32-34页 |
| ·RSV变异 | 第34页 |
| ·病害控制的分子生物学策略 | 第34-35页 |
| ·进化上的亲缘关系 | 第35-37页 |
| ·展望 | 第37-38页 |
| ·本研究的目的及意义 | 第38-40页 |
| 2 水稻条纹病毒种群结构及遗传多样性分析 | 第40-75页 |
| ·材料与方法 | 第40-49页 |
| ·材料 | 第40-43页 |
| ·病毒分离物的采集 | 第40-42页 |
| ·供试昆虫 | 第42页 |
| ·植物寄主 | 第42页 |
| ·菌株 | 第42-43页 |
| ·引物 | 第43页 |
| ·试剂 | 第43页 |
| ·方法 | 第43-49页 |
| ·病叶总RNA提取 | 第43-44页 |
| ·反转录-聚合酶链式反应 | 第44页 |
| ·DNA片段的切胶纯化 | 第44页 |
| ·单链构象多态性(SSCP) | 第44-45页 |
| ·PCR产物直接测序 | 第45-46页 |
| ·阳性克隆变异分析 | 第46-49页 |
| ·病毒种群遗传变异分析 | 第49页 |
| ·植物寄主对病毒种群遗传结构的影响 | 第49页 |
| ·结果与分析 | 第49-70页 |
| ·NS2基因遗传多样性分析 | 第49-55页 |
| ·SSCP分析 | 第49-50页 |
| ·序列分析 | 第50-51页 |
| ·遗传多样性 | 第51页 |
| ·纤细病毒属病毒NS2蛋白同源性比较 | 第51-55页 |
| ·CP基因遗传多样性分析 | 第55-63页 |
| ·SSCP分析 | 第55-56页 |
| ·各分离物CP基因变异特征 | 第56-57页 |
| ·CP基因系统进化分析 | 第57-58页 |
| ·遗传多样性 | 第58-63页 |
| ·SP基因遗传多样性分析 | 第63-69页 |
| ·SSCP分析 | 第63-64页 |
| ·序列分析 | 第64-65页 |
| ·遗传多样性 | 第65-69页 |
| ·3个基因遗传多样性分析比较 | 第69页 |
| ·植物寄主对病毒种群遗传结构影响的初步探讨 | 第69-70页 |
| ·讨论 | 第70-75页 |
| ·病毒具有的准种遗传结构特征 | 第70-71页 |
| ·病毒遗传多样性和基因功能间存在的关系 | 第71页 |
| ·病毒遗传进化分析中所揭示的分子流行病学的证据 | 第71-73页 |
| ·云南省RSV种群具有复杂的遗传结构组成 | 第73-74页 |
| ·植物病毒种群遗传结构分析为制定病害防治策略提供依据 | 第74-75页 |
| 3 水稻条纹病毒的基因组结构分析 | 第75-103页 |
| ·材料与方法 | 第76-78页 |
| ·材料 | 第76页 |
| ·病毒分离物 | 第76页 |
| ·方法 | 第76-78页 |
| ·病叶总RNA提取 | 第76页 |
| ·RT-PCR | 第76页 |
| ·测序及序列分析 | 第76-78页 |
| ·结果与分析 | 第78-99页 |
| ·RSV RNA1片段序列分析 | 第78-82页 |
| ·遗传进化分析 | 第78-79页 |
| ·结构域分析 | 第79-82页 |
| ·RSV RNA2片段序列分析 | 第82-86页 |
| ·RSV RNA3片段序列分析 | 第86-90页 |
| ·4个分离物RNA3片段扩增及序列测定 | 第86页 |
| ·7个分离物RNA3不同区域序列同源性比较分析 | 第86-90页 |
| ·RSV RNA4片段序列分析 | 第90-92页 |
| ·7个分离物RNA4片段扩增及序列测定 | 第90页 |
| ·10个分离物RNA4不同区域序列同源性比较分析 | 第90-92页 |
| ·各分离物RNA3和RNA4序列同源性比较分析 | 第92页 |
| ·JHZ、YCX1与日本T分离物全长序列比较 | 第92-94页 |
| ·22个分离物RNA4 IR序列分析 | 第94-99页 |
| ·各分离物同源性比较 | 第94-97页 |
| ·RSV RNA4 IR结构特征分析 | 第97-98页 |
| ·纤细病毒属病毒RNA4 IR同源性分析比较 | 第98-99页 |
| ·讨论 | 第99-103页 |
| ·我国RSV两个分离物全长序列分析 | 第99页 |
| ·RNA2-4片段序列分析，重配变异类型 | 第99-101页 |
| ·RNA4片段序列分析，混合侵染、同源重组、病毒与寄主间的重组 | 第101-102页 |
| ·RNA4 IR序列内形成的发夹结构可能的生物学特征 | 第102-103页 |
| 4 RSV介体灰飞虱种群遗传多样性初步分析 | 第103-111页 |
| ·材料与方法 | 第103-106页 |
| ·材料 | 第103-104页 |
| ·灰飞虱采集 | 第103-104页 |
| ·随机引物的筛选 | 第104页 |
| ·方法 | 第104-106页 |
| ·灰飞虱基因组DNA提取 | 第104-105页 |
| ·扩增条件的优化 | 第105-106页 |
| ·RAPD扩增条带分析 | 第106页 |
| ·结果 | 第106-109页 |
| ·灰飞虱基因组DNA的提取 | 第106页 |
| ·RAPD最佳反应体系的建立 | 第106-107页 |
| ·聚类分析 | 第107-109页 |
| ·讨论 | 第109-111页 |
| 结语 | 第111-112页 |
| 参考文献 | 第112-124页 |
| 致谢 | 第124-125页 |
| 附录1 论文中的缩写词和英汉对照 | 第125-128页 |
| 附录2 本研究使用的试剂与溶液的配制 | 第128-131页 |
| 附录3 攻博期间发表的论文(包括已接受和投稿的) | 第131-133页 |
| 附录4 本研究分析的序列在GenBank中的登录号 | 第133-135页 |
