一.中文摘要 | 第1-9页 |
二.英文摘要 | 第9-12页 |
三.前言 | 第12-15页 |
四.材料与方法 | 第15-25页 |
1.实验材料 | 第15-16页 |
·细胞株 | 第15页 |
·菌株 | 第15页 |
·质粒载体 | 第15页 |
·工具酶和主要试剂 | 第15页 |
·试剂盒 | 第15-16页 |
·主要化学试剂和材料 | 第16页 |
·主要实验仪器 | 第16页 |
2.实验方法 | 第16-25页 |
·常用实验方法 | 第16-18页 |
·连接产物和质粒DNA的转化 | 第16-17页 |
·感受态细胞的制备 | 第16页 |
·转化 | 第16-17页 |
·质粒DNA的小量制备 | 第17页 |
·载体的去磷酸化 | 第17-18页 |
·从琼脂糖凝胶中纯化回收DNA(玻璃奶法) | 第18页 |
·细胞培养 | 第18页 |
·中华仓鼠卵巢细胞cDNA文库的建立 | 第18-24页 |
·中华仓鼠卵巢细胞总RNA的提取 | 第19-20页 |
·RNA质量检测 | 第20页 |
·分离mRNA | 第20-21页 |
·cDNA文库构建 | 第21-24页 |
·cDNA序列分析和密码子分析 | 第24-25页 |
五.结果与分析 | 第25-75页 |
(一) 中华仓鼠卵巢细胞cDNA文库的构建 | 第25-27页 |
·中华仓鼠卵巢细胞总RNA的提取和mRNA的分离纯化 | 第25-26页 |
·中华仓鼠卵巢细胞cDNA文库的建立 | 第26页 |
·中华仓鼠卵巢细胞cDNA文库的鉴定 | 第26-27页 |
(二) 中华仓鼠卵巢细胞cDNA文库核苷酸序列分析 | 第27-53页 |
·以2-18为例确定包含终止密码子的3’端核苷酸序列的阅读框 | 第28-35页 |
·A2为例确定包含起始密码子和终止密码子完整CDS的阅读框架 | 第35-42页 |
·以3-20为例确定不包含起始密码子也不包含终止密码子的阅读框架 | 第42-47页 |
·以4-18为例确定包含起始密码子的cDNA的阅读框架 | 第47-53页 |
(三) GenBank来自中华仓鼠卵巢传代细胞系的cDNA | 第53-56页 |
(四) 中华仓鼠卵巢细胞密码子的使用频率 | 第56-60页 |
·中华仓鼠卵巢细胞密码子使用频率 | 第56-57页 |
·中华仓鼠卵巢细胞与中华仓鼠密码子使用频率比较 | 第57-60页 |
(五).中华仓鼠细胞基因异质性与密码子使用方式的研究 | 第60-70页 |
·对应分析确定密码子使用方式的第一主成分 | 第61-64页 |
·通过基因的偏向指数研究基因异质性 | 第64-67页 |
·中华仓鼠仓鼠卵巢细胞偏爱密码子的确定 | 第67-70页 |
(六) 中华仓鼠卵巢细胞密码子偏向性产生原因初探 | 第70-72页 |
·Nc对GC3s作图初步判断密码子的选择模式产生原因 | 第70-71页 |
·以CDS的GC3s值和旁侧序列G+C含量关系推论突变偏向产生密码子偏向性 | 第71-72页 |
(七) 中华仓鼠卵巢细胞与果蝇,啤酒酵母,大肠杆菌偏爱密码子的比较 | 第72-75页 |
六.讨论 | 第75-85页 |
七.小结 | 第85-86页 |
八.综述 | 第86-100页 |
九.参考文献 | 第100-109页 |
十.附录 | 第109-127页 |
十一.致谢 | 第127页 |