一种基于统计的生物网络模体发现算法
摘要 | 第1-4页 |
Abstract | 第4-7页 |
第一章 绪论 | 第7-11页 |
·研究背景 | 第7-9页 |
·生物网络模体发现的研究现状与动态 | 第9-10页 |
·本文的研究工作和论文结构 | 第10-11页 |
第二章 图论与生物网络简介 | 第11-20页 |
·图的相关定义 | 第11-14页 |
·网络的图表示 | 第11页 |
·图的同构与重叠 | 第11-12页 |
·度与度分布 | 第12-14页 |
·几种随机图模型 | 第14页 |
·生物网络的图模型 | 第14-19页 |
·基因调控网络 | 第15-17页 |
·蛋白质相互作用网络 | 第17页 |
·代谢网络 | 第17-19页 |
·生物网络的计算分析 | 第19-20页 |
第三章 生物网络模体发现算法 | 第20-28页 |
·基本概念和问题描述 | 第20-21页 |
·生物网络模体发现算法的基本步骤 | 第21-24页 |
·产生随机网络 | 第21-23页 |
·子图挖掘 | 第23页 |
·频率分析 | 第23-24页 |
·几种生物网络模体发现算法 | 第24-27页 |
·ESA算法 | 第24-25页 |
·ESU算法 | 第25-26页 |
·基于统计的生物网络模体发现算法 | 第26-27页 |
·生物网络模体发现算法的问题及分析 | 第27-28页 |
第四章 一种基于统计的生物网络模体发现算法 | 第28-50页 |
·问题定义 | 第28-30页 |
·算法框架 | 第30页 |
·子图挖掘 | 第30-37页 |
·非树型子图 | 第30-31页 |
·边扩张的子图挖掘 | 第31-34页 |
·子图的局部比对 | 第34-37页 |
·得分函数的构建 | 第37-39页 |
·基于度分布的随机网络构建 | 第37-38页 |
·得分函数的构造 | 第38-39页 |
·退火算法 | 第39-42页 |
·退火算法简介 | 第39-41页 |
·退火算法在网络模体发现中的应用 | 第41-42页 |
·实验结果及分析 | 第42-50页 |
第五章 总结与展望 | 第50-52页 |
致谢 | 第52-53页 |
参考文献 | 第53-56页 |
研究成果 | 第56-57页 |