| 摘要 | 第1-9页 |
| ABSTRACT | 第9-22页 |
| 第一章 基于OMICS技术研究特应性皮炎的核心蛋白与生物标志物 | 第22-157页 |
| 1 前言 | 第22-62页 |
| ·特应性皮炎的定义、诊断标准与临床表现 | 第22-26页 |
| ·AD按患者年龄分为三个时期 | 第26-27页 |
| ·AD严重影响患者的生活质量 | 第27-28页 |
| ·AD与特应性进程 | 第28-31页 |
| ·AD的流行病学特征 | 第31-35页 |
| ·AD可分为内源性与外源性两类 | 第35-38页 |
| ·AD的遗传机制 | 第38-44页 |
| ·特应性皮炎易感基因的染色体定位 | 第39-40页 |
| ·特应性皮炎候选易感基因 | 第40-44页 |
| ·AD的免疫机制 | 第44-54页 |
| ·Th2细胞分泌的与AD相关的细胞因子 | 第45-48页 |
| ·Th1细胞分泌的细胞因子与AD | 第48-50页 |
| ·AD病理过程是一个系统性的细胞因子与趋化因子参与的免疫炎症反应 | 第50-54页 |
| ·皮肤在AD的病理机制中的重要作用 | 第54-55页 |
| ·用于AD研究的高通量技术 | 第55-59页 |
| ·AD的基因组学研究 | 第57页 |
| ·AD的蛋白质组学研究 | 第57-58页 |
| ·蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)预测 | 第58-59页 |
| ·AD的治疗 | 第59-61页 |
| ·本课题研究内容 | 第61-62页 |
| 2 材料和方法 | 第62-72页 |
| ·材料 | 第62页 |
| ·主要试剂 | 第62页 |
| ·主要仪器 | 第62页 |
| ·方法 | 第62-72页 |
| ·实验样本 | 第62-63页 |
| ·AD皮肤角化细胞的培养 | 第63页 |
| ·成纤维细胞培养 | 第63页 |
| ·血清制备 | 第63页 |
| ·RNA提取 | 第63-64页 |
| ·芯片分析 | 第64-66页 |
| ·cRNA的制备 | 第64-65页 |
| ·杂交 | 第65页 |
| ·GeneChip(?) 人U133 Plus 2.0芯片(Affymetrix芯片) | 第65页 |
| ·GenePlorer Twinchip人-8K芯片 | 第65-66页 |
| ·MARC处理 | 第66-67页 |
| ·2D-PAGE | 第67-68页 |
| ·自流电泳(Free Flow Electrophoresis,FFE) | 第68页 |
| ·LC-MS/MS | 第68-69页 |
| ·质谱分析法:MALDI-TOF分析 | 第69页 |
| ·实时PCR(Real-time PCR)检测 | 第69-70页 |
| ·ELISA分析 | 第70页 |
| ·PSIMAP和PEIMAP算法 | 第70-72页 |
| 3 结果 | 第72-132页 |
| ·微阵列分析 | 第72-94页 |
| ·皮肤活组织样品RNA提取 | 第72页 |
| ·AD患者皮肤组织的Affymetrix芯片与相互作用组分析 | 第72-84页 |
| ·微阵列差异候选基因的聚类分析 | 第72-74页 |
| ·AD患者样本的微阵列研究结果 | 第74-84页 |
| ·程序分析AD患者角化细胞的非正常基因:cDNA芯片与相互作用组分析 | 第84-94页 |
| ·8K human-cDNA芯片分析 | 第84-94页 |
| ·蛋白质组学分析 | 第94-116页 |
| ·自流电泳(FFE)和相互作用蛋白组分析成纤维细胞在AD患者中的作用 | 第94-107页 |
| ·自流电泳结果 | 第94-107页 |
| ·患者血清2D-PAGE/质量光谱测定分析 | 第107-114页 |
| ·MARC处理AD患者血浆样本的2D-PAGE分析 | 第107-114页 |
| ·AD患者树脂分离血清样本的2D-PAGE分析 | 第114-116页 |
| ·相互作用蛋白质组学分析 | 第116-127页 |
| ·Affymetrix芯片分析 | 第117-119页 |
| ·微阵列差异基因的分类 | 第117-118页 |
| ·差异基因的PPI分析结果 | 第118-119页 |
| ·AD角质形成细胞的PPI分析和结果 | 第119-123页 |
| ·AD成纤维细胞FFE结果的PPI分析和结果 | 第123-126页 |
| ·AD血清中相关蛋白的相互反应预测 | 第126-127页 |
| ·对候选基因或蛋白的进一步确认分析 | 第127-132页 |
| ·实时PCR(Real-time PCR)分析 | 第127-130页 |
| ·Affymetrix DNA芯片分析筛选出的候选的SFN与PTPRC基因 | 第127-128页 |
| ·自流电泳(FFE)结果的实时PCR的确认分析 | 第128-130页 |
| ·ELISA结果 | 第130-132页 |
| 4 讨论 | 第132-139页 |
| ·ADe和ADi的Affymetrix DNA芯片分析和相互作用组预测 | 第133-134页 |
| ·AD患者角质形成细胞中失调基因的检测:8K cDNA芯片和相互作用组分析 | 第134-135页 |
| ·AD中成纤维细胞作用的自流电泳和相互作用组分析联合检测 | 第135页 |
| ·AD患者血清的2D-PAGE/质谱仪分析 | 第135-139页 |
| 5 结论 | 第139-140页 |
| 参考文献 | 第140-157页 |
| 第二章 三种小分子化学物对脑型肌酸激酶的结构与功能影响 | 第157-197页 |
| 1 序论 | 第157-160页 |
| 2 材料与方法 | 第160-163页 |
| ·材料 | 第160页 |
| ·CK-BB表达与纯化 | 第160页 |
| ·CK-BB活性测定 | 第160页 |
| ·内源荧光 | 第160页 |
| ·ANS荧光 | 第160-161页 |
| ·圆二色谱 | 第161页 |
| ·等温滴定微量热 | 第161页 |
| ·CK-BB同源模型 | 第161页 |
| ·计算机拟合CK-BB结构及其与小分子结合模式 | 第161-162页 |
| ·聚沉测定 | 第162-163页 |
| 3 结果 | 第163-187页 |
| ·SDS对CK-BB的结构与功能影响研究 | 第163-171页 |
| ·SDS抑制CK-BB的平衡态与动力学过程 | 第163-165页 |
| ·SDS对CK-BB三级结构的影响 | 第165-166页 |
| ·环糊精复活SDS变性的CK-BB | 第166-167页 |
| ·SDS配体与CK-BB结合的微量热学测量 | 第167-168页 |
| ·CK-BB 3D结构的计算机预测和SDS模拟结合 | 第168-171页 |
| ·丙烯酰胺对CK-BB的抑制动力学研究和计算机模拟 | 第171-176页 |
| ·丙烯酰胺对CK-BB的抑制动力学 | 第171-173页 |
| ·丙烯酰胺对CK-BB巯基的烷化 | 第173-174页 |
| ·丙烯酰胺对CK-BB结构的影响 | 第174-175页 |
| ·计算机模型和模拟对接 | 第175-176页 |
| ·Zn2+对CK-BB的变性与聚沉研究 | 第176-187页 |
| ·Zn~(2+)对CK-BB活性的影响 | 第176-178页 |
| ·Zn~(2+)诱导的CK-BB三维结构改变 | 第178-180页 |
| ·Zn~(2+)作用下的CK-BB聚沉 | 第180-182页 |
| ·Zn~(2+)诱导下CK-BB二级结构改变 | 第182-183页 |
| ·甘氨酸和脯氨酸对Zn~(2+)抑制CK-BB的影响 | 第183-184页 |
| ·甘氨酸和脯氨酸对Zn~(2+)诱导的CK-BB聚沉的影响 | 第184页 |
| ·甘氨酸和脯氨酸对CK-BB三级结构复性的影响 | 第184-186页 |
| ·甘氨酸和脯氨酸对CK-BB二级结构复性的影响 | 第186-187页 |
| 4 讨论 | 第187-191页 |
| 5 结论 | 第191-192页 |
| 参考文献 | 第192-197页 |
| 附录一 | 第197-199页 |
| 附录二 | 第199-200页 |
| 攻读学位期间成果 | 第200-202页 |
| 致谢 | 第202-204页 |
| 统计学证明 | 第204页 |
