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毛竹微卫星标记的开发及其在竹类植物基因组分析中的应用

摘要第1-6页
Abstract第6-11页
第一章 文献综述第11-24页
 1 竹类植物现有分子标记的类型和应用第11-13页
   ·RFLP 的应用第11-12页
   ·RAPD 的应用第12页
   ·AFLP 的应用第12-13页
   ·ITS 的应用第13页
   ·SSR 的应用第13页
 2 各类型分子标记的特征比较第13-15页
 3 常用的获得SSR 标记的方法第15-18页
   ·构建和筛选DNA 文库第15-18页
     ·构建全基因组文库第15页
     ·构建微卫星富集文库第15-18页
   ·利用生物信息学方法搜索数据库第18页
   ·利用比较遗传学从近缘物种获得第18页
 4 SSR 标记在植物基因组分析上的应用第18-21页
   ·SSR 在植物染色体上的定位第18-21页
     ·FISH 技术的原理和应用第19-20页
     ·利用FISH 技术在植物染色体上定位SSR第20-21页
   ·SSR 标记在杂种植物亲本和子代基因组分析上的应用第21页
 5 本论文的主要研究内容和研究策略第21-24页
第二章 毛竹SSR 的开发第24-39页
 1 生物信息学方法第24-29页
   ·材料与方法第25-26页
     ·毛竹DNA 的提取第25页
     ·毛竹序列的获得第25页
     ·含有SSR 位点的毛竹序列的筛选第25页
     ·引物的设计和验证第25-26页
     ·测序第26页
   ·结果与分析第26-29页
 2 构建微卫星富集文库方法第29-39页
   ·材料和方法第29-31页
     ·DNA 提取和其他试剂第29页
     ·微卫星富集文库的建立第29-31页
     ·测序第31页
     ·引物的设计和验证第31页
   ·结果与分析第31-34页
     ·毛竹基因组DNA 的酶切第31-32页
     ·接头连接第32页
     ·富集后检测第32页
     ·文库的构建第32-33页
     ·对构建的文库进行点杂交第33页
     ·引物的设计和验证第33-34页
   ·讨论第34-39页
第三章 SSR 标记在竹类植物基因组分析上的应用第39-57页
 1 研究各SSR 标记在毛竹不同变种基因组中的多态性情况第39-42页
   ·材料与方法第40页
     ·材料第40页
     ·实验方法第40页
   ·结果及分析第40-42页
 2 各SSR 标记在刚竹属代表种基因组中的多态性情况第42-46页
   ·材料与方法第42页
     ·材料第42页
     ·实验方法第42页
   ·结果及分析第42-46页
 3 SSR 在毛竹染色体上的物理定位分析第46-50页
   ·材料与方法第46-47页
     ·毛竹根尖的获得第46页
     ·根尖细胞(RTC)染色体制片第46页
     ·制片预处理第46页
     ·探针标记第46-47页
     ·杂交第47页
     ·杂交后洗片第47页
     ·加抗体第47页
     ·用DAPI 处理第47页
     ·镜检第47页
   ·结果与讨论第47-50页
 4 各SSR 标记在杂交竹种子代个体中的多态性情况第50-57页
   ·材料与方法第50-51页
     ·试验材料第50-51页
     ·试验方法第51页
   ·结果与分析第51-52页
     ·毛竹SSR 标记在杂种鉴定中的运用第51页
     ·杂交竹种的SSR 分子标记分析第51-52页
   ·讨论第52-57页
第四章 全文小结第57-59页
参考文献第59-63页
硕士期间参与科研项目及发表的文章第63-64页
致谢第64页

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