| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-8页 |
| 1 绪论 | 第8-12页 |
| ·拟南芥胁迫的研究进展 | 第8-10页 |
| ·抗盐机理 | 第8-10页 |
| ·抗旱机理 | 第10页 |
| ·高通量数据概述 | 第10-11页 |
| ·研究目的意义 | 第11-12页 |
| 2 拟南芥调控网络分析的数据基础 | 第12-15页 |
| ·基因芯片数据 | 第12页 |
| ·蛋白质相互作用数据 | 第12-13页 |
| ·转录调控数据 | 第13页 |
| ·代谢途径的数据 | 第13-14页 |
| ·本章小结 | 第14-15页 |
| 3 拟南芥调控网络的整合及相关分析 | 第15-31页 |
| ·研究内容 | 第15-17页 |
| ·芯片分析原理 | 第16页 |
| ·共表达原理 | 第16-17页 |
| ·芯片分析流程 | 第17-18页 |
| ·芯片预处理 | 第17页 |
| ·计算差异基因 | 第17页 |
| ·计算相关系数 | 第17-18页 |
| ·整合差异表达基因与调控网络数据 | 第18-30页 |
| ·基于AthaMap构建盐胁迫调控网络 | 第19-20页 |
| ·盐胁迫下的调控网络中的模式分析 | 第20-24页 |
| ·整合盐胁迫的调控网络 | 第24-26页 |
| ·盐胁迫下的调控网络结合蛋白质相互作用(PPI)数据分析 | 第26-27页 |
| ·整合盐和干旱胁迫相应的调控网络数据 | 第27-30页 |
| ·本章小结 | 第30-31页 |
| 4 拟南芥代谢途径分析 | 第31-35页 |
| ·代谢途径的显著性分析 | 第31-32页 |
| ·代谢途径之间交互作用(crosstalk)分析 | 第32-33页 |
| ·本章小结 | 第33-35页 |
| 结论 | 第35-36页 |
| 参考文献 | 第36-40页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第40-41页 |
| 致谢 | 第41-42页 |