| 摘要 | 第3-5页 |
| ABSTRACT | 第5-8页 |
| 第1章 前言 | 第12-23页 |
| 1.1 养殖场环境中抗生素的使用 | 第12页 |
| 1.2 多耐药菌的危害 | 第12-13页 |
| 1.3 大肠埃希氏菌 | 第13-14页 |
| 1.4 细菌耐药性研究进展 | 第14-15页 |
| 1.5 产超广谱B-内酰胺酶耐药基因 | 第15页 |
| 1.6 介导耐药基因转移的移动元件 | 第15-18页 |
| 1.7 细菌耐药性检测方法 | 第18-20页 |
| 1.7.1 传统培养法 | 第18-19页 |
| 1.7.2 PCR检测 | 第19-20页 |
| 1.8 测序和比较基因组学 | 第20-21页 |
| 1.9 研究内容和意义 | 第21-23页 |
| 1.9.1 研究内容 | 第21页 |
| 1.9.2 研究意义 | 第21-23页 |
| 第2章 养殖环境中大肠埃希氏菌的多重耐药传递性研究 | 第23-49页 |
| 2.1 材料 | 第23-25页 |
| 2.1.1 菌株来源 | 第23页 |
| 2.1.2 仪器与设备 | 第23-24页 |
| 2.1.3 试剂与培养基 | 第24-25页 |
| 2.2 方法 | 第25-37页 |
| 2.2.1 大肠埃希氏菌的分离与鉴定 | 第25-26页 |
| 2.2.2 K-B测定大肠埃希氏菌的耐药表型 | 第26-27页 |
| 2.2.3 改良CARBA NP法检测细菌产酶活性 | 第27-30页 |
| 2.2.4 耐药基因筛查 | 第30-36页 |
| 2.2.5 细菌耐药性传递实验 | 第36-37页 |
| 2.3 结果 | 第37-47页 |
| 2.3.1 大肠埃希氏菌的分离与鉴定结果 | 第37-38页 |
| 2.3.2 大肠埃希氏菌的耐药表型构成 | 第38-40页 |
| 2.3.3 三重PCR方法可靠性评价结果 | 第40-43页 |
| 2.3.4 耐药基因型筛查结果 | 第43-45页 |
| 2.3.5 碳青霉烯活性测定 | 第45-46页 |
| 2.3.6 接合转移实验结果 | 第46-47页 |
| 2.4 讨论 | 第47-49页 |
| 第3章 多重耐药质粒的测序与基因组学分析 | 第49-78页 |
| 3.1 材料 | 第50-51页 |
| 3.1.1 菌株来源 | 第50页 |
| 3.1.2 仪器与设备 | 第50页 |
| 3.1.3 试剂与培养基 | 第50-51页 |
| 3.2 方法 | 第51-53页 |
| 3.2.1 基因组提取 | 第51-52页 |
| 3.2.2 基因组测序 | 第52页 |
| 3.2.3 质粒序列分析 | 第52-53页 |
| 3.3 结果 | 第53-75页 |
| 3.3.1 质粒P1709008-CTXM和P1710032-CTXM测序和精细注释 | 第53-69页 |
| 3.3.2 纳入分析质粒概况 | 第69-71页 |
| 3.3.3 质粒P1709008-CTXM和P1710032-CTXM的骨架区 | 第71-72页 |
| 3.3.4 P1709008-CTXM多药耐药区MDR-1分析 | 第72-73页 |
| 3.3.5 P1709008-CTXM多药耐药区MDR-2和P1710032-CTXM多药耐药MDR分析 | 第73-75页 |
| 3.4 本章小结 | 第75-78页 |
| 第4章 总结与展望 | 第78-80页 |
| 4.1 总结 | 第78-79页 |
| 4.2 展望 | 第79-80页 |
| 参考文献 | 第80-86页 |
| 硕士期间发表论文 | 第86-87页 |
| 致谢 | 第87-88页 |
