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普通白菜花器官发育相关基因筛选及BrcSOC1和BrcSPL8克隆与表达分析

摘要第8-10页
第一章 文献综述第10-17页
    1 花器官发育研究进展第10-11页
    2 基于高通量测序的数字基因表达谱技术研究进展第11-12页
    3 白菜花发育研究进展第12-13页
    4 SOC1基因研究现状第13-14页
    5 SPL8基因研究现状第14-15页
    6 本研究的目的及意义第15-17页
第二章 基于表达谱测序的普通白菜花器官发育相关基因筛选第17-36页
    1 材料与方法第17-20页
        1.1 植物材料第17-18页
        1.2 总RNA提取及质量检测第18页
        1.3 基因表达谱测序第18页
        1.4 测序结果分析第18-19页
            1.4.1 数据处理及基因功能注释第18页
            1.4.2 差异表达基因筛选第18页
            1.4.3 差异表达基因GO功能显著性富集分析第18页
            1.4.4 差异表达基因KEGG富集分析第18-19页
        1.5 花器官发育相关基因筛选第19页
        1.6 实时荧光定量PCR验证第19-20页
    2 结果与分析第20-33页
        2.1 RNA质量检测第20-21页
        2.2 测序数据统计及质量评估第21-22页
            2.2.1 测序数据统计及比对情况第21页
            2.2.2 测序饱和度分析第21-22页
            2.2.3 cDNA片段随机性检验第22页
        2.3 差异表达基因筛选第22-23页
        2.4 差异表达基因GO功能分析第23-24页
        2.5 差异表达基因KEGG通路分析第24-25页
        2.6 大白菜花发育基因与普通白菜表达谱基因的对应分析第25-29页
        2.7 普通白菜花器官发育相关差异表达基因与拟南芥同源基因的对应分析第29-32页
        2.8 RT-qPCR验证第32-33页
    3 讨论第33-35页
    4 本章结论第35-36页
第三章 BrcSOC1和BrcSPL8基因克隆、表达分析及表达载体构建第36-59页
    1 材料与方法第36-44页
        1.1 基因克隆第36-41页
            1.1.1 总RNA提取第36页
            1.1.2 反转录第36-37页
            1.1.3 引物设计第37页
            1.1.4 PCR扩增第37-38页
            1.1.5 PCR产物回收第38页
            1.1.6 加A第38-39页
            1.1.7 加A后纯化第39页
            1.1.8 连接载体第39页
            1.1.9 转化大肠杆菌第39-40页
            1.1.10 菌液PCR第40页
            1.1.11 菌液测序第40页
            1.1.12 序列分析第40-41页
        1.2 基因表达分析第41页
            1.2.1 材料第41页
            1.2.2 方法第41页
        1.3 超表达载体构建第41-44页
            1.3.1 试验菌株第41页
            1.3.2 质粒提取第41页
            1.3.3 超表达载体构建第41-43页
            1.3.4 质粒PCR第43页
            1.3.5 农杆菌感受态的制备第43-44页
            1.3.6 转化农杆菌第44页
            1.3.7 菌液PCR验证第44页
    2 结果与分析第44-58页
        2.1 基因克隆第44-55页
            2.1.1 PCR产物分析第44-45页
            2.1.2 核苷酸序列分析第45-47页
            2.1.3 氨基酸多重序列比对第47-49页
            2.1.4 同源蛋白亲缘关系分析第49-51页
            2.1.5 蛋白质结构分析第51-55页
        2.2 基因表达分析第55-56页
        2.3 超表达载体构建第56-58页
            2.3.1 超表达载体构建及PCR鉴定第56-57页
            2.3.2 菌液PCR验证第57-58页
    3 讨论第58页
    4 本章结论第58-59页
研究结论、创新点和展望第59-62页
参考文献第62-68页
Abstract第68-69页
攻读硕士期间发表的学术论文第70-72页
致谢第72页

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