摘要 | 第8-10页 |
第一章 文献综述 | 第10-17页 |
1 花器官发育研究进展 | 第10-11页 |
2 基于高通量测序的数字基因表达谱技术研究进展 | 第11-12页 |
3 白菜花发育研究进展 | 第12-13页 |
4 SOC1基因研究现状 | 第13-14页 |
5 SPL8基因研究现状 | 第14-15页 |
6 本研究的目的及意义 | 第15-17页 |
第二章 基于表达谱测序的普通白菜花器官发育相关基因筛选 | 第17-36页 |
1 材料与方法 | 第17-20页 |
1.1 植物材料 | 第17-18页 |
1.2 总RNA提取及质量检测 | 第18页 |
1.3 基因表达谱测序 | 第18页 |
1.4 测序结果分析 | 第18-19页 |
1.4.1 数据处理及基因功能注释 | 第18页 |
1.4.2 差异表达基因筛选 | 第18页 |
1.4.3 差异表达基因GO功能显著性富集分析 | 第18页 |
1.4.4 差异表达基因KEGG富集分析 | 第18-19页 |
1.5 花器官发育相关基因筛选 | 第19页 |
1.6 实时荧光定量PCR验证 | 第19-20页 |
2 结果与分析 | 第20-33页 |
2.1 RNA质量检测 | 第20-21页 |
2.2 测序数据统计及质量评估 | 第21-22页 |
2.2.1 测序数据统计及比对情况 | 第21页 |
2.2.2 测序饱和度分析 | 第21-22页 |
2.2.3 cDNA片段随机性检验 | 第22页 |
2.3 差异表达基因筛选 | 第22-23页 |
2.4 差异表达基因GO功能分析 | 第23-24页 |
2.5 差异表达基因KEGG通路分析 | 第24-25页 |
2.6 大白菜花发育基因与普通白菜表达谱基因的对应分析 | 第25-29页 |
2.7 普通白菜花器官发育相关差异表达基因与拟南芥同源基因的对应分析 | 第29-32页 |
2.8 RT-qPCR验证 | 第32-33页 |
3 讨论 | 第33-35页 |
4 本章结论 | 第35-36页 |
第三章 BrcSOC1和BrcSPL8基因克隆、表达分析及表达载体构建 | 第36-59页 |
1 材料与方法 | 第36-44页 |
1.1 基因克隆 | 第36-41页 |
1.1.1 总RNA提取 | 第36页 |
1.1.2 反转录 | 第36-37页 |
1.1.3 引物设计 | 第37页 |
1.1.4 PCR扩增 | 第37-38页 |
1.1.5 PCR产物回收 | 第38页 |
1.1.6 加A | 第38-39页 |
1.1.7 加A后纯化 | 第39页 |
1.1.8 连接载体 | 第39页 |
1.1.9 转化大肠杆菌 | 第39-40页 |
1.1.10 菌液PCR | 第40页 |
1.1.11 菌液测序 | 第40页 |
1.1.12 序列分析 | 第40-41页 |
1.2 基因表达分析 | 第41页 |
1.2.1 材料 | 第41页 |
1.2.2 方法 | 第41页 |
1.3 超表达载体构建 | 第41-44页 |
1.3.1 试验菌株 | 第41页 |
1.3.2 质粒提取 | 第41页 |
1.3.3 超表达载体构建 | 第41-43页 |
1.3.4 质粒PCR | 第43页 |
1.3.5 农杆菌感受态的制备 | 第43-44页 |
1.3.6 转化农杆菌 | 第44页 |
1.3.7 菌液PCR验证 | 第44页 |
2 结果与分析 | 第44-58页 |
2.1 基因克隆 | 第44-55页 |
2.1.1 PCR产物分析 | 第44-45页 |
2.1.2 核苷酸序列分析 | 第45-47页 |
2.1.3 氨基酸多重序列比对 | 第47-49页 |
2.1.4 同源蛋白亲缘关系分析 | 第49-51页 |
2.1.5 蛋白质结构分析 | 第51-55页 |
2.2 基因表达分析 | 第55-56页 |
2.3 超表达载体构建 | 第56-58页 |
2.3.1 超表达载体构建及PCR鉴定 | 第56-57页 |
2.3.2 菌液PCR验证 | 第57-58页 |
3 讨论 | 第58页 |
4 本章结论 | 第58-59页 |
研究结论、创新点和展望 | 第59-62页 |
参考文献 | 第62-68页 |
Abstract | 第68-69页 |
攻读硕士期间发表的学术论文 | 第70-72页 |
致谢 | 第72页 |