| 缩略词表 | 第7-8页 |
| 中文摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-11页 |
| 前言 | 第13-17页 |
| 一、风湿性心脏病 | 第13-14页 |
| 二、肠道菌群 | 第14-15页 |
| 三、宏基因组测序与生物信息学分析 | 第15-17页 |
| 一、风湿性心脏病患者肠道菌群物种注释 | 第17-36页 |
| 材料和方法 | 第17-24页 |
| 1.1 研究对象 | 第17页 |
| 1.2 纳入和排除标准 | 第17页 |
| 1.3 样本收集 | 第17页 |
| 1.4 样本信息 | 第17-20页 |
| 1.5 主要试剂 | 第20页 |
| 1.6 实验仪器 | 第20-21页 |
| 1.7 实验步骤 | 第21-23页 |
| 1.7.1 DNA的提取 | 第21-22页 |
| 1.7.2 DNA质检 | 第22-23页 |
| 1.8 技术路线 | 第23-24页 |
| 结果与分析 | 第24-36页 |
| 1.9 DNA质检结果 | 第24-26页 |
| 1.10 质控结果 | 第26-30页 |
| 1.11 菌群构成分析 | 第30-32页 |
| 1.12 差异物种分析 | 第32-34页 |
| 1.13 关键菌群的分析 | 第34-36页 |
| 二、风湿性心脏病患者肠道菌群基因的生物信息学分析 | 第36-47页 |
| 2.1 研究对象 | 第36页 |
| 2.2 主要仪器设备 | 第36页 |
| 2.3 数据库 | 第36-37页 |
| 2.4 研究方法与结果 | 第37-47页 |
| 2.4.1 KEGG代谢通路(Pathway)差异分析 | 第37-40页 |
| 2.4.2 COG数据库注释 | 第40-42页 |
| 2.4.3 CAZy数据库注释 | 第42-45页 |
| 2.4.4 ARDB注释 | 第45-47页 |
| 三、讨论 | 第47-52页 |
| 四、结论 | 第52页 |
| 五、参考文献 | 第52-59页 |
| 论文综述 | 第59-71页 |
| 参考文献 | 第67-71页 |
| 附录 | 第71-73页 |
| 攻读学位期间获得的学术成果 | 第73-74页 |
| 致谢 | 第74-75页 |