中文摘要 | 第4-5页 |
abstract | 第5页 |
第一章 引言 | 第9-14页 |
1.1 研究背景 | 第9-11页 |
1.1.1 前列腺癌 | 第9页 |
1.1.2 前列腺癌和共病 | 第9-11页 |
1.2 研究内容 | 第11-12页 |
1.2.1 基因层面分子机理研究 | 第11页 |
1.2.2 基于加权基因共表达网络(WGCNA)的系统生物学研究 | 第11页 |
1.2.3 信号通路层次研究 | 第11-12页 |
1.3 研究目的和意义 | 第12-14页 |
1.3.1 研究目的和意义 | 第12-13页 |
1.3.2 创新性 | 第13-14页 |
第二章 国内外研究现状 | 第14-18页 |
2.1 膀胱癌和前列腺癌的关系 | 第14-15页 |
2.2 糖尿病和前列腺癌的关系 | 第15-16页 |
2.3 心脑血管疾病和前列腺癌的关系 | 第16-18页 |
2.3.1 心血管疾病和前列腺癌的关系 | 第16-17页 |
2.3.2 脑血管疾病和前列腺癌的关系 | 第17-18页 |
第三章 前列腺癌与共病分子机理研究 | 第18-32页 |
3.1 数据来源 | 第18-19页 |
3.2 数据预处理 | 第19页 |
3.3 差异表达基因的筛选和分析 | 第19-32页 |
3.3.1 差异基因的筛选 | 第19-20页 |
3.3.2 通路富集分析 | 第20-30页 |
3.3.3 重叠度分析 | 第30-32页 |
第四章 前列腺癌与共病加权基因共表达网络构建 | 第32-45页 |
4.1 加权共表达网络简介 | 第32-33页 |
4.2 基因共表达网络的构建 | 第33-41页 |
4.2.1 原始芯片数据标准化 | 第33页 |
4.2.2 构建基因间邻接矩阵 | 第33-34页 |
4.2.3 拓扑重叠矩阵构建 | 第34页 |
4.2.4 通过主成分分析寻找模块特征基因 | 第34-35页 |
4.2.5 结合样本信息寻找疾病相关模块 | 第35-38页 |
4.2.6 疾病相关模块基因网络拓扑性质分析 | 第38-41页 |
4.3 差异表达基因映射共表达模块 | 第41-43页 |
4.3.1 构建差异基因-共表达模块重叠网络 | 第41-43页 |
4.3.2 前列腺癌和共病差异基因-共表达模块网络基因重叠度分析 | 第43页 |
4.4 重叠网络分子机理分析 | 第43-45页 |
第五章 结果与展望 | 第45-47页 |
5.1 结论 | 第45-46页 |
5.2 课题展望 | 第46-47页 |
参考文献 | 第47-53页 |
附录 | 第53-84页 |
攻读硕士期间待发表学术论文 | 第84-85页 |
致谢 | 第85-86页 |