| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 目录 | 第8-11页 |
| 图表索引 | 第11-12页 |
| 英文缩略词 | 第12-13页 |
| 1 引言 | 第13-15页 |
| 2 材料与方法 | 第15-26页 |
| 2.1 实验材料 | 第15-20页 |
| 2.1.1 菌株来源 | 第15页 |
| 2.1.2 主要试剂 | 第15-17页 |
| 2.1.3 主要试剂配方 | 第17-18页 |
| 2.1.4 生物信息学软件 | 第18页 |
| 2.1.5 网络服务器 | 第18页 |
| 2.1.6 主要设备及仪器 | 第18-20页 |
| 2.2 实验方法 | 第20-26页 |
| 2.2.1 腹泻标本采集、运送、包装、保存 | 第20页 |
| 2.2.2 志贺菌的分离和鉴定 | 第20-21页 |
| 2.2.3 改良 Kirby-Bauer（K-B）法进行药敏试验 | 第21-22页 |
| 2.2.4 核酸序列分析 | 第22页 |
| 2.2.5 引物设计 | 第22-23页 |
| 2.2.6 PCR 扩增和凝胶电泳 | 第23页 |
| 2.2.7 寡核苷酸探针设计 | 第23页 |
| 2.2.8 地高辛标记志贺菌 cas2 基因的 DNA 探针及标记效率的检测 | 第23-24页 |
| 2.2.9 斑点杂交 | 第24-26页 |
| 3 结果 | 第26-53页 |
| 3.1 志贺菌中 CRISPR 系统的分布 | 第26-30页 |
| 3.1.1 志贺菌 cas1、cas2 基因的分布 | 第26页 |
| 3.1.2 志贺菌 CRISPR 位点的检测 | 第26-30页 |
| 3.1.3 志贺菌 CRISPR 位点的分布 | 第30页 |
| 3.2 CRISPR DB 数据库中志贺菌的 CRISPR 信息 | 第30-34页 |
| 3.3 实验室保存的志贺菌 CRISPR 系统的结构特征 | 第34-43页 |
| 3.3.1 志贺菌 cas1、cas2 基因核苷酸测序结果分析 | 第34页 |
| 3.3.2 志贺菌 CRISPR 位点测序结果分析 | 第34-37页 |
| 3.3.3 志贺菌 CRISPR 系统重复序列的结构特征 | 第37-38页 |
| 3.3.4 志贺菌 CRISPR 系统间隔序列的结构特点 | 第38-43页 |
| 3.4 志贺菌 CRISPR 系统的同源序列 | 第43-46页 |
| 3.4.1 志贺菌的 cas1 基因和 cas2 基因的同源序列 | 第43-44页 |
| 3.4.2 志贺菌 CRISPR 系统的重复序列的同源序列 | 第44页 |
| 3.4.3 志贺菌 CRISPR 系统的间隔序列的同源序列 | 第44-46页 |
| 3.5 志贺菌 CRISPR 系统和耐药关系的初步探索 | 第46-50页 |
| 3.5.1 志贺菌 cas 基因的差异 | 第46-49页 |
| 3.5.2 志贺菌药敏结果 | 第49-50页 |
| 3.6 志贺菌 CRISPR 系统相关基因的斑点杂交 | 第50-53页 |
| 3.6.1 志贺菌 cas2 基因的斑点杂交 | 第50-51页 |
| 3.6.2 志贺菌 CRISPR 系统重复序列的斑点杂交 | 第51-53页 |
| 4 讨论 | 第53-59页 |
| 4.1 志贺菌中 CRISPR 系统的分布 | 第53-54页 |
| 4.1.1 志贺菌中 CRISPR 相关基因 cas1 和 cas2 的分布 | 第53页 |
| 4.1.2 志贺菌中 CRISPR 位点的分布 | 第53-54页 |
| 4.2 志贺菌中 CRISPR 系统重复序列的特点 | 第54-55页 |
| 4.3 志贺菌中 CRISPR 系统间隔序列的特点 | 第55-56页 |
| 4.4 志贺菌中 CRISPR 系统的同源序列 | 第56-57页 |
| 4.5 志贺菌 CRISPR 系统与耐药关系的探讨 | 第57-58页 |
| 4.6 志贺菌 CRISPR 系统相关基因的斑点杂交 | 第58-59页 |
| 5 结论 | 第59-60页 |
| 参考文献 | 第60-63页 |
| 综述 | 第63-77页 |
| 参考文献 | 第72-77页 |
| 个人简历、攻读硕士期间发表论文及研究成果 | 第77-78页 |
| 致谢 | 第78页 |
