| 摘要 | 第3-5页 |
| ABSTRACT | 第5-6页 |
| 1 文献综述 | 第9-14页 |
| 1.1 植物抗病过程 | 第9-11页 |
| 1.2 拟南芥-白粉菌互作机制 | 第11-12页 |
| 1.3 侵入后抗性 | 第12-14页 |
| 1.4 转录组测序技术 | 第14页 |
| 1.5 本研究的目的与意义 | 第14页 |
| 2 材料与方法 | 第14-18页 |
| 2.1 实验材料 | 第14-15页 |
| 2.1.1 白粉菌菌株 | 第14-15页 |
| 2.1.2 植物材料 | 第15页 |
| 2.1.3 主要仪器设备 | 第15页 |
| 2.1.4 主要试剂 | 第15页 |
| 2.2 实验方法 | 第15-18页 |
| 2.2.1 烟草白粉菌接种拟南芥及取样 | 第15页 |
| 2.2.2 拟南芥RNA的提取纯化 | 第15-16页 |
| 2.2.3 转录组文库构建及测序 | 第16页 |
| 2.2.4 差异表达基因的鉴定 | 第16页 |
| 2.2.5 差异表达基因的GO生物功能和Pathway富集性分析 | 第16页 |
| 2.2.6 表达模式聚类分析 | 第16-17页 |
| 2.2.7 qRT-PCR验证 | 第17-18页 |
| 3 结果与分析 | 第18-57页 |
| 3.1 烟草白粉菌表型观察 | 第18-20页 |
| 3.2 测序数据质量情况统计 | 第20-21页 |
| 3.3 参考序列比对分析 | 第21-23页 |
| 3.4 生物学重复相关性分析 | 第23-24页 |
| 3.5 差异表达基因功能注释及富集分析 | 第24-45页 |
| 3.5.1 不同接种时间Col-0和pad4-1 sid2-1的差异表达基因分析 | 第24-34页 |
| 3.5.2 相同接种时间Col-0和pad4-1 sid2-1的差异表达基因分析 | 第34-39页 |
| 3.5.3 Col-0和pad4-1 sid2-1差异基因表达模式的聚类分析 | 第39-45页 |
| 3.6 蛋白激酶相关基因分析 | 第45-48页 |
| 3.7 水杨酸相关基因分析 | 第48-51页 |
| 3.8 苯丙烷类生物合成相关基因分析 | 第51-53页 |
| 3.9 植物-病原互作网络 | 第53-56页 |
| 3.10 qRT-PCR验证 | 第56-57页 |
| 4 讨论与结论 | 第57-64页 |
| 参考文献 | 第64-69页 |
| 致谢 | 第69-70页 |
| 附录 | 第70-73页 |
