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印记基因SNRPN rs220030多态性及亲源差异性甲基化状态的研究

英文缩略词表第1-8页
摘要第8-9页
Abstract第9-10页
月Jl青第10-13页
第一部分:印记基因SNRPN启动子区域SNP位点选择第13-18页
 1 SNP位点的筛选原则第13-14页
 2 SNP位点的筛选方法第14-15页
   ·通过SNPs Finder、HapMap初步筛选位点第14-15页
   ·遗传学多态性参数计算公式第15页
 3 SNP位点筛选结果第15-17页
   ·初筛及同源性检查结果第15-16页
     ·初筛结果第15-16页
     ·同源性检查结果第16页
   ·多态性参数结果第16-17页
 讨论第17-18页
第二部分:rs220030位点Taqman SNP Genotyping分型及结果分析第18-24页
 材料和方法第18-21页
  1 血痕样本的收集制备第18页
  2 实验主要仪器和试剂第18-19页
   ·主要仪器第18-19页
   ·主要试剂第19页
  3 实验方法第19-21页
   ·微量血痕样本DNA抽提第19-20页
   ·DNA样品浓度、OD值检测第20页
   ·TaqMan SNP Genotyping Assay分型第20-21页
  4 分型结果分析方法第21页
   ·rs220030位点频率分布统计第21页
   ·遗传多态性参数的统计分析方法第21页
 结果第21-23页
  1 DNA样品浓度、OD值检测结果第21页
  2 TaqMan分型结果第21-22页
  3 等位基因频率分布结果第22页
  4 遗传多态性参数计算结果第22-23页
 讨论第23-24页
第三部分:建立微量血痕DNA样品重亚硫酸盐修饰法第24-34页
 材料和方法第24-29页
  1 血痕样本的收集制备第24页
  2 实验主要仪器和试剂第24-25页
   ·主要仪器第24-25页
   ·主要试剂第25页
  3 实验方法第25-29页
   ·微量血痕样本DNA抽提第25-26页
   ·DNA样品浓度、OD值检测第26页
   ·1%琼脂糖电泳第26页
   ·重亚硫酸盐修饰微量血痕DNA样品第26-27页
   ·甲基化特异性PCR(MSP)第27页
   ·MSP产物琼脂糖电泳及胶回收测序第27-29页
   ·MSP测序结果与SNRPN DMR原始序列对比分析第29页
 结果第29-32页
  1 微量血痕DNA抽提结果分析第29-31页
   ·1%琼脂糖电泳结果第29-30页
   ·DNA样品浓度、OD值检测结果第30-31页
  2 MSP结果第31-32页
  3 SNRPN DMR MSP测序结果与原始序列对比分析结果第32页
 讨论第32-34页
第四部分:电泳技术分析家系样本rs220030位点多态性及等位基因亲源差异性甲基化状态第34-48页
 材料和方法第34-40页
  1 三联体样本的收集第34页
  2 STR分型第34页
  3 实验主要仪器和试剂第34-36页
   ·主要仪器第34-35页
   ·主要试剂第35-36页
  4 实验方法第36-40页
   ·三联体样本DNA抽提第36页
   ·重亚硫酸盐修饰三联体DNA样品第36页
   ·TaqMan SNP Genotyping Assay对三联体样本rs220030位点分型第36页
   ·引物合成及PCR扩增第36-37页
     ·MS-SSCA引物合成及扩增第36-37页
     ·DGGE引物合成及扩增第37页
   ·PCR扩增产物2.5%琼脂糖凝胶电泳第37页
   ·变性梯度凝胶电泳(DGGE)第37-39页
     ·TBE电泳缓冲液配制第37页
     ·变性剂溶液配制第37-38页
     ·10%梯度凝胶制备及电泳第38-39页
   ·甲基化敏感性单链构象多态性分析(MS-SSCA)第39-40页
     ·甲酰胺加样缓冲液配制第39页
     ·0.5×TBE电泳缓冲液配制第39页
     ·8%丙烯酰胺凝胶制备及电泳第39-40页
 结果第40-46页
  1 三联体样本STR分型结果第40-42页
  2 三联体家系样本rs220030位点TaqMan分型结果第42-43页
  3 PCR扩增产物2.5%琼脂糖凝胶电泳结果第43页
  4 DGGE结果第43-44页
  5 MS-SSCA结果第44-46页
 讨论第46-48页
全文小结第48-49页
参考文献第49-53页
综述第53-61页
 参考文献第58-61页
附录第61-62页
致谢第62-63页

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