英文缩略词表 | 第1-8页 |
摘要 | 第8-9页 |
Abstract | 第9-10页 |
月Jl青 | 第10-13页 |
第一部分:印记基因SNRPN启动子区域SNP位点选择 | 第13-18页 |
1 SNP位点的筛选原则 | 第13-14页 |
2 SNP位点的筛选方法 | 第14-15页 |
·通过SNPs Finder、HapMap初步筛选位点 | 第14-15页 |
·遗传学多态性参数计算公式 | 第15页 |
3 SNP位点筛选结果 | 第15-17页 |
·初筛及同源性检查结果 | 第15-16页 |
·初筛结果 | 第15-16页 |
·同源性检查结果 | 第16页 |
·多态性参数结果 | 第16-17页 |
讨论 | 第17-18页 |
第二部分:rs220030位点Taqman SNP Genotyping分型及结果分析 | 第18-24页 |
材料和方法 | 第18-21页 |
1 血痕样本的收集制备 | 第18页 |
2 实验主要仪器和试剂 | 第18-19页 |
·主要仪器 | 第18-19页 |
·主要试剂 | 第19页 |
3 实验方法 | 第19-21页 |
·微量血痕样本DNA抽提 | 第19-20页 |
·DNA样品浓度、OD值检测 | 第20页 |
·TaqMan SNP Genotyping Assay分型 | 第20-21页 |
4 分型结果分析方法 | 第21页 |
·rs220030位点频率分布统计 | 第21页 |
·遗传多态性参数的统计分析方法 | 第21页 |
结果 | 第21-23页 |
1 DNA样品浓度、OD值检测结果 | 第21页 |
2 TaqMan分型结果 | 第21-22页 |
3 等位基因频率分布结果 | 第22页 |
4 遗传多态性参数计算结果 | 第22-23页 |
讨论 | 第23-24页 |
第三部分:建立微量血痕DNA样品重亚硫酸盐修饰法 | 第24-34页 |
材料和方法 | 第24-29页 |
1 血痕样本的收集制备 | 第24页 |
2 实验主要仪器和试剂 | 第24-25页 |
·主要仪器 | 第24-25页 |
·主要试剂 | 第25页 |
3 实验方法 | 第25-29页 |
·微量血痕样本DNA抽提 | 第25-26页 |
·DNA样品浓度、OD值检测 | 第26页 |
·1%琼脂糖电泳 | 第26页 |
·重亚硫酸盐修饰微量血痕DNA样品 | 第26-27页 |
·甲基化特异性PCR(MSP) | 第27页 |
·MSP产物琼脂糖电泳及胶回收测序 | 第27-29页 |
·MSP测序结果与SNRPN DMR原始序列对比分析 | 第29页 |
结果 | 第29-32页 |
1 微量血痕DNA抽提结果分析 | 第29-31页 |
·1%琼脂糖电泳结果 | 第29-30页 |
·DNA样品浓度、OD值检测结果 | 第30-31页 |
2 MSP结果 | 第31-32页 |
3 SNRPN DMR MSP测序结果与原始序列对比分析结果 | 第32页 |
讨论 | 第32-34页 |
第四部分:电泳技术分析家系样本rs220030位点多态性及等位基因亲源差异性甲基化状态 | 第34-48页 |
材料和方法 | 第34-40页 |
1 三联体样本的收集 | 第34页 |
2 STR分型 | 第34页 |
3 实验主要仪器和试剂 | 第34-36页 |
·主要仪器 | 第34-35页 |
·主要试剂 | 第35-36页 |
4 实验方法 | 第36-40页 |
·三联体样本DNA抽提 | 第36页 |
·重亚硫酸盐修饰三联体DNA样品 | 第36页 |
·TaqMan SNP Genotyping Assay对三联体样本rs220030位点分型 | 第36页 |
·引物合成及PCR扩增 | 第36-37页 |
·MS-SSCA引物合成及扩增 | 第36-37页 |
·DGGE引物合成及扩增 | 第37页 |
·PCR扩增产物2.5%琼脂糖凝胶电泳 | 第37页 |
·变性梯度凝胶电泳(DGGE) | 第37-39页 |
·TBE电泳缓冲液配制 | 第37页 |
·变性剂溶液配制 | 第37-38页 |
·10%梯度凝胶制备及电泳 | 第38-39页 |
·甲基化敏感性单链构象多态性分析(MS-SSCA) | 第39-40页 |
·甲酰胺加样缓冲液配制 | 第39页 |
·0.5×TBE电泳缓冲液配制 | 第39页 |
·8%丙烯酰胺凝胶制备及电泳 | 第39-40页 |
结果 | 第40-46页 |
1 三联体样本STR分型结果 | 第40-42页 |
2 三联体家系样本rs220030位点TaqMan分型结果 | 第42-43页 |
3 PCR扩增产物2.5%琼脂糖凝胶电泳结果 | 第43页 |
4 DGGE结果 | 第43-44页 |
5 MS-SSCA结果 | 第44-46页 |
讨论 | 第46-48页 |
全文小结 | 第48-49页 |
参考文献 | 第49-53页 |
综述 | 第53-61页 |
参考文献 | 第58-61页 |
附录 | 第61-62页 |
致谢 | 第62-63页 |