| 中文摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第1章 绪论 | 第9-15页 |
| 1.1 毒素-抗毒素系统 | 第9-13页 |
| 1.1.1 毒素-抗毒素系统简介 | 第9-10页 |
| 1.1.2 毒素-抗毒素系统的分类 | 第10-11页 |
| 1.1.3 毒素-抗毒素系统的作用机制 | 第11-12页 |
| 1.1.4 毒素-抗毒素系统的研究进展 | 第12-13页 |
| 1.2 ToxI-ToxN复合物 | 第13-14页 |
| 1.3 本文的研究内容 | 第14-15页 |
| 第2章 分子动力学模拟简述 | 第15-21页 |
| 2.1 分子动力学简介 | 第15-16页 |
| 2.2 分子动力学模拟软件 | 第16-17页 |
| 2.3 分子力场 | 第17-18页 |
| 2.4 数据分析方法 | 第18-20页 |
| 2.4.1 主成分分析(PrincipalComponentsAnalysis,PCA) | 第18-19页 |
| 2.4.2 残基对的自由能分解 | 第19页 |
| 2.4.3 残基间的接触分析 | 第19-20页 |
| 2.5 分子动力学模拟应用于蛋白质—RNA复合物研究 | 第20-21页 |
| 第3章 研究对象与方法 | 第21-24页 |
| 3.1 系统的准备 | 第21-22页 |
| 3.2 模拟方法 | 第22页 |
| 3.3 分析方法 | 第22-24页 |
| 第4章 模拟结果与分析 | 第24-33页 |
| 4.1 体系收敛情况 | 第24-25页 |
| 4.2 体系结构稳定性 | 第25-27页 |
| 4.3 总体构象变化 | 第27-28页 |
| 4.4 残基对的自由能分解 | 第28-30页 |
| 4.5 关于ToxI突变体的相关研究 | 第30-32页 |
| 4.6 结果与讨论 | 第32-33页 |
| 第5章 工作总结及展望 | 第33-36页 |
| 参考文献 | 第36-41页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第41-42页 |
| 致谢 | 第42页 |