| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第一章 绪论 | 第10-29页 |
| 1.1 肺结核研究进展 | 第10-15页 |
| 1.1.1 肺结核全球背景 | 第10-11页 |
| 1.1.2 DNA促旋酶 | 第11-12页 |
| 1.1.3 先导和临床阶段的DNAGYRB抑制剂 | 第12-15页 |
| 1.2 计算机辅助药物分子设计方法 | 第15-22页 |
| 1.2.1 基于受体结构的药物设计方法 | 第17-20页 |
| 1.2.2 基于配体小分子的药物分子设计方法 | 第20-22页 |
| 1.3 本文主要研究工作 | 第22-24页 |
| 参考文献 | 第24-29页 |
| 第二章 新型结核分枝杆菌(MTB)GyrB抑制剂喹啉氨基哌啶衍生物的分子模拟与设计 | 第29-55页 |
| 2.1 引言 | 第29-30页 |
| 2.2 材料与方法 | 第30-35页 |
| 2.2.1 数据集 | 第30-32页 |
| 2.2.2 COMFA和COMSIA建模 | 第32-33页 |
| 2.2.3 分子对接 | 第33-34页 |
| 2.2.4 分子动力学模拟 | 第34页 |
| 2.2.5 结合自由能计算与分解 | 第34-35页 |
| 2.2.6 药代动力学和毒性预测 | 第35页 |
| 2.3 结果与讨论 | 第35-51页 |
| 2.3.1 COMFA和COMSIA模型分析 | 第35-38页 |
| 2.3.2 分子对接分析 | 第38-40页 |
| 2.3.3 分子动力学模拟和结合自由能分解 | 第40-44页 |
| 2.3.4 设计新的高效抑制剂 | 第44-51页 |
| 2.4 结论 | 第51-52页 |
| 参考文献 | 第52-55页 |
| 第三章 GyrA/GyrB选择性抑制机理的分子动力学模拟研究 | 第55-68页 |
| 3.1 引言 | 第55-56页 |
| 3.2 材料与方法 | 第56-58页 |
| 3.2.1 初始结构的选择 | 第56页 |
| 3.2.2 分子对接 | 第56-57页 |
| 3.2.3 结合自由能计算与分解 | 第57-58页 |
| 3.3 结果与讨论 | 第58-64页 |
| 3.3.1 分子对接 | 第58-60页 |
| 3.3.2 分子动力学模拟 | 第60页 |
| 3.3.3 能量分析 | 第60-61页 |
| 3.3.4 氨基酸残基能量贡献分析 | 第61-63页 |
| 3.3.5 选择性机理的研究 | 第63-64页 |
| 3.4 结论 | 第64-65页 |
| 参考文献 | 第65-68页 |
| 第四章 定量结构-活性关系研究和预测结核分枝杆菌GyrB抑制剂抑制活性 | 第68-91页 |
| 4.1 引言 | 第68-69页 |
| 4.2 材料与方法 | 第69-79页 |
| 4.2.1 数据集 | 第69-77页 |
| 4.2.2 描述符的计算与选择 | 第77-78页 |
| 4.2.3 模型的建立与验证 | 第78-79页 |
| 4.3 结果与讨论 | 第79-88页 |
| 4.3.1 GFA筛选结果 | 第79-80页 |
| 4.3.2 PLS模型建立与检验 | 第80-88页 |
| 4.4 结论 | 第88-89页 |
| 参考文献 | 第89-91页 |
| 在学期间的研究成果 | 第91-92页 |
| 致谢 | 第92页 |
