| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 1 绪论 | 第10-17页 |
| 1.1 研究背景概述 | 第10-12页 |
| 1.1.1 生物信息学背景 | 第10-11页 |
| 1.1.2 医学背景 | 第11页 |
| 1.1.3 分子生物学背景 | 第11-12页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第12-14页 |
| 1.2.1 新一代测序技术 | 第12-13页 |
| 1.2.2 长链非编码RNA | 第13页 |
| 1.2.3 肝癌相关基因 | 第13-14页 |
| 1.3 论文研究的目的和意义 | 第14-16页 |
| 1.3.1 目的 | 第14-15页 |
| 1.3.2 意义 | 第15-16页 |
| 1.4 论文研究内容与组织结构 | 第16-17页 |
| 1.4.1 研究内容 | 第16页 |
| 1.4.2 组织结构 | 第16-17页 |
| 2 论文研究方法 | 第17-28页 |
| 2.1 论文研究步骤 | 第17-18页 |
| 2.1.1 RNA-Seq测序峰序列组装和校对 | 第17页 |
| 2.1.2 RT-PCR研究11q13.1区域多个RNA-Seq峰是否转录自同一个基因 | 第17页 |
| 2.1.3 GeneRacerTM克隆RNA全长序列 | 第17页 |
| 2.1.4 新克隆的基因序列分析及生物信息学预测 | 第17-18页 |
| 2.2 论文应用平台 | 第18-23页 |
| 2.2.1 新一代测序平台 | 第18-19页 |
| 2.2.2 临床样品 | 第19-20页 |
| 2.2.3 试剂及试剂盒 | 第20-22页 |
| 2.2.4 仪器 | 第22页 |
| 2.2.5 应用的软件 | 第22-23页 |
| 2.3 新一代测序技术的应用 | 第23-27页 |
| 2.4 小结 | 第27-28页 |
| 3 长链非编码RNA在序列比对中的应用 | 第28-43页 |
| 3.1 RNA-Seq在染色体11q13.1区域发现多个相邻的RNA信号峰 | 第28-30页 |
| 3.2 RT-PCR证实11q13.1区域多个RNA-Seq峰转录自同一个基因 | 第30-31页 |
| 3.3 GeneRacerTM克隆RNA全长序列 | 第31-33页 |
| 3.4 新克隆的基因有多个转录本且没有明显的开放阅读框 | 第33-38页 |
| 3.5 新克隆的1ncRNA在ENCODE数据库中没有发现同源基因 | 第38页 |
| 3.6 新克隆的1ncRNA进化保守性分析 | 第38-39页 |
| 3.7 新克隆的1ncRNA二级结构预测 | 第39-42页 |
| 3.8 新克隆的1ncRNA启动子预测和转录结合位点分析 | 第42页 |
| 3.9 小结 | 第42-43页 |
| 4 课题总结及研究展望 | 第43-46页 |
| 4.1 课题讨论及总结 | 第43-44页 |
| 4.2 课题研究展望 | 第44-46页 |
| 参考文献 | 第46-53页 |
| 获得硕士学位期间发表的论文 | 第53-54页 |
| 致谢 | 第54页 |
