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甘油化学酶法合成光学纯环氧氯丙烷关键酶的挖掘与改造

摘要第4-7页
ABSTRACT第7-11页
英文缩略词及中文对照表第17-18页
第一章 绪论第18-41页
    1.1 环氧氯丙烷概述第18-19页
    1.2 手性ECH的合成方法第19-24页
        1.2.1 化学法合成手性ECH第19-20页
        1.2.2 生物酶法合成手性ECH第20-24页
    1.3 环氧化物水解酶第24-34页
        1.3.1 环氧化物水解酶的结构及催化机理第25-26页
        1.3.2 环氧化物水解酶的应用第26-29页
        1.3.3 环氧化物水解酶的开发第29-31页
        1.3.4 环氧化物水解酶的分子改造第31-34页
    1.4 卤醇脱卤酶第34-39页
        1.4.1 卤醇脱卤酶的结构和催化机理第34-35页
        1.4.2 卤醇脱卤酶的筛选与克隆第35-36页
        1.4.3 卤醇脱卤酶的应用第36-38页
        1.4.4 卤醇脱卤酶的分子改造第38-39页
    1.5 本论文的研究研究目的及意义第39-40页
    1.6 本论文的主要研究内容第40-41页
第二章 卤醇脱卤酶的挖掘与表征第41-69页
    2.1 引言第41页
    2.2 实验材料第41-43页
        2.2.1 主要设备与仪器第41-42页
        2.2.2 菌株与质粒第42页
        2.2.3 酶与试剂第42-43页
        2.2.4 引物第43页
    2.3 实验方法第43-49页
        2.3.1 培养基及常用试剂配制第43-44页
        2.3.2 产卤醇脱卤酶菌株的筛选与鉴定第44-45页
        2.3.3 基本分子生物学方法第45页
        2.3.4 卤醇脱卤酶基因的克隆第45-46页
        2.3.5 卤醇脱卤酶大肠杆菌表达载体和工程菌的构建第46页
        2.3.6 卤醇脱卤酶的诱导表达第46页
        2.3.7 氨基酸序列比对与系统进化分析第46-47页
        2.3.8 卤醇脱卤酶的分离纯化第47页
        2.3.9 卤醇脱卤酶酶学性质表征第47-48页
        2.3.10 卤醇脱卤酶酶活测定第48页
        2.3.11 分析方法第48-49页
        2.3.12 卤醇脱卤酶催化 1,3-DCP合成手性ECH第49页
        2.3.13 卤醇脱卤酶催化(S)-CHBE合成(R)-HN第49页
    2.4 结果与讨论第49-67页
        2.4.1 产卤醇脱卤酶的筛选及鉴定第49页
        2.4.2 HheA_(Am)基因的克隆与序列分析第49-50页
        2.4.3 HHDH_(Tm)的基因的克隆与序列分析第50-51页
        2.4.4 其它卤醇脱卤酶的克隆与序列分析第51-53页
        2.4.5 卤醇脱卤酶进化分析第53-54页
        2.4.6 卤醇脱卤酶的表达第54-56页
        2.4.7 重组卤醇脱卤酶的筛选第56页
        2.4.8 重组卤醇脱卤酶的分离纯化第56-57页
        2.4.9 卤醇脱卤酶的酶学性质研究第57-64页
        2.4.10 卤醇脱卤酶催化 1,3-DCP合成手性ECH第64-65页
        2.4.11 卤醇脱卤酶催化拆分ECH合成手性ECH第65-66页
        2.4.12 卤醇脱卤酶催化(S)-CHBE合成(R)-HN第66-67页
    2.5 本章小结第67-69页
第三章 环氧化物水解的酶的挖掘与表征第69-88页
    3.1 引言第69-70页
    3.2 实验材料第70-71页
        3.2.1 菌株及质粒第70页
        3.2.2 酶与试剂第70页
        3.2.3 主要仪器第70页
        3.2.4 引物第70-71页
    3.3 实验方法第71-74页
        3.3.1 培养基第71页
        3.3.2 基因组DNA的提取第71页
        3.3.3 基本分子生物学方法第71页
        3.3.4 环氧化物水解酶基因克隆第71-73页
        3.3.5 重组环氧化物水解酶的诱导表达第73页
        3.3.6 重组环氧化物水解酶的分离纯化第73页
        3.3.7 分析方法第73页
        3.3.8 环氧化物水解酶酶活测定第73页
        3.3.9 重组环氧化物水解酶酶学性质表征第73页
        3.3.10 重组细胞催化拆分合成手性ECH的研究第73-74页
    3.4 结果与讨论第74-87页
        3.4.1 AmEH基因的克隆及序列分析第74-76页
        3.4.2 AmEH在大肠杆菌中的异源表达第76-77页
        3.4.3 PlEH1和PlEH2基因克隆与序列分析第77-78页
        3.4.4 PlEH1和PlEH2的诱导表达第78-79页
        3.3.5 重组环氧化物水解酶的筛选第79-80页
        3.4.6 重组环氧化物水解酶分离纯化第80页
        3.4.7 环氧化物水解酶酶学性质研究第80-86页
        3.4.8 环氧化物水解酶拆分外消旋ECH第86-87页
    3.5 本章小结第87-88页
第四章 卤醇脱卤酶立体选择性的分子改造研究第88-105页
    4.1 引言第88-89页
    4.2 材料第89-90页
        4.2.1 菌株与质粒第89页
        4.2.2 酶与试剂第89页
        4.2.3 主要仪器第89页
        4.2.4 引物第89-90页
    4.3 实验方法第90-92页
        4.3.1 同源建模第90-91页
        4.3.2 分子对接第91页
        4.3.3 饱和突变文库的构建第91页
        4.3.4 高通量筛选模型的建立与突变文库的筛选第91-92页
        4.3.5 卤醇脱卤酶和卤醇脱卤酶突变体的表达与分离纯化第92页
        4.3.6 酶活测定第92页
        4.3.7 酶的动力学参数测定第92页
        4.3.8 分析方法第92页
        4.3.9 突变体全细胞催化 1,3-DCP合成手性ECH第92页
    4.4 结果与讨论第92-103页
        4.4.1 卤醇脱卤酶同源建模第92-94页
        4.4.2 卤醇脱卤酶突变位点的选择第94-96页
            4.4.2.1 Hhe C立体选择性突变位点的选择第94-96页
        4.4.3 突变文库的构建及筛选第96-97页
        4.4.4 卤醇脱卤酶及其突变体的分离纯化第97-99页
        4.4.5 动力学参数的测定第99-100页
        4.4.6 分子模拟对接研究第100-103页
        4.4.7 突变体催化 1,3-DCP不对称脱卤第103页
    4.5 本章小结第103-105页
第五章 环氧化物水解酶立体选择性及活性的分子改造研究第105-120页
    5.1 引言第105页
    5.2 材料第105-106页
        5.2.1 菌株与质粒第105页
        5.2.2 酶与试剂第105-106页
        5.2.3 主要仪器第106页
        5.2.4 引物第106页
    5.3 方法第106-108页
        5.3.1 同源建模第106-107页
        5.3.2 分子对接第107页
        5.3.3 饱和突变文库的构建第107页
        5.3.4 高通量筛选模型的建立与突变文库的筛选第107-108页
        5.3.5 AmEH及其突变体的表达与分离纯化第108页
        5.3.6 酶活测定第108页
        5.3.7 分析方法第108页
        5.3.8 酶动力学参数测定第108页
        5.3.9 全细胞催化拆分ECH第108页
    5.4 结果与分析第108-118页
        5.4.1 环氧化物水解酶同源建模与结构分析第108-109页
        5.4.2 分子对接与突变位点的选择第109-111页
        5.4.3 突变文库的构建与筛选第111-112页
        5.4.4 环氧化物水解酶和突变体的纯化第112-114页
        5.4.5 动力学参数的测定第114页
        5.4.6 分子模拟对接研究第114-116页
        5.4.7 突变体拆分外消旋ECH第116-118页
    5.5 本章小结第118-120页
第六章 双酶体系的构建第120-132页
    6.1 引言第120页
    6.2 实验材料第120-121页
        6.2.1 菌株与质粒第120-121页
        6.2.2 酶与试剂第121页
        6.2.3 主要设备及仪器第121页
        6.2.4 引物第121页
    6.3 实验方法第121-124页
        6.3.1 共表达质粒的构建第121-123页
        6.3.2 定点突变方法第123-124页
        6.3.3 重组菌的培养第124页
        6.3.4 重组菌催化 1,3-DCP合成手性ECH第124页
        6.3.5 卤醇脱卤酶的固定化第124页
        6.3.6 环氧化物水解酶的固定化第124页
    6.4 结果与讨论第124-130页
        6.4.1 基因串联共表达系统的构建第124-126页
        6.4.2 双质粒共表达系统的构建第126页
        6.4.3 双酶体系催化 1,3-DCP合成手性ECH第126-129页
        6.4.4 固定化酶偶联催化合成手性ECH第129-130页
    6.5 本章小结第130-132页
第七章 结论与展望第132-134页
    7.1 结论第132-133页
    7.2 展望第133-134页
参考文献第134-147页
攻博博士期间发表论文与专利第147-149页
致谢第149页

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