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基于非负矩阵分解的肿瘤基因表达谱数据分析

摘要第3-4页
Abstract第4-5页
第一章 绪论第8-16页
    1.1 生物信息学第8-9页
        1.1.1 生物信息学概论第8页
        1.1.2 研究背景与意义第8-9页
    1.2 基因表达谱数据分析理论第9-13页
        1.2.1 DNA微阵列技术第9-11页
        1.2.2 基因表达谱数据的特点第11-12页
        1.2.3 基因表达谱数据的数学描述第12-13页
        1.2.4 基因表达谱数据的预处理第13页
    1.3 基因表达谱的研究现状和方向第13-14页
        1.3.1 肿瘤基因表达谱的研究现状第13-14页
        1.3.2 肿瘤基因表达谱的研究方向第14页
    1.4 本文研究内容与组织结构第14-16页
第二章 非负矩阵分解及其变体算法第16-28页
    2.1 非负矩阵分解的基本理论第16-22页
        2.1.1 基础非负矩阵分解方法概述第16-19页
        2.1.2 收敛性证明第19-22页
    2.2 NMF的变体算法第22-26页
        2.2.1 稀疏非负矩阵分解算法第22-23页
        2.2.2 加权非负矩阵分解算法第23页
        2.2.3 图正规化的非负矩阵分解算法第23-24页
        2.2.4 概率非负矩阵分解算法第24-26页
        2.2.5 非平滑非负矩阵分解算法第26页
    2.3 本章小结第26-28页
第三章 基于双正交非负矩阵三因式分解的肿瘤识别第28-39页
    3.1 引言第28-29页
    3.2 双正交非负矩阵分解BONMTF第29-34页
        3.2.1 BONMTF算法描述第29-30页
        3.2.2 BONMTF算法的正确性和收敛性证明第30-34页
    3.3 实验第34-38页
        3.3.1 实验方法第34页
        3.3.2 数据分析第34-35页
        3.3.3 结果分析第35-38页
    3.4 本章小结第38-39页
第四章 基于对称三因式非负矩阵分解的肿瘤分类第39-47页
    4.1 引言第39-40页
    4.2 对称三因式非负矩阵分解STFNMF的算法描述第40-42页
    4.3 基于STFNMF的特征提取第42-43页
    4.4 实验第43-46页
        4.4.1 实验方法第43页
        4.4.2 数据分析第43-44页
        4.4.3 结果分析第44-46页
    4.5 本章小结第46-47页
第五章 总结与展望第47-49页
    5.1 论文总结第47-48页
    5.2 研究展望第48-49页
参考文献第49-54页
致谢第54-55页
攻读硕士研究生期间发表的论文和参与的科研项目第55页

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