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利用CRISPR/Cas9系统批量化敲除家蚕重要性状相关基因

摘要第3-7页
Abstract第7-8页
第一章 家蚕文献综述第12-18页
    1.1 丝绸行业现状第12-13页
    1.2 蚕桑业现状第13-14页
    1.3 家蚕生物反应器研究进展和面临的瓶颈第14-15页
    1.4 对家蚕驯化基因研究的必要性和有利条件第15页
    1.5 CRISPR/Cas9基因编辑技术的快速发展第15-16页
    1.6 应用CRISPR/Cas9基因编辑技术敲除的备选基因第16-18页
第二章 敲除丝素重链探究丝胶茧形成机制第18-50页
    2.1 前言第18-19页
    2.2 材料与方法第19-28页
        2.2.1 CRISPR/Cas9敲除的方法及突变体的获得第19-24页
        2.2.2 突变体转录组分析第24-28页
    2.3 结果分析第28-47页
        2.3.1 丝素重链基因阅读框移码突变突变体获得第28-33页
        2.3.2 转录组分析第33-47页
    2.4 讨论第47-50页
第三章 利用CRISPR/Cas9敲除家蚕存储蛋白1基因揭示其在蚕卵孵化中的重要作用第50-64页
    3.1 前言第50-51页
    3.2 材料与方法第51-57页
        3.2.1 材料第51页
        3.2.2 构建部分鳞翅目昆虫储存蛋白进化树第51-52页
        3.2.3 sgRNA设计及合成第52页
        3.2.4 sgRNA体外转录第52-53页
        3.2.5 Cas9质粒线性化第53-54页
        2.2.6 Cas9 mRNA体外转录第54页
        2.2.7 显微注射实验前准备第54页
        2.2.8 注射卵的制备第54页
        3.2.9 显微注射预实验第54-55页
        3.2.10 显微注射第55页
        3.2.11 突变体筛选第55页
        3.2.12 纯合突变体编码蛋白预测第55页
        3.2.13 RNA提取第55-56页
        3.2.14 cDNA转录第56-57页
        3.2.15 qPCR分析第57页
        3.2.16 纯合突变体表型观察及统计第57页
    3.3 结果第57-62页
        3.3.1 确定BmSp1属于蛋氨酸富集储存蛋白第57-59页
        3.3.2 sgRNA位点设计和BmSp1突变类型第59页
        3.3.3 筛选纯合突变体和突变体编码蛋白预测第59-60页
        3.3.4 BmSp1基因在突变体脂肪体中表达情况第60-61页
        3.3.5 突变引起孵化率显著降低,但是不影响茧重和蛹重第61-62页
    3.4 讨论第62-64页
第四章 P25以及驯化相关基因在多化地方品系nistari中的敲除以及后续分析第64-80页
    4.1 基因信息第64-65页
    4.2 材料与方法第65-70页
        4.2.1 材料第65页
        4.2.2 sgRNA设计及合成第65-67页
        4.2.3 sgRNA体外转录第67-68页
        4.2.4 Cas9质粒线性化第68页
        4.2.5 Cas9 mRNA体外转录第68-69页
        4.2.6 显微注射实验前准备第69页
        4.2.7 注射卵的制备第69页
        4.2.8 显微注射预实验第69页
        4.2.9 显微注射第69-70页
        4.2.10 突变体筛选第70页
    4.3 结果第70-79页
        4.3.1 敲除P25基因导致吐丝量减少,但是不影响正常吐丝第70-72页
        4.3.2 敲除锌指蛋白幼虫死亡率增加,蛹期呈现多态性第72-74页
        4.3.3 在驯化过程受到人工选择的氨基酸代谢通路相关基因敲除第74-77页
        4.3.4 节律基因的敲除第77-79页
    4.4 讨论第79-80页
第五章 CRISPR/Cas9基因编辑技术在云南本地实用品系中的可行性探索第80-90页
    5.1 基因信息第80页
    5.2 材料与方法第80-86页
        5.2.1 材料第80-81页
        5.2.2 sgRNA设计及合成第81-83页
        5.2.3 sgRNA体外转录第83-84页
        5.2.4 Cas9质粒线性化第84页
        5.2.5 Cas9 mRNA体外转录第84-85页
        5.2.6 显微注射实验前准备第85页
        5.2.7 注射卵的制备第85页
        5.2.8 显微注射预实验第85页
        5.2.9 显微注射第85页
        5.2.10 突变体检测第85-86页
    5.3 结果第86-88页
        5.3.1 P25基因敲除后代滞育后目前没有孵化第86-87页
        5.3.2 BGIBMGA000612-TA, BGIBMGA000648-TA, BGIBMGA006831-TA6,BGIBMGA000601-TA突变检测第87-88页
    5.4 讨论第88-90页
第六章 总结和展望第90-92页
致谢第92-95页
参考文献第95-99页
附录A 攻读学位期间发表及待发表论文第99-100页
附录B 攻读学位期间申请专利第100页

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