基于序列的蛋白质—核苷酸绑定位点预测研究
| 摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4-5页 |
| 1 引言 | 第8-14页 |
| 1.1 研究背景及意义 | 第8-9页 |
| 1.2 国内外研究概况 | 第9-11页 |
| 1.3 研究目标和内容 | 第11-12页 |
| 1.4 本文后续内容安排 | 第12-14页 |
| 2 蛋白质及其特征提取 | 第14-29页 |
| 2.1 蛋白质概述 | 第14-18页 |
| 2.1.1 蛋白质分子 | 第14-17页 |
| 2.1.2 蛋白质的结构体系 | 第17-18页 |
| 2.2 核苷酸 | 第18-19页 |
| 2.3 蛋白质特征提取 | 第19-28页 |
| 2.3.1 位置特异性得分矩阵 | 第20-22页 |
| 2.3.2 稀疏表示方法 | 第22-28页 |
| 2.4 本章小结 | 第28-29页 |
| 3 蛋白质-核苷酸绑定位点预测模型 | 第29-42页 |
| 3.1 采样方法 | 第29-35页 |
| 3.1.1 随机下采样 | 第29页 |
| 3.1.2 加权下采样 | 第29-31页 |
| 3.1.3 基于聚类的下采样 | 第31-35页 |
| 3.2 支持向量机方法 | 第35-39页 |
| 3.2.1 最优分类面 | 第35-37页 |
| 3.2.2 支持向量机 | 第37-39页 |
| 3.3 预测流程 | 第39-41页 |
| 3.4 本章小结 | 第41-42页 |
| 4 实验与分析 | 第42-68页 |
| 4.1 数据集及实验设计 | 第42-45页 |
| 4.2 性能评价指标 | 第45-46页 |
| 4.3 交叉验证实验 | 第46-55页 |
| 4.3.1 WUS-SVM预测模型 | 第46-51页 |
| 4.3.2 CUS-SVM预测模型 | 第51-55页 |
| 4.4 独立测试实验 | 第55-67页 |
| 4.5 本章小结 | 第67-68页 |
| 5 总结和展望 | 第68-70页 |
| 5.1 本文工作总结 | 第68-69页 |
| 5.2 研究展望 | 第69-70页 |
| 致谢 | 第70-71页 |
| 参考文献 | 第71-75页 |
| 附录 | 第75页 |
