| 摘要 | 第1-8页 |
| ABSTRACT | 第8-9页 |
| 1 引言 | 第9-15页 |
| ·生物学背景 | 第9-10页 |
| ·研究的意义 | 第10-14页 |
| ·蛋白质结构预测的生物学意义 | 第10-11页 |
| ·蛋白质二级结构预测现状 | 第11-13页 |
| ·蛋白质三级结构预测现状 | 第13-14页 |
| ·论文的工作安排 | 第14-15页 |
| 2 蛋白质结构预测的相关知识 | 第15-28页 |
| ·蛋白质分子的组成 | 第15-20页 |
| ·蛋白质结构预测 | 第20-24页 |
| ·蛋白质结构预测中涉及的方法 | 第21-22页 |
| ·蛋白质二级结构预测研究方法 | 第22-23页 |
| ·蛋白质三级结构预测研究方法 | 第23-24页 |
| ·蛋白质数据库 | 第24-26页 |
| ·蛋白质结构预测竞赛 | 第26-28页 |
| ·CASP(Critical Assessment of Protein Structure Prediction) | 第26-27页 |
| ·CAFASP(Critical Assessment of Fully Automated Structure Prediction) | 第27-28页 |
| 3 蛋白质结构预测优化模型 | 第28-35页 |
| ·HP 格点模型 | 第28-31页 |
| ·二维HP 格点模型能量函数 | 第29-30页 |
| ·三维HP 格点模型能量函数 | 第30-31页 |
| ·AB 非格点模型 | 第31-35页 |
| ·二维AB 非格点模型 | 第31-34页 |
| ·三维AB 非格点模型 | 第34-35页 |
| 4 模拟退火算法 | 第35-60页 |
| ·传统的模拟退火算法 | 第35-38页 |
| ·Metropolis 准则 | 第38-40页 |
| ·模拟退火算法在蛋白质结构预测中应用的现状 | 第40-41页 |
| ·改进的模拟退火算法 | 第41-45页 |
| ·测试 | 第45-49页 |
| ·改进的模拟退火算法在二维AB 非格点模型中的应用 | 第49-58页 |
| ·Fibonacci 序列测试 | 第49-54页 |
| ·真实蛋白质序列仿真 | 第54-58页 |
| ·结果分析 | 第58-59页 |
| ·本文的创新点 | 第59-60页 |
| 5 结论与讨论 | 第60-62页 |
| 参考文献 | 第62-66页 |
| 致谢 | 第66页 |
