| 摘要 | 第1-11页 |
| ABSTRACT | 第11-13页 |
| 缩略词表(Abbreviation) | 第13-15页 |
| 前言 | 第15-18页 |
| 第一章 文献综述 | 第18-58页 |
| 1 植物抗寒性相关分子调控机理 | 第18-22页 |
| ·低温信号感知 | 第19页 |
| ·低温信号转导 | 第19-21页 |
| ·转录调控 | 第21-22页 |
| 2 茶树抗寒性研究进展 | 第22-25页 |
| ·叶片形态及解剖结构研究 | 第23页 |
| ·细胞液浓度研究 | 第23-24页 |
| ·细胞内含物和水分比例 | 第23-24页 |
| ·细胞可溶性糖含量 | 第24页 |
| ·保护性酶类研究 | 第24页 |
| ·细胞膜完整性及细胞活力研究 | 第24-25页 |
| ·茶树抗寒基因筛选与鉴定 | 第25页 |
| 3 microRNA研究进展 | 第25-54页 |
| ·microRNA概述 | 第26-36页 |
| ·microRNA的发现 | 第26-27页 |
| ·miRNA的生物合成 | 第27-28页 |
| ·miRNA起源进化 | 第28-30页 |
| ·miRNA的典型特征 | 第30-34页 |
| ·miRNA的作用机制 | 第34-35页 |
| ·miRBase数据库 | 第35-36页 |
| ·植物miRNA功能 | 第36-44页 |
| ·miRNA调控植物生长发育及形态建成 | 第36-39页 |
| ·miRNA调控植物激素信号传导 | 第39-40页 |
| ·miRNA参与植物逆境胁迫响应 | 第40-44页 |
| ·miRNA研究方法 | 第44-54页 |
| ·miRNA的识别方法 | 第44-48页 |
| ·miRNA的表达检测方法 | 第48-51页 |
| ·miRNA靶基因的预测与鉴定 | 第51-54页 |
| 4 本研究的目的及意义 | 第54-55页 |
| 5 本研究的内容和技术路线 | 第55-58页 |
| ·研究内容 | 第55-56页 |
| ·研究路线 | 第56-58页 |
| 第二章 低温胁迫下茶树microRNA的高通量测序及生物信息学分析 | 第58-88页 |
| 1 材料与方法 | 第59-68页 |
| ·实验材料 | 第59-61页 |
| ·植物材料 | 第59页 |
| ·化学试剂及试剂盒 | 第59-60页 |
| ·数据库 | 第60-61页 |
| ·RNA提取 | 第61-63页 |
| ·总RNA提取 | 第61页 |
| ·总RNA凝胶电泳检测 | 第61-62页 |
| ·RNase Free DNasI纯化总RNA | 第62页 |
| ·Agilent 2100质量检测 | 第62-63页 |
| ·小RNA cDNA文库构建和HiSeq测序 | 第63-65页 |
| ·小RNA的分离提取 | 第63页 |
| ·小RNAcDNA文库构建 | 第63-65页 |
| ·cDNA文库的纯化和HiSeq测序 | 第65页 |
| ·生物信息学分析 | 第65-68页 |
| ·测序数据初级分析 | 第65-66页 |
| ·miRNA相关分析 | 第66-67页 |
| ·预测新的miRNA | 第67-68页 |
| 2 结果与分析 | 第68-74页 |
| ·RNA完整性及质量分析 | 第68页 |
| ·生物信息学分析 | 第68-74页 |
| ·茶树small RNA序列类型分布 | 第68-69页 |
| ·茶树small RNA序列的长度分布 | 第69-70页 |
| ·低温胁迫下茶树叶片保守miRNA的鉴定 | 第70-73页 |
| ·低温胁迫下茶树叶片新miRNA的预测 | 第73-74页 |
| 3 讨论 | 第74-88页 |
| ·高通量测序发掘低温胁迫下茶树小RNA | 第74-75页 |
| ·低温胁迫下茶树miRNA的序列特征 | 第75-88页 |
| 第三章 低温胁迫下茶树相关microRNA的差异表达分析 | 第88-138页 |
| 1 材料与方法 | 第89-93页 |
| ·实验材料 | 第89页 |
| ·植物材料 | 第89页 |
| ·化学试剂、酶及试剂盒 | 第89页 |
| ·总RNA提取及质量检测 | 第89页 |
| ·miRNA芯片杂交 | 第89-91页 |
| ·芯片探针筛选 | 第89-90页 |
| ·芯片制备 | 第90-91页 |
| ·Poly(A)末端加尾 | 第91页 |
| ·杂交反应 | 第91页 |
| ·片数据分析 | 第91页 |
| ·荧光定量PCR检测miRNA表达量 | 第91-93页 |
| ·荧光定量PCR检测序列选择 | 第91-92页 |
| ·荧光定量PCR引物设计 | 第92页 |
| ·荧光定量PCR反应 | 第92-93页 |
| 2 结果与分析 | 第93-101页 |
| ·总RNA质量检测 | 第93-94页 |
| ·茶树miRNA芯片杂交结果 | 第94-96页 |
| ·低温胁迫下茶树miRNA的差异表达 | 第96-99页 |
| ·低温胁迫下‘迎霜’miRNA的差异表达 | 第96-97页 |
| ·低温胁迫下‘白叶1号’miRNA的差异表达 | 第97-98页 |
| ·低温胁迫下‘迎霜’和‘白叶1号’miRNA的差异表达 | 第98-99页 |
| ·荧光定量PCR检测miRNA的差异表达 | 第99-101页 |
| 3 讨论 | 第101-138页 |
| ·miRNA微阵列芯片数据分析方法 | 第101-103页 |
| ·图像分析 | 第101页 |
| ·数据提取与表达 | 第101-102页 |
| ·数据预处理和归一化 | 第102页 |
| ·miRNA芯片数据分析中存在的问题 | 第102-103页 |
| ·低温胁迫下不同茶树品种miRNA表达差异 | 第103-104页 |
| ·荧光定量PCR分析 | 第104-138页 |
| 第四章 低温胁迫下茶树相关microRNA靶基因的鉴定与表达调控网络分析 | 第138-190页 |
| 1 材料与方法 | 第139-143页 |
| ·材料 | 第139-140页 |
| ·植物材料 | 第139页 |
| ·化学试剂、酶及试剂盒 | 第139页 |
| ·数据库及分析软件 | 第139-140页 |
| ·总RNA提取及质量检测 | 第140页 |
| ·降解组cDNA文库构建及高通量测序 | 第140-142页 |
| ·降解组cDNA文库构建 | 第140-142页 |
| ·降解组测序 | 第142页 |
| ·生物信息学分析 | 第142-143页 |
| ·降解组数据分析 | 第142-143页 |
| ·低温胁迫下茶树miRNA相关靶基因功能预测 | 第143页 |
| 2 结果与分析 | 第143-152页 |
| ·差异表达的miRNA靶基因基本信息 | 第143-147页 |
| ·低温胁迫下茶树差异表达miRNA靶基因裂解位点分析 | 第147-149页 |
| ·茶树低温胁迫下差异表达miRNA靶基因功能分析 | 第149-151页 |
| ·Gene Ontology分析 | 第149-151页 |
| ·Kyoto encyclopedia of genes and genomes分析 | 第151页 |
| ·低温胁迫下茶树相关miRNA靶基因作用模式分析 | 第151-152页 |
| 3 讨论 | 第152-190页 |
| 全文结论与展望 | 第190-194页 |
| 1 全文结论 | 第190-191页 |
| ·茶树低温小分子RNA混合文库的高通量测序及分析 | 第190页 |
| ·低温胁迫下茶树相关miRNA差异表达分析 | 第190-191页 |
| ·低温胁迫下茶树相关miRNA靶基因的鉴定与表达调控网络 | 第191页 |
| 2 独创性 | 第191页 |
| 3 展望 | 第191-194页 |
| 参考文献 | 第194-212页 |
| 读博期间论文发表情况 | 第212-214页 |
| 致谢 | 第214页 |
