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全转录组分析△S2 LF-PRLR对人类乳腺癌细胞(MCF-7)基因表达的影响

摘要第1-11页
ABSTRACT第11-13页
第1章 前言第13-27页
   ·催乳素第13-15页
     ·催乳素的基因、结构第13页
     ·催乳素的合成和分泌部位第13页
     ·催乳素的调节第13-14页
     ·催乳素的功能第14-15页
   ·催乳素受体第15-19页
     ·人催乳素受体的结构、分型、功能第15-16页
     ·人催乳素受体的基因、选择性剪切第16-17页
     ·催乳素受体的信号转导途径第17-18页
     ·催乳素受体与乳腺癌第18-19页
   ·变异催乳素受体△S2 LF-PRLR第19-20页
     ·△S2 LF-PRLR的发现及结构特征第19-20页
     ·△S2 LF-PRLR的生物学功能第20页
   ·乳腺癌发病的危险因素第20-22页
     ·遗传因素第20页
     ·月经初潮、妊娠、流产第20-21页
     ·雌激素暴露第21页
     ·绝经后激素替代治疗第21页
     ·催乳素与催乳素受体异常第21-22页
     ·高脂肪饮食第22页
   ·高通量测序第22-25页
     ·第二代测序技术第23页
     ·单分子测序技术第23页
     ·Ion PGM?半导体芯片技术第23-24页
     ·高通量测序技术的应用第24-25页
   ·本研究的目的、意义及创新点第25-27页
     ·研究的目的和意义第25-26页
     ·研究的创新点第26-27页
第2章 LF-PRLR、ΔS2 LF-PRLR腺病毒载体的构建与鉴定第27-38页
   ·材料第27-30页
     ·细胞系第27页
     ·质粒第27-28页
     ·实验设备第28-29页
     ·实验试剂第29页
     ·扩增引物第29-30页
   ·方法第30-32页
     ·腺病毒载体构建与鉴定第30-31页
     ·腺病毒包装第31页
     ·MTS检测细胞增殖第31-32页
   ·结果和分析第32-36页
     ·pDC316-mCMV-EGFP-LF-PRLR鉴定第32-33页
     ·pDC316-mCMV-EGFP-ΔS2 LF-PRLR鉴定第33-34页
     ·腺病毒包装结果鉴定第34-35页
     ·腺病毒转染MCF-7 细胞第35-36页
     ·MTS检测细胞增殖第36页
   ·讨论第36-38页
     ·外源基因转染细胞第36-37页
     ·△S2 LF-PRLR促进细胞增殖第37-38页
第3章 CON、LF-PRLR、ΔS2 LF-PRLR处理细胞转录组测序(RNA-Seq)第38-58页
   ·材料第38-40页
     ·细胞株第38页
     ·实验仪器第38-39页
     ·实验试剂第39页
     ·软件第39-40页
     ·基因比对文库第40页
   ·方法第40-43页
     ·RNA样品的制备第40页
     ·转录组测序文库建立第40-42页
     ·高通量测序及分析第42页
     ·数据库比对第42-43页
   ·结果与分析第43-54页
     ·RNA质量检测——凝胶电泳检测第43-44页
     ·RNA质量检测——Agilent Technogies 2100进行检测第44-45页
     ·原始数据过滤结果第45页
     ·与基因组的匹配结果第45-46页
     ·基因表达水平的标准化第46页
     ·全基因组与部分参考基因的比对第46-47页
     ·全转录组仅在△S2 LF-PRLR组表达的基因第47-48页
     ·全转录组仅在△S2 LF-PRLR组不表达的基因第48页
     ·在三组中都有表达但是在△S2 LF-PRLR组高表达的基因第48-49页
     ·在三组中都有表达但是在△S2 LF-PRLR组低表达的基因第49页
     ·△S2 LF-PRLR组较LF-PRLR组高表达但CON组不表达的基因第49-50页
     ·△S2 LF-PRLR组较LF-PRLR组低表达但CON组不表达的基因第50页
     ·肿瘤相关基因的差异表达第50-51页
     ·凋亡相关基因的差异表达第51-52页
     ·MicroRNAs的差异表达第52-53页
     ·snoRNA的差异表达第53-54页
   ·讨论第54-58页
     ·RNA样本的质量第54页
     ·△S2 LF-PRLR对肿瘤相关基因的影响第54-55页
     ·△S2 LF-PRLR对凋亡相关基因的影响第55-56页
     ·△S2 LF-PRLR对MicroRNAs表达的影响第56页
     ·△S2 LF-PRLR对snoRNA表达的影响第56-58页
第4章 结论与展望第58-60页
   ·结论第58-59页
   ·展望第59-60页
致谢第60-61页
参考文献第61-68页
作者在学期间取得的学术成果第68-69页
附录A 重组质粒测序结果第69-71页
附录B 转录组基因表达分析表第71-78页

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