中文摘要 | 第1-7页 |
Abstract | 第7-8页 |
目录 | 第8-10页 |
第一章 引言 | 第10-20页 |
第一节 生物信息学介绍 | 第10页 |
第二节 蛋白质的结构 | 第10-18页 |
·氨基酸 | 第11-14页 |
·蛋白质的一级结构 | 第14页 |
·蛋白质的二级结构 | 第14-15页 |
·蛋白质的超二级结构和结构域 | 第15-16页 |
·蛋白质的三级结构 | 第16-17页 |
·蛋白质的四级结构 | 第17-18页 |
第三节 蛋白质四级结构预测综述 | 第18-20页 |
第四节 研究方法简述 | 第20页 |
第二章 材料与方法 | 第20-39页 |
第一节 数据集的获取 | 第20-21页 |
第二节 分类器介绍 | 第21-25页 |
第三节 预测效果的评价指标 | 第25-26页 |
第四节 特征提取过程 | 第26-36页 |
·氨基酸序列的基本指标(61) | 第27页 |
·基于PSSM矩阵的特征(188) | 第27-29页 |
·基于二级结构的特征提取(220) | 第29-33页 |
·基于RSA的特征提取(23) | 第33页 |
·基于氨基酸的理化性质的特征提取(46) | 第33-36页 |
第五节 特征选择过程 | 第36-38页 |
第六节 预测和独立测试集验证 | 第38-39页 |
第三章 结果与讨论 | 第39-52页 |
第一节 预测结果评价 | 第39-49页 |
·利用所有特征的预测结果 | 第39-40页 |
·利用经mRMR特征选择后的特征的预测结果 | 第40-44页 |
·利用经mRMR和wrapper选择后的特征的预测结果 | 第44-49页 |
第二节 独立集测试 | 第49-50页 |
第三节 与Garian's QSE方法预测效果的比较 | 第50-52页 |
第四章 结论 | 第52-53页 |
参考文献 | 第53-55页 |
致谢 | 第55-56页 |
个人简历 | 第56页 |