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蛋白质四级结构预测--一种基于mRMR与SVM的新方法Quat-PRE

中文摘要第1-7页
Abstract第7-8页
目录第8-10页
第一章 引言第10-20页
 第一节 生物信息学介绍第10页
 第二节 蛋白质的结构第10-18页
     ·氨基酸第11-14页
     ·蛋白质的一级结构第14页
     ·蛋白质的二级结构第14-15页
     ·蛋白质的超二级结构和结构域第15-16页
     ·蛋白质的三级结构第16-17页
     ·蛋白质的四级结构第17-18页
 第三节 蛋白质四级结构预测综述第18-20页
 第四节 研究方法简述第20页
第二章 材料与方法第20-39页
 第一节 数据集的获取第20-21页
 第二节 分类器介绍第21-25页
 第三节 预测效果的评价指标第25-26页
 第四节 特征提取过程第26-36页
     ·氨基酸序列的基本指标(61)第27页
     ·基于PSSM矩阵的特征(188)第27-29页
     ·基于二级结构的特征提取(220)第29-33页
     ·基于RSA的特征提取(23)第33页
     ·基于氨基酸的理化性质的特征提取(46)第33-36页
 第五节 特征选择过程第36-38页
 第六节 预测和独立测试集验证第38-39页
第三章 结果与讨论第39-52页
 第一节 预测结果评价第39-49页
     ·利用所有特征的预测结果第39-40页
     ·利用经mRMR特征选择后的特征的预测结果第40-44页
     ·利用经mRMR和wrapper选择后的特征的预测结果第44-49页
 第二节 独立集测试第49-50页
 第三节 与Garian's QSE方法预测效果的比较第50-52页
第四章 结论第52-53页
参考文献第53-55页
致谢第55-56页
个人简历第56页

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