| 摘要 | 第1-4页 |
| ABSTRACT | 第4-7页 |
| 第一章 文献综述 | 第7-15页 |
| ·蛋白质的折叠复性 | 第7-10页 |
| ·蛋白质折叠的基本原理 | 第7-8页 |
| ·蛋白质折叠的微观机理 | 第8页 |
| ·蛋白质折叠的宏观动力学模型 | 第8-9页 |
| ·蛋白质复性方法 | 第9-10页 |
| ·同电荷介质辅助蛋白质复性 | 第10-12页 |
| ·分子动力学模拟的原理及应用 | 第12-14页 |
| ·分子动力学模拟的原理 | 第12-13页 |
| ·分子动力学模拟在蛋白质体系中的应用 | 第13-14页 |
| ·本文研究内容 | 第14-15页 |
| 第二章 模型和方法 | 第15-29页 |
| ·引言 | 第15-16页 |
| ·粗粒化模型和模拟体系构建 | 第16-19页 |
| ·蛋白质模型 | 第16-17页 |
| ·色谱基质模型 | 第17页 |
| ·色谱介质及色谱孔道模型 | 第17-19页 |
| ·模拟体系构建 | 第19页 |
| ·全原子模型和模拟体系构建 | 第19-24页 |
| ·蛋白质模型 | 第20页 |
| ·色谱基质模型 | 第20-21页 |
| ·色谱介质及色谱模型 | 第21-23页 |
| ·模拟体系构建 | 第23-24页 |
| ·模拟方法及参数 | 第24页 |
| ·数据分析方法 | 第24-28页 |
| ·体系构象分析 | 第24-26页 |
| ·距离分析 | 第26页 |
| ·势能分析 | 第26-27页 |
| ·蛋白质方位分析 | 第27页 |
| ·自由能分解 | 第27-28页 |
| ·小结 | 第28-29页 |
| 第三章 荷电表面蛋白质空间取向的粗粒化分子动力学模拟 | 第29-43页 |
| ·模拟结束时的体系构象分析 | 第29-31页 |
| ·距离分析 | 第31-32页 |
| ·势能分析 | 第32-34页 |
| ·蛋白质方位及状态分析 | 第34-40页 |
| ·蛋白质方位及构象随荷电表面电荷变化分析 | 第40-42页 |
| ·小结 | 第42-43页 |
| 第四章 荷电表面蛋白质空间取向的全原子分子动力学模拟 | 第43-53页 |
| ·模拟结束时的体系构象分析 | 第43-44页 |
| ·距离分析 | 第44-45页 |
| ·势能分析 | 第45-46页 |
| ·中性荷电表面的蛋白质方位分析 | 第46-47页 |
| ·同电荷荷电表面的蛋白质方位分析 | 第47-48页 |
| ·蛋白质状态分析 | 第48-51页 |
| ·二级结构分析 | 第48-50页 |
| ·聚集情况分析 | 第50-51页 |
| ·小结 | 第51-53页 |
| 第五章 结论与展望 | 第53-55页 |
| ·结论 | 第53-54页 |
| ·本文创新点 | 第54页 |
| ·未来工作建议与展望 | 第54-55页 |
| 参考文献 | 第55-59页 |
| 致谢 | 第59页 |