中国特有种长江华溪蟹的分子系统地理学研究（十足目：溪蟹科）
| 摘要 | 第1-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 第一章 前言 | 第11-34页 |
| ·分子系统地理学概述 | 第11-17页 |
| ·分子系统地理学概念 | 第11-12页 |
| ·分子系统地理学的主要内容与分布格局模式 | 第12-14页 |
| ·分子系统地理学的诞生与发展 | 第14-15页 |
| ·分子系统地理学的研究方法 | 第15-16页 |
| ·分子系统地理学在保护生物学中的应用 | 第16-17页 |
| ·全球第四纪冰期气候对物种的影响 | 第17-20页 |
| ·全球第四纪气候概况 | 第17-18页 |
| ·中国第四纪冰期气候变化 | 第18-19页 |
| ·物种对冰期气候变化的响应 | 第19-20页 |
| ·生物分布地预测 | 第20-25页 |
| ·生物分布地预测的主要理论基础 | 第20-22页 |
| ·生态位理论 | 第20-21页 |
| ·利比希最小因子定律 | 第21页 |
| ·谢尔福德的耐受性定律 | 第21-22页 |
| ·常用的生物分布地预测模型 | 第22-23页 |
| ·环境包络模型 | 第22页 |
| ·生态位因子分析 | 第22-23页 |
| ·最大熵模型 | 第23页 |
| ·混合模型 | 第23页 |
| ·预测数据的来源 | 第23-25页 |
| ·物种分布地数据来源 | 第24页 |
| ·环境变量数据来源 | 第24-25页 |
| ·中国淡水蟹的分类与地理分布区划 | 第25-27页 |
| ·中国淡水蟹类的分类与地理分布 | 第25页 |
| ·中国淡水蟹类的地理区划 | 第25-27页 |
| ·华溪蟹属 | 第27-29页 |
| ·长江华溪蟹 | 第29-31页 |
| ·本研究论文的主要目的和意义 | 第31-34页 |
| 第二章 长江华溪蟹微卫星位点的筛选及通用性检测 | 第34-51页 |
| 引言 | 第34-35页 |
| ·材料和方法 | 第35-40页 |
| ·样品采集 | 第35-36页 |
| ·实验方法与操作 | 第36-40页 |
| ·基因组DNA的提取 | 第36页 |
| ·基因组DNA的消化连接反应 | 第36-37页 |
| ·磁珠富集法捕获SSR序列 | 第37-38页 |
| ·双链恢复PCR反应 | 第38-39页 |
| ·克隆与测序 | 第39页 |
| ·引物设计 | 第39页 |
| ·基因分型及多态性信息获得 | 第39-40页 |
| ·引物通用性检测 | 第40页 |
| ·数据分析 | 第40-41页 |
| ·结果 | 第41-47页 |
| ·基因组的酶切连接反应 | 第41页 |
| ·双链恢复PCR反应 | 第41页 |
| ·阳性克隆的检测 | 第41-42页 |
| ·长江华溪蟹SSR序列分类统计 | 第42-43页 |
| ·微卫星位点多态性信息 | 第43-44页 |
| ·引物的通用性检测 | 第44-47页 |
| ·讨论 | 第47-51页 |
| ·微卫星位点的遗传变异 | 第47-49页 |
| ·微卫星位点在相关物种中的通用性 | 第49-51页 |
| 第三章 长江华溪蟹的分子系统地理学研究 | 第51-89页 |
| 引言 | 第51-52页 |
| ·材料和方法 | 第52-57页 |
| ·实验材料 | 第52-54页 |
| ·实验方法 | 第54-57页 |
| ·总基因组DNA的抽提 | 第54页 |
| ·线粒体目的片段扩增和测序 | 第54-55页 |
| ·微卫星DNA的扩增和基因分型 | 第55-56页 |
| ·长江华溪蟹的潜在分布地预测 | 第56-57页 |
| ·数据分析 | 第57-62页 |
| ·线粒体数据分析 | 第57-60页 |
| ·序列变异分析 | 第57-58页 |
| ·遗传多样性分析 | 第58-59页 |
| ·种群遗传结构分析 | 第59页 |
| ·主要分支的分歧时间估计 | 第59页 |
| ·种群动态分析 | 第59-60页 |
| ·基因流估计 | 第60页 |
| ·微卫星数据分析 | 第60-62页 |
| ·种群遗传多样性 | 第60-61页 |
| ·种群遗传结构 | 第61页 |
| ·种群间网络结构 | 第61页 |
| ·基因流估计 | 第61-62页 |
| ·长江华溪蟹潜在分布地的重建 | 第62页 |
| ·结果与分析 | 第62-81页 |
| ·线粒体DNA结果与分析 | 第62-71页 |
| ·线粒体遗传变异 | 第62-63页 |
| ·遗传多样性 | 第63-66页 |
| ·种群遗传结构 | 第66-68页 |
| ·分歧时间估计 | 第68页 |
| ·种群动态分析 | 第68-69页 |
| ·种群间基因流 | 第69-71页 |
| ·微卫星DNA结果与分析 | 第71-80页 |
| ·种群遗传多样性 | 第71页 |
| ·种群遗传结构 | 第71-76页 |
| ·种群网络结构 | 第76-77页 |
| ·历史基因流估计 | 第77-80页 |
| ·长江华溪蟹的潜在分布地 | 第80-81页 |
| ·讨论 | 第81-89页 |
| ·种群遗传结构与分歧 | 第81-83页 |
| ·历史种群动态 | 第83-84页 |
| ·冰期避难所 | 第84-85页 |
| ·气候变化对长江华溪蟹形态的影响 | 第85-87页 |
| ·长江华溪蟹桐柏亚种的重新界定 | 第87页 |
| ·长江华溪蟹的保护与管理 | 第87-89页 |
| 第四章 结论 | 第89-91页 |
| 附录 长江华溪蟹的单倍型和GenBank序列号 | 第91-96页 |
| 参考文献 | 第96-111页 |
| 在读期间的学术论文及研究成果 | 第111-112页 |
| 致谢 | 第112页 |
