| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 目录 | 第9-16页 |
| 第一章 引言 | 第16-50页 |
| ·绝热近似 | 第17-18页 |
| ·波函数方法 | 第18-27页 |
| ·变分法 | 第18-19页 |
| ·Hartree方法 | 第19-20页 |
| ·Hartree Fock方法 | 第20-23页 |
| ·CI方法 | 第23-24页 |
| ·耦合簇方案 | 第24-25页 |
| ·多体微扰理论 | 第25-27页 |
| ·密度泛函方法 | 第27-31页 |
| ·Kohn-Sham定理以及Kohn-Sham方案 | 第27-30页 |
| ·密度泛函具体形式以及缺陷 | 第30-31页 |
| ·基组 | 第31-33页 |
| ·半经验方法简介 | 第33-34页 |
| ·采样方案简介 | 第34-38页 |
| ·蒙特卡洛方法 | 第34-36页 |
| ·分子动力学简介 | 第36-38页 |
| ·红外光谱理论 | 第38-41页 |
| ·频率 | 第39页 |
| ·强度 | 第39-41页 |
| ·近边X射线吸收谱计算方法 | 第41-43页 |
| ·分子统计力学初步 | 第43-44页 |
| ·OVGF理论 | 第44-48页 |
| ·相关软件介绍 | 第48-50页 |
| 第二章 谷氨酰胺的质子化与去质子化 | 第50-64页 |
| ·引言 | 第50-51页 |
| ·计算方法 | 第51-53页 |
| ·结果与讨论 | 第53-61页 |
| ·中性谷氨酰胺的构象 | 第53-58页 |
| ·质子化与去质子化谷氨酰胺的构象 | 第58-59页 |
| ·气相谷氨酰胺的质子化和去质子化反应的热力学数据 | 第59-61页 |
| ·小结 | 第61-64页 |
| 第三章 谷氨酰胺与Ⅰ/Ⅱ主族金属离子的相互作用 | 第64-82页 |
| ·引言 | 第64-65页 |
| ·计算方法 | 第65-67页 |
| ·结果与讨论 | 第67-78页 |
| ·结构和能量 | 第67-71页 |
| ·结合能 | 第71-74页 |
| ·红外光谱 | 第74-78页 |
| ·关于双电性离子稳定性的推测 | 第78页 |
| ·小结 | 第78-82页 |
| 第四章 八水合甘氨酸团簇结构与光谱研究 | 第82-106页 |
| ·引言 | 第82-84页 |
| ·方法 | 第84-86页 |
| ·结果与讨论 | 第86-102页 |
| ·HF/6-31++G~(**)的结构 | 第86-88页 |
| ·DFT优化的双电性结构 | 第88-91页 |
| ·质子化和去质子化结构 | 第91-95页 |
| ·水合层结构 | 第95-96页 |
| ·红外光谱 | 第96-100页 |
| ·NEXAFS | 第100-102页 |
| ·小结 | 第102-106页 |
| 第五章 20种自然氨基酸的热力学数据 | 第106-118页 |
| ·引言 | 第106-107页 |
| ·方法 | 第107页 |
| ·20种氨基酸的PDE | 第107-110页 |
| ·20种氨基酸的PA | 第110-111页 |
| ·小结 | 第111-118页 |
| 第六章 总结 | 第118-120页 |
| 附录A 亲和能的测量技术：EKM VS SKM | 第120-122页 |
| 附录B 分数电荷与离域化误差 | 第122-128页 |
| 附录C 蒙特卡洛方法产生水壳层的技术细节 | 第128-130页 |
| 参考文献 | 第130-149页 |
| 发表文章目录 | 第149-150页 |
| 致谢 | 第150页 |