甜瓜转录因子家族全基因组预测及ARF转录因子家族分析
| 目录 | 第1-6页 |
| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 缩略词表 | 第10-11页 |
| 1. 前言 | 第11-24页 |
| ·课题的提出 | 第11页 |
| ·国内外研究进展 | 第11-23页 |
| ·转录因子 | 第11-15页 |
| ·与逆境相关的转录因子家族 | 第15-19页 |
| ·ARF转录因子家族 | 第19-21页 |
| ·内参基因 | 第21-23页 |
| ·研究的目的和内容 | 第23-24页 |
| ·研究的目的 | 第23页 |
| ·研究的内容 | 第23-24页 |
| 2. 材料与方法 | 第24-33页 |
| ·甜瓜转录因子的预测 | 第24-26页 |
| ·转录因子家族鉴定标准 | 第24-26页 |
| ·转录因子基因家族隐马尔科夫模型的获得和构建 | 第26页 |
| ·甜瓜转录因子家族基因预测 | 第26页 |
| ·甜瓜ARF转录因子家族特征分析 | 第26-27页 |
| ·甜瓜内参基因的筛选 | 第27-30页 |
| ·植物材料及生长环境 | 第27页 |
| ·实验处理 | 第27-28页 |
| ·候选内参基因选择 | 第28-29页 |
| ·基因序列获得 | 第29页 |
| ·引物设计 | 第29页 |
| ·数据分析 | 第29-30页 |
| ·ARF转录因子甜瓜果实发育过程中的表达分析 | 第30页 |
| ·植物材料与生长环境 | 第30页 |
| ·实验处理 | 第30页 |
| ·RNA的提取与cDNA第一条链的合成 | 第30-32页 |
| ·根系、叶片中RNA的提取 | 第30-31页 |
| ·果实中RNA的提取 | 第31页 |
| ·RNA质量检测 | 第31页 |
| ·cDNA第一条链的合成 | 第31-32页 |
| ·实时定量PCR分析 | 第32页 |
| ·数据处理 | 第32-33页 |
| 3. 结果与分析 | 第33-59页 |
| ·甜瓜全基因组转录因子家族预测 | 第33-34页 |
| ·甜瓜ARF遗传因子家族特征分析 | 第34-42页 |
| ·甜瓜ARF转录因子家族成员 | 第34-35页 |
| ·甜瓜ARF基因结构分析 | 第35页 |
| ·甜瓜ARF转录因子蛋白的保守序列分析 | 第35-39页 |
| ·甜瓜ARF转录因子蛋白的系统进化分析 | 第39-40页 |
| ·ARF转录因子与甜瓜Unigenes的比对分析 | 第40-42页 |
| ·甜瓜内参基因的筛选 | 第42-55页 |
| ·甜瓜内参基因的筛选 | 第42页 |
| ·甜瓜内参基因引物特异性鉴定 | 第42-45页 |
| ·引物扩增效率和标准曲线绘制 | 第45页 |
| ·内参基因表达稳定性分析 | 第45-55页 |
| ·甜瓜ARF转录因子家族在果实发育中的表达分析 | 第55-59页 |
| ·甜瓜ARF转录因子家族基因表达分析 | 第58-59页 |
| 4 讨论 | 第59-64页 |
| ·甜瓜转录因子家族预测 | 第59-60页 |
| ·甜瓜内参基因的筛选 | 第60-61页 |
| ·ARF转录因子家族分析 | 第61-64页 |
| 参考文献 | 第64-75页 |
| 致谢 | 第75页 |