| 摘要 | 第1-10页 |
| ABSTRACT | 第10-12页 |
| 縮略词表 | 第12-14页 |
| 前言 | 第14-16页 |
| 第一章 文献综述 | 第16-34页 |
| 1 cDNA文库相关研究 | 第16-23页 |
| ·cDNA文库的构建方法 | 第16-19页 |
| ·cDNA文库构建的载体种类及其优缺点 | 第19页 |
| ·cDNA文库类型 | 第19-23页 |
| ·经典cDNA文库 | 第19-20页 |
| ·标准化cDNA文库 | 第20页 |
| ·差减cDNA文库 | 第20-21页 |
| ·染色体或区域特异性cDNA文库 | 第21-22页 |
| ·PCR cDNA文库与RACE cDNA文库 | 第22页 |
| ·固相cDNA文库 | 第22-23页 |
| ·cDNA文库的应用 | 第23页 |
| 2 EST序列分析及应用相关研究 | 第23-28页 |
| ·EST技术的形成与发展 | 第23-24页 |
| ·EST技术的应用 | 第24-28页 |
| ·遗传学图谱的构建 | 第24-25页 |
| ·新基因的分离与鉴定 | 第25页 |
| ·差异表达基因的研究 | 第25-26页 |
| ·基因芯片的制备 | 第26页 |
| ·电子克隆 | 第26-27页 |
| ·比较基因组学研究 | 第27页 |
| ·EST-SSR标记的开发 | 第27-28页 |
| ·SNP标记的开发 | 第28页 |
| 3 基因芯片及其应用相关研究 | 第28-34页 |
| ·基因芯片原理及其特点 | 第28-29页 |
| ·基因芯片的种类 | 第29-30页 |
| ·基因芯片检测过程 | 第30页 |
| ·基因芯片技术在果树上的应用 | 第30-31页 |
| ·问题及展望 | 第31-34页 |
| 第二章 夏黑葡萄花及果实cDNA文库的构建及鉴定 | 第34-48页 |
| 摘要 | 第34页 |
| ABSTRACT | 第34-36页 |
| 1 材料和方法 | 第36-42页 |
| ·试验材料 | 第36页 |
| ·植物材料 | 第36页 |
| ·主要试剂 | 第36页 |
| ·仪器设备 | 第36页 |
| ·方法 | 第36-42页 |
| ·总RNA的提取 | 第37页 |
| ·总RNA中DNA的消化 | 第37-38页 |
| ·mRNA的纯化 | 第38-39页 |
| ·cDNA的合成 | 第39页 |
| ·cDNA文库的构建 | 第39-41页 |
| ·cDNA文库的滴度测定 | 第41-42页 |
| ·cDNA文库的质量鉴定 | 第42页 |
| 2 结果与分析 | 第42-45页 |
| ·葡萄花和果实中的总RNA质量鉴定 | 第42-43页 |
| ·双链cDNA合成质量检测 | 第43-44页 |
| ·cDNA文库的鉴定 | 第44-45页 |
| ·cDNA文库的质量对EST序列的影响 | 第45页 |
| 3 讨论 | 第45-48页 |
| 第三章 葡萄花、果实cDNA文库测序及EST序列分析 | 第48-58页 |
| 摘要 | 第48页 |
| ABSTRACT | 第48-50页 |
| 1 材料与方法 | 第50-51页 |
| ·实验材料 | 第50页 |
| ·cDNA克隆的大规模EST测序 | 第50页 |
| ·EST序列分析 | 第50-51页 |
| ·EST功能注释和基因定位 | 第51页 |
| 2 结果与分析 | 第51-56页 |
| ·葡萄花和果实EST序列的基本信息 | 第51-53页 |
| ·Unigene的COG分类及功能注释 | 第53-55页 |
| ·Unigene的功能注释 | 第55页 |
| ·新EST序列的获得及基因定位 | 第55-56页 |
| 3 讨论 | 第56-58页 |
| 第四章 葡萄EST-SSRs标记的开发 | 第58-76页 |
| 摘要 | 第58页 |
| ABSTRACT | 第58-59页 |
| 1 材料与方法 | 第59-64页 |
| ·试验材料 | 第59-61页 |
| ·主要试剂及仪器 | 第61页 |
| ·不同葡萄品种DNA提取方法及步骤 | 第61-62页 |
| ·葡萄EST序列中SSR搜索 | 第62页 |
| ·葡萄EST-SSR引物设计 | 第62页 |
| ·变性聚丙烯酰胺凝胶的制备 | 第62-64页 |
| ·葡萄EST-SSR引物筛选及多态性检测 | 第64页 |
| 2 结果与分析 | 第64-73页 |
| ·DNA纯度和产率检测 | 第64页 |
| ·DNA完整性检测 | 第64-65页 |
| ·葡萄EST-SSR分布、频率和特点 | 第65-67页 |
| ·葡萄EST-SSR引物的验证 | 第67-68页 |
| ·葡萄EST-SSR引物多态性分析 | 第68-73页 |
| 3 讨论 | 第73-76页 |
| 第五章 鲜食与酿酒葡萄果实发育相关基因表达水平的比较 | 第76-104页 |
| 摘要 | 第76页 |
| ABSTRACT | 第76-78页 |
| 1 材料与方法 | 第78-83页 |
| ·材料 | 第78-79页 |
| ·RNA提取 | 第79页 |
| ·荧光探针的制备 | 第79-81页 |
| ·芯片杂交 | 第81页 |
| ·数据的采集与分析处理 | 第81页 |
| ·转录差异基因的实时荧光定量PCR验证(qRT-PCR) | 第81-83页 |
| 2 结果 | 第83-100页 |
| ·不同品种葡萄果实总RNA提取质量检测 | 第83页 |
| ·鲜食和酿酒葡萄之间差异表达基因分析 | 第83-85页 |
| ·差异表达基因功能注释及分类 | 第85-90页 |
| ·差异表达基因的分层聚类分析 | 第90-91页 |
| ·KEGG pathway分析 | 第91-94页 |
| ·基因芯片所得差异表达基因的qRT-PCR验证 | 第94-100页 |
| 3 讨论 | 第100-104页 |
| 全文总结 | 第104-106页 |
| 主要创新点 | 第106-108页 |
| 参考文献 | 第108-126页 |
| 附录 | 第126-128页 |
| 读博期间论文发表情况 | 第128-132页 |
| 致谢 | 第132页 |
