蛋白质网络模块化方法研究
| 致谢 | 第1-6页 |
| 摘要 | 第6-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 序 | 第8-11页 |
| 1 绪论 | 第11-17页 |
| ·蛋白质相互作用 | 第11页 |
| ·蛋白质相互作用网络的几个基本概念 | 第11-13页 |
| ·度 | 第12-13页 |
| ·路径,最短路径和平均路径 | 第13页 |
| ·一阶,二阶和三阶相互作用 | 第13页 |
| ·路径数 | 第13页 |
| ·模糊聚类 | 第13-17页 |
| ·模糊关系 | 第13-14页 |
| ·模糊等价关系 | 第14-17页 |
| 2. 研究内容和意义 | 第17-19页 |
| ·研究内容 | 第17页 |
| ·研究意义 | 第17-18页 |
| ·本文创新点 | 第18-19页 |
| 3. 数据的获取和预处理 | 第19-21页 |
| ·获取蛋白质相互作用数据 | 第19-20页 |
| ·PPI数据库 | 第19页 |
| ·获取数据 | 第19-20页 |
| ·数据的预处理 | 第20-21页 |
| 4. 蛋白质的相似性及相关统计计算 | 第21-28页 |
| ·模块化过程中相似性的作用 | 第21页 |
| ·统计分析及结果 | 第21-26页 |
| ·酵母统计结果 | 第21-22页 |
| ·大肠杆菌统计结果 | 第22-23页 |
| ·果蝇统计结果 | 第23-24页 |
| ·线虫统计结果 | 第24-25页 |
| ·小鼠统计结果 | 第25-26页 |
| ·相似性的定义 | 第26-28页 |
| 5. 模糊聚类法对PPI网络进行模块化 | 第28-30页 |
| ·模块化路线 | 第28页 |
| ·相似矩阵 | 第28页 |
| ·传递闭包 | 第28页 |
| ·聚类结果 | 第28-30页 |
| 6. 评估与反馈 | 第30-32页 |
| ·基因本体 | 第30页 |
| ·酵母聚类结果的显著性分析 | 第30-32页 |
| 7. 结论 | 第32-33页 |
| 参考文献 | 第33-35页 |
| 作者简历 | 第35-37页 |
| 学位论文数据集 | 第37页 |
