原核生物中的转录调控模体预测研究
中文摘要 | 第1-9页 |
英文摘要 | 第9-11页 |
第一章 预备知识 | 第11-19页 |
§1.1 基因调控和调控模体 | 第12-13页 |
§1.2 模体预测问题 | 第13-14页 |
§1.3 模体预测的方法 | 第14-16页 |
§1.4 MREC和BOBRO | 第16-19页 |
第二章 文献背景 | 第19-29页 |
§2.1 模体的表示模型 | 第19-21页 |
§2.2 传统的模体预测算法 | 第21-25页 |
§2.3 系统发生足迹 | 第25-27页 |
§2.4 总结 | 第27-29页 |
第三章 MREC:模体闭包和模体长度 | 第29-59页 |
§3.1 背景与创新点 | 第29-32页 |
§3.2 MREC算法 | 第32-40页 |
§3.3 实验结果与分析 | 第40-49页 |
§3.4 讨论与总结 | 第49-50页 |
§3.5 附录 | 第50-59页 |
第四章 BOBRO:模体预测组合算法 | 第59-85页 |
§4.1 背景简介 | 第59-61页 |
§4.2 算法 | 第61-66页 |
§4.3 大肠杆菌上的调控模体预测 | 第66-78页 |
§4.4 讨论与总结 | 第78-85页 |
第五章 总结和展望 | 第85-91页 |
§5.1 MREC和BOBRO的改进和存在的问题 | 第85-87页 |
§5.2 真核生物的调控模体预测 | 第87-88页 |
§5.3 利用系统发生足迹策略预测模体 | 第88-89页 |
§5.4 调节子预测 | 第89-91页 |
参考文献 | 第91-99页 |
致谢 | 第99-101页 |
攻读博士学位期间完成论文情况 | 第101-103页 |
个人简介 | 第103-105页 |
学位论文评阅及答辩情况表 | 第105页 |