生物大分子的数学描述及其应用
| 中文摘要 | 第1-6页 |
| 英文摘要 | 第6-10页 |
| 0 绪论 | 第10-24页 |
| ·生物信息学产生的背景 | 第10-11页 |
| ·生物信息学的研究对象 | 第11-16页 |
| ·核酸 | 第12-13页 |
| ·蛋白质 | 第13-14页 |
| ·中心法则和遗传密码 | 第14-16页 |
| ·生物信息学主要研究内容 | 第16-21页 |
| ·序列比较 | 第16-18页 |
| ·计算机辅助基因识别 | 第18-20页 |
| ·分子进化和比较基因组学 | 第20页 |
| ·RNA和蛋白质的结构研究 | 第20-21页 |
| ·本文的主要工作 | 第21-24页 |
| 1 生物大分子的图表示 | 第24-38页 |
| ·引言 | 第24-28页 |
| ·2-D图表示 | 第24-26页 |
| ·3-D图表示 | 第26-27页 |
| ·其他 | 第27-28页 |
| ·DNA序列的3-D图形表示 | 第28-31页 |
| ·DNA序列的2-D图形表示 | 第31-35页 |
| ·特征序列 | 第31-32页 |
| ·基于特征序列的“双水平线”图 | 第32-33页 |
| ·基于特征序列的“梯状”图 | 第33-35页 |
| ·有向图表示 | 第35-38页 |
| 2 生物序列的数值刻画 | 第38-60页 |
| ·引言 | 第38-40页 |
| ·伪迹 | 第40-43页 |
| ·ALE-指标 | 第43-51页 |
| ·ALE-指标 | 第43-44页 |
| ·性质 | 第44-47页 |
| ·应用 | 第47-51页 |
| ·上三角矩阵表示 | 第51-54页 |
| ·序列不变量的相容性 | 第52页 |
| ·有向图及上三角矩阵的应用 | 第52-54页 |
| ·正规化相对熵 | 第54-60页 |
| ·定义 | 第55-56页 |
| ·应用 | 第56-60页 |
| 3 逻辑序列与序列复杂度 | 第60-78页 |
| ·DNA序列的逻辑表示 | 第60-65页 |
| ·逻辑表示同其它表示的比较 | 第61-64页 |
| ·逻辑序列的S／S矩阵及其压缩矩阵 | 第64-65页 |
| ·蛋白质序列的逻辑表示 | 第65-70页 |
| ·蛋白质序列的逻辑表示 | 第66-68页 |
| ·应用 | 第68-70页 |
| ·LZ复杂度及其应用 | 第70-76页 |
| ·有限序列的LZ复杂度 | 第70-71页 |
| ·基于LZ复杂度的RNA二级结构相似性分析 | 第71-74页 |
| ·广义LZ复杂度及其应用 | 第74-76页 |
| ·小结 | 第76-78页 |
| 4 蛋白质编码基因识别 | 第78-88页 |
| ·引言 | 第78-80页 |
| ·DNA序列基于正规化相对熵的数值刻画 | 第80页 |
| ·Fisher线性判别法 | 第80-81页 |
| ·算法的评估 | 第81-83页 |
| ·敏感度、特异性和准确度的定义 | 第81-82页 |
| ·算法的评估 | 第82-83页 |
| ·识别酿酒酵母基因组第2-6类中的基因 | 第83-88页 |
| 参考文献 | 第88-96页 |
| 读博期间发表、完成论文及获奖情况 | 第96-97页 |
| 创新点摘要 | 第97-98页 |
| 致谢 | 第98-99页 |
| 附注 | 第99-100页 |
| 大连理工大学学位论文版权使用授权书 | 第100页 |
