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南极嗜冷菌Colwellia sp.NJ341产适冷蛋白酶及低温适应性的研究

独创声明第1页
学位论文版权使用授权书第3-11页
摘要第11-14页
Abstract第14-18页
1 前言第18-40页
   ·南极微生物多样性第18-20页
   ·南极微生物活性物质的研究第20-22页
   ·南极微生物适冷酶研究进展第22-27页
     ·南极微生物适冷酶种类第22页
     ·适冷酶催化特性第22-23页
     ·重组适冷酶第23-24页
     ·适冷酶的结构特性第24-26页
     ·低温催化与酶分子结构第26-27页
   ·适冷蛋白酶的研究进展第27-34页
     ·蛋白酶的分类第27-28页
     ·适冷蛋白酶来源与种类第28-30页
     ·适冷蛋白酶酶学特征第30-31页
       ·低温促进微生物分泌更多蛋白酶第30页
       ·适冷蛋白酶的最适作用温度低第30页
       ·适冷蛋白酶的热稳定性差第30-31页
       ·适冷蛋白酶的活化能低第31页
     ·重组适冷蛋白酶第31页
     ·适冷蛋白酶的结构特征第31-33页
     ·适冷蛋白酶的应用第33-34页
   ·低温微生物的适冷机制第34-38页
     ·适冷酶的分泌第34-35页
     ·调节膜脂组分第35-36页
     ·低温微生物的适冷代谢机制第36页
     ·冷激蛋白和抗冻蛋白的合成第36-37页
     ·其它细胞可溶性物质第37-38页
   ·我国低温微生物和适冷酶的研究状况第38-40页
2 南极微生物产低温蛋白酶菌株的筛选第40-51页
   ·材料与方法第40-43页
     ·材料第40-41页
     ·培养基第41页
     ·菌株培养和胞外蛋白酶提取第41页
     ·产低温蛋白酶菌株筛选第41页
     ·蛋白酶活力测定第41-42页
     ·菌株生长和产酶曲线的测定第42页
     ·温度对菌株生长和产酶影响的测定第42页
     ·蛋白酶部分酶活特性的测定第42页
       ·蛋白酶最适pH 测定第42页
       ·蛋白酶最适温度测定第42页
       ·蛋白酶的热稳定性测定第42页
     ·蛋白酶酶谱(Zymograms)第42-43页
   ·结果第43-48页
     ·南极微生物产蛋白酶菌株的筛选第43-44页
     ·4株产蛋白酶南极嗜冷菌生长及部分酶学特性第44-47页
       ·温度对4 株产蛋白酶南极嗜冷菌生长及产蛋白酶的影响第45页
       ·4 株产蛋白酶南极嗜冷菌生长和产酶曲线第45-46页
       ·4 株南极嗜冷菌分泌蛋白酶的酶学特性第46-47页
     ·4 株南极嗜冷菌产蛋白酶酶谱分析第47-48页
   ·讨论第48-49页
   ·结语第49-51页
3 5 株产蛋白酶南极嗜冷菌的16S rRNA 分子鉴定第51-67页
   ·材料与方法第51-57页
     ·材料第51-52页
     ·5 株南极嗜冷菌16S rRNA 基因序列测定第52-56页
       ·细菌培养及菌体收集第52页
       ·菌株基因组DNA 的提取(CTAB 方法)第52页
       ·DNA 电泳鉴定、纯度及浓度的测定第52页
       ·引物设计第52-53页
       ·PCR 扩增第53页
       ·PCR 产物的纯化第53-54页
       ·T-A 克隆第54页
       ·大肠杆菌感受态的制备及转化第54页
       ·阳性克隆的筛选第54-55页
       ·质粒的酶切检验第55页
       ·序列分析及数据处理第55-56页
     ·菌株NJ341 的表型特征第56-57页
       ·形态学特征第56页
       ·菌种鉴定第56页
       ·脂肪酸分析第56-57页
   ·结果第57-64页
     ·16S rRNA 基因的PCR 扩增及T-A 克隆、测序结果第57-60页
     ·5 株产蛋白酶嗜冷菌16S rRNA 基因序列和系统发育学分析第60-62页
     ·菌株NJ341 的表型特征鉴定第62-64页
   ·讨论第64-65页
   ·结语第65-67页
4 南极嗜冷菌Colwellia sp.NJ341 产适冷蛋白酶的优化培养第67-85页
   ·材料与方法第68-70页
     ·材料第68页
     ·嗜冷菌C.sp.NJ341 产适冷蛋白酶的优化培养第68-69页
       ·通气量对嗜冷菌C.sp.NJ341 生长和产蛋白酶影响的测定第68页
       ·初始pH 值对嗜冷菌C.sp.NJ341 生长和产蛋白酶影响的测定第68页
       ·盐度对嗜冷菌C.sp.NJ341 生长和产蛋白酶影响的测定第68页
       ·最适氮源和碳源种类的筛选第68页
       ·金属离子和表面活性剂对嗜冷菌C.sp.NJ341 产蛋白酶影响的测定第68-69页
       ·氨基酸对嗜冷菌C.sp.NJ341 产蛋白酶影响的测定第69页
     ·响应面分析法(RSM)实验设计第69-70页
     ·菌株的生长和产蛋白酶曲线的测定第70页
     ·产酶稳定性试验第70页
   ·结果第70-80页
     ·通气量和初始pH 值对嗜冷菌C.sp.NJ341 生长和产酶的影响第70页
     ·盐度对嗜冷菌C.sp.NJ341 生长和产酶的影响第70-71页
     ·氮源和碳源对嗜冷菌C.sp.NJ341 产酶的影响第71-73页
     ·金属离子、表面活性剂和氨基酸对嗜冷菌C.sp.NJ341 产酶的影响第73页
     ·利用响应面法对嗜冷菌C.sp.NJ341 产蛋白酶优化培养第73-79页
     ·嗜冷菌C.sp.NJ341 的生长和产蛋白酶曲线第79页
     ·嗜冷菌C.sp.NJ341 产蛋白酶稳定性第79-80页
   ·讨论第80-83页
     ·氮源对嗜冷菌C.sp.NJ341 产蛋白酶的影响第80-81页
     ·碳源对嗜冷菌C.sp.NJ341 产蛋白酶的影响第81页
     ·盐度对嗜冷菌C.sp.NJ341 产蛋白酶的影响第81-82页
     ·利用响应面法对嗜冷菌C.sp.NJ341 产蛋白酶优化条件第82-83页
   ·结语第83-85页
5 南极嗜冷菌Colwellia sp.NJ341 产适冷蛋白酶的分离纯化第85-98页
   ·材料与方法第85-89页
     ·材料第85-86页
     ·培养基与培养第86页
     ·纯化方法第86-87页
       ·硫酸铵盐析第86页
       ·DEAE-Sephadex A50 柱层析第86-87页
       ·Sephadex G-75 柱层析第87页
       ·DEAE-Sepharose Fast Folw 柱层析第87页
     ·蛋白质含量的测定第87页
     ·蛋白质的电泳第87页
     ·蛋白酶酶谱(Zymograms)第87-88页
     ·高效液相色谱(HPLC)对蛋白酶纯度的鉴定第88页
     ·MALDI-TOF MS 对纯化蛋白酶的分子量测定第88页
     ·纯化蛋白酶的肽指纹图谱鉴定第88-89页
   ·结果第89-94页
     ·适冷蛋白酶的纯化第89-92页
       ·硫酸铵沉淀第89页
       ·DEAE-Sephadex A50 离子交换第89页
       ·Sephadex G-75 凝胶过滤第89-90页
       ·DEAE-Sepharose Fast Flow 离子交换第90-92页
     ·HPLC 对纯化后蛋白酶纯度的鉴定结果第92-93页
     ·蛋白酶的分子量第93页
     ·纯化后蛋白酶的肽指纹图谱分析第93-94页
   ·讨论第94-97页
     ·适冷蛋白酶的纯化第94-96页
     ·适冷蛋白酶分子量测定及肽指纹图谱分析第96-97页
   ·结语第97-98页
6 南极嗜冷菌Colwellia sp.NJ341 适冷蛋白酶酶学性质的研究第98-111页
   ·材料和方法第98-100页
     ·材料第98页
     ·方法第98-100页
       ·蛋白酶活力的测定第98页
       ·不同温度下蛋白酶活力的测定第98-99页
       ·不同pH 值下蛋白酶活力的测定第99页
       ·不同NaCl 浓度下蛋白酶的活力的测定第99页
       ·金属离子、表面活性剂和抑制剂等物质对蛋白酶活力影响的测定第99页
       ·蛋白酶动力学常数测定第99-100页
       ·蛋白酶酶解效果的测定第100页
   ·结果第100-105页
     ·不同温度下嗜冷菌C.sp.NJ341 的蛋白酶活力第100-101页
     ·不同pH 下嗜冷菌C.sp.NJ341 蛋白酶的活力第101-102页
     ·不同NaCl 浓度下嗜冷菌C.sp.NJ341 蛋白酶的活力第102-103页
     ·抑制剂和金属离子对嗜冷菌C.sp.NJ341 蛋白酶的影响结果第103-104页
     ·嗜冷菌C.sp.NJ341 蛋白酶的动力学性质第104页
     ·嗜冷菌C.sp.NJ341 蛋白酶酶解效果第104-105页
   ·讨论第105-109页
     ·温度对嗜冷菌C.sp.NJ341 蛋白酶的影响第105-107页
     ·pH 对嗜冷菌C.sp.NJ341 蛋白酶的影响第107页
     ·盐度对嗜冷菌C.sp.NJ341 蛋白酶的影响第107页
     ·抑制剂和金属离子对嗜冷菌C.sp.NJ341 蛋白酶的影响第107-108页
     ·嗜冷菌C.sp.NJ341 适冷蛋白酶动力学常数第108-109页
     ·嗜冷菌C.sp.NJ341 适冷蛋白酶酶解效果第109页
   ·结语第109-111页
7 南极嗜冷菌Colwellia sp.NJ341 低温适应性的研究第111-129页
   ·材料与方法第111-116页
     ·材料与培养基第111页
     ·温度设定第111-112页
     ·菌株的生长测定第112页
     ·细胞内蛋白质含量的测定第112页
     ·蛋白质样品的制备第112页
     ·SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳分离第112页
     ·双向凝胶电泳分离第112-114页
       ·第一向等电聚焦(Isoelectric focusing)第113页
       ·IPG 胶条的平衡第113-114页
       ·第二向SDS-PAGE第114页
       ·蛋白质点的采集与分析第114页
     ·质谱样品的制备和质谱鉴定第114-115页
       ·Coomassie Stained 胶内消化第114-115页
       ·质谱分析第115页
       ·数据的分析和比对第115页
     ·谷胱甘肽硫转移酶(GST)活力的测定第115-116页
     ·丙二醛(MDA)含量的测定第116页
     ·细胞脂肪酸的分析第116页
   ·结果第116-124页
     ·不同温度下嗜冷菌C.sp.NJ341 生长和细胞内蛋白质含量第116-117页
     ·不同温度下嗜冷菌C.sp.NJ341 细胞内蛋白表达的SDS-PAGE第117页
     ·嗜冷菌C.sp.NJ341 细胞内蛋白质双向电泳第117-118页
     ·不同温度下嗜冷菌C.sp.NJ341 细胞内蛋白表达的双向电泳第118-121页
     ·差异蛋白点a 和c 的鉴定结果第121-122页
     ·不同温度下嗜冷菌C.sp.NJ341GST 活力第122页
     ·不同温度下嗜冷菌C.sp.NJ341MDA 含量第122-123页
     ·不同温度下嗜冷菌C.sp.NJ341 脂肪酸含量第123-124页
   ·讨论第124-128页
     ·温度对嗜冷菌C.sp.NJ341 蛋白质含量的影响第124-125页
     ·冷激蛋白与嗜冷菌C.sp.NJ341 低温适应性关系第125-126页
     ·谷胱甘肽硫转移酶与嗜冷菌C.sp.NJ341 低温适应性关系第126-127页
     ·温度对嗜冷菌C.sp.NJ341 脂肪酸含量的影响第127-128页
   ·结语第128-129页
8 结论第129-133页
   ·南极微生物产适冷蛋白酶菌株的筛选第129页
   ·5 株南极微生物产蛋白酶菌株的16S rRNA 分子鉴定第129-130页
   ·南极嗜冷菌C.sp.NJ341 产适冷蛋白酶发酵优化培养第130页
   ·南极嗜冷菌C.sp.NJ3411 产适冷蛋白酶的分离纯化第130页
   ·南极嗜冷菌C.sp.NJ341 适冷蛋白酶的酶学性质第130-131页
   ·南极嗜冷菌C.sp.NJ341 对低温的适应性第131-133页
参考文献第133-151页
攻读博士期间发表文章第151-153页
致谢第153页

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