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22周孕龄人胎肝转录组及SARS-CoV(BJ-01)基因组的生物信息学研究

名词缩略语第1-7页
中文摘要第7-9页
ABSTRACT第9-12页
前言第12-18页
第一章、22周孕龄人胎肝EST预处理、基因鉴定和聚类第18-38页
 1 EST预处理第18-24页
   ·方法比较第18-23页
   ·结果选择第23页
   ·EST预处理结果及分析第23-24页
 2 EST聚类、鉴定及丰度统计方法第24-38页
   ·分析方法及标准第24-31页
   ·结果及分析第31-38页
第二章、功能已知EST分类及表达谱比较第38-51页
 1 分类第38-45页
   ·分类体系第38-39页
   ·分类结果第39-45页
 2 表达谱比较第45-49页
   ·本室人胎肝EST表达谱与芯片中人胎肝表达谱比较第45-46页
   ·芯片中五种组织表达谱比较第46-49页
 3 五种组织关系分析第49-51页
第三章、功能未知EST拼接、验证及功能推测第51-72页
 1 EST拼接及验证第51-65页
   ·EST拼接第51-55页
   ·拼接后验证体系第55-60页
   ·开放阅读框架(ORF)的获得与验证第60-61页
   ·流程图及说明第61-62页
   ·结果第62-64页
   ·讨论第64-65页
 2 未知基因功能推测第65-72页
   ·分析体系第65-69页
   ·结果第69-71页
   ·讨论第71-72页
第四章、转录组数据库建立及质谱肽段鉴定体系第72-81页
 1 22周孕龄人胎肝转录组数据库第72-75页
   ·功能已知基因数据库框架第72-73页
   ·功能未知基因数据库框架第73-75页
 2 蛋白质质谱鉴定体系第75-81页
   ·流程图第75页
   ·质谱鉴定技术体系第75-77页
   ·PMF数据库的建立第77页
   ·蛋白质鉴定结果第77-81页
第五章、SARS-CoV(BJ01)基因预测及功能推测第81-91页
 1 研究进展第81-83页
   ·基因组测序进展第81-82页
   ·文献中基因数目变化第82页
   ·SARS-CoV基因预测方法进展及不足第82-83页
 2 材料及方法第83页
 3 研究结果第83-88页
   ·预测得到的新基因及其物理化学性质和二级结构第83页
   ·可能的新基因同源性分析第83-88页
 4 讨论第88-91页
全文总结第91-94页
附件第94-95页
参考文献第95-105页
综述第105-118页
发表文章第118-120页
致谢第120页

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