| 中文摘要 | 第1-6页 |
| 英文摘要 | 第6-11页 |
| 1 引言 | 第11-28页 |
| 1．1 植物多倍体起源与分子进化的研究进展 | 第11-23页 |
| 1．1．1 异源多倍体植物起源 | 第12-16页 |
| 1．1．2 异源多倍体植物基因组进化 | 第16-23页 |
| 1．2 分子生物学在植物进化研究中的应用 | 第23页 |
| 1．3 山羊草属植物的研究概况 | 第23-26页 |
| 1．4 本研究的意义和目的 | 第26-28页 |
| 1．4．1 用ISSR分子标记对基因组进化进行研究 | 第27页 |
| 1．4．2 Au反转录转座子片段进化的研究 | 第27-28页 |
| 2 材料和方法 | 第28-39页 |
| 2．1 实验材料 | 第28页 |
| 2．1．1 ISSR实验材料 | 第28-30页 |
| 2．1．2 Au反转录转座子片段克隆及测序实验材料 | 第30-28页 |
| 2．2 试剂与仪器 | 第28-32页 |
| 2．3 实验方法 | 第32-39页 |
| 2．3．1 植物总DNA的提取 | 第32页 |
| 2．3．2 ISSR实验的PCR反应体系和程序 | 第32-33页 |
| 2．3．3 ISSR引物的筛选 | 第33页 |
| 2．3．4 扩增产物的电泳分离和记录 | 第33页 |
| 2．3．5 数据处理 | 第33-34页 |
| 2．3．6 Au反转录转座子测序实验的PCR反应体系和程序 | 第34-35页 |
| 2．3．7 PCR产物的纯化 | 第35-36页 |
| 2．3．8 液体LB培养基的配制 | 第36页 |
| 2．3．9 连接反应体系 | 第36页 |
| 2．3．10 制备感受态细胞 | 第36-37页 |
| 2．3．11 转化到大肠杆菌 | 第37-38页 |
| 2．3．12 双酶切反应体系 | 第38页 |
| 2．3．13 测序 | 第38页 |
| 2．3．14 相似性分析 | 第38页 |
| 2．3．15 聚类分析 | 第38页 |
| 2．3．16 Jukes-Cantor值 | 第38-39页 |
| 3 实验结果 | 第39-53页 |
| 3．1 植物总DNA的提取 | 第39页 |
| 3．2 ISSR实验结果 | 第39-44页 |
| 3．2．1 引物选择 | 第39-42页 |
| 3．2．2 遗传相似性 | 第42页 |
| 3．2．3 聚类分析 | 第42-44页 |
| 3．3 Au反转录转座子测序实验结果 | 第44-53页 |
| 3．3．1 Au反转录转座子PCR扩增实验结果 | 第44-45页 |
| 3．3．2 部分物种的Au反转录转座子质粒双酶切实验结果 | 第45页 |
| 3．3．3 山羊草中Au家族元件的进化特征 | 第45-46页 |
| 3．3．4 遗传相似性分析 | 第46页 |
| 3．3．5 聚类分析 | 第46-48页 |
| 3．3．6 物种特异的序列 | 第48-53页 |
| 4 讨论 | 第53-59页 |
| 4．1 山羊草属异源多倍体基因组的进化 | 第53-55页 |
| 4．2 山羊草属Au反转录转座子家族成员的进化特征 | 第55-59页 |
| 参考文献 | 第59-72页 |
| 在读期间发表和投稿论文 | 第72-73页 |
| 致谢 | 第73页 |
