| 中文摘要 | 第1-6页 |
| 英文摘要 | 第6-9页 |
| 第一章 引言 | 第9-16页 |
| ·蛋白质折叠 | 第9-11页 |
| ·蛋白质结构预测 | 第11-13页 |
| ·蛋白质结构与功能的关系和分子设计 | 第13-14页 |
| ·计算工具与生物信息学数据源 | 第14-15页 |
| ·研究设想 | 第15-16页 |
| 第二章 以排斥作用势能预测蛋白质折叠速率(1)：类Lennard-Jones 方程 | 第16-25页 |
| ·材料与方法 | 第16-22页 |
| ·各种类型蛋白质的折叠速率常数 | 第16-18页 |
| ·蛋白质结构中的原子坐标 | 第18-19页 |
| ·α碳原子之间的距离矩阵 | 第19-20页 |
| ·折叠势能 | 第20-21页 |
| ·折叠速率是势能的函数 | 第21页 |
| ·指数m 的确定 | 第21-22页 |
| ·结果与讨论 | 第22-25页 |
| 第三章 以排斥作用势能预测蛋白质折叠速率(2)：类 Morse 方程 | 第25-29页 |
| ·材料与方法 | 第25-28页 |
| ·各种类型蛋白质的折叠速率常数 | 第25页 |
| ·蛋白质结构中的原子坐标 | 第25页 |
| ·α碳原子之间的距离矩阵 | 第25页 |
| ·折叠势能 | 第25-26页 |
| ·折叠速率是势能的函数 | 第26-27页 |
| ·系数A 的确定 | 第27-28页 |
| ·结果与讨论 | 第28-29页 |
| 第四章 用小波分析从蛋白质结构中分离出三级结构 | 第29-38页 |
| ·材料与方法 | 第29-35页 |
| ·蛋白质的选择 | 第29-30页 |
| ·蛋白质结构简化为主链结构 | 第30-31页 |
| ·以小波分析拆解蛋白质结构 | 第31-35页 |
| ·三级结构的重建 | 第35页 |
| ·结果与讨论 | 第35-38页 |
| 第五章 基于配体叠合的蛋白质结合部位结构多样性的分析 | 第38-48页 |
| ·材料与方法 | 第38-40页 |
| ·与原卟啉配体结合，序列全同性<4096的蛋白质的检索 | 第38-39页 |
| ·蛋白质结构数据的提取 | 第39-40页 |
| ·蛋白质结合位点和配体的原子坐标的确定 | 第40页 |
| ·结果与讨论 | 第40-48页 |
| 第六章 总结论 | 第48-49页 |
| 参考文献 | 第49-54页 |
| 致谢 | 第54-55页 |
| 附录一 指数m值对蛋白质折叠速率与势能相关系数的影响 | 第55-63页 |
| 附录二 系数A值对蛋白质折叠速率与势能相关系数的影响 | 第63-68页 |
| 附录三 20 种标准氨基酸中英文名称一览表 | 第68-69页 |
| 附录四 利用Matlab求出坐标变换系数的程序 | 第69-71页 |
| 附录五 利用Matlab软件对蛋白质-配体复合物实行坐标 变换的程序 | 第71-73页 |
